布莱凯特黑牛心脏脂肪酸结合蛋白基因单核苷酸多态性的研究

›› 2013, Vol. 40 ›› Issue (11): 42-45.

布莱凯特黑牛心脏脂肪酸结合蛋白基因单核苷酸多态性的研究

赵仕全^1,2, 董雅娟^1,2,3, 柏学进^1,2,3, 牛召珊^1,2, 杨莉^1,2, 张新浩^1,2

1. 青岛农业大学动物胚胎工程中心, 山东青岛 266109;
2. 山东省黑牛繁育工程技术研究中心, 山东青岛 266109;
3. 山东布莱凯特黑牛科技股份有限公司, 山东淄博 256306

收稿日期:2013-04-01 出版日期:2013-11-20 发布日期:2013-12-19
通讯作者: 董雅娟 E-mail:etcenter@126.com
作者简介:赵仕全(1986-),男,山东人,硕士生,研究方向:分子遗传育种。
基金资助:
山东省良种工程(2010LZ012-03)。

Study on Single Nucleotide Polymorphisms of H-FABP Gene in Black Cattle

ZHAO Shi-quan^1,2, DONG Ya-juan^1,2,3, BAI Xue-jin^1,2,3, NIU Zhao-shan^1,2, YANG Li^1,2, ZHANG Xin-hao^1,2

1. Center of Animal Embryo Engineering of Qingdao Agricultural University, Qingdao 266109, China;
2. Engineering Technology Research Center of Shandong Black Cattle Reproduction, Qingdao 266109, China;
3. Shandong Black Cattle Science & Technology Co., Ltd., Zibo 256306, China

Received:2013-04-01 Online:2013-11-20 Published:2013-12-19

摘要/Abstract

摘要： 利用PCR-SSCP方法测定96头布莱凯特黑牛H-FABP基因外显子2和内含子2的部分序列多态性,并对含有多态序列的片段进行了序列分析。结果表明,引物1、3的扩增序列不存在多态性,引物2、4的扩增序列存在多态性;引物2在内含子第323位点处存在G→A突变,在群体中产生了AA、AB、BB 3种基因型,基因型频率分别为0.448、0.146、0.406,多态信息含量(PIC)为0.375,属于中度多态(0.25<PIC<0.5),经χ²检验该位点基因型频率不处于Hardy-Weinberg平衡状态;引物4在内含子2第872位点处存在C→G的突变,产生了HH、Hh、hh3种基因型,基因型频率分别为0.104、0.417、0.479,多态信息含量(PIC)为0.337,为中度多态(0.25<PIC<0.5),经χ²检验该位点基因型频率达到Hardy-Weinberg平衡状态。

关键词: 布莱凯特黑牛; 心脏脂肪酸结合蛋白基因; 单核苷酸多态性

Abstract: The single nucleotide polymorphisms(SNPs) in exon 2 and part of intron 2 of H-FABP gene in 96 individuals from Black cattle were detected by PCR-SSCP methods and sequencing analysis technique. The results showed that there were two SNPs in intron 2 at primer 2 and primer 4, no variance at primer 1 and primer 3. Three genotypes (AA, AB, BB) determined by SNP at 323 (G→A) were detected using primer 2.Their genotype frequencies were 0.448, 0.146, 0.406, which were no in Hardy-Weinberg equilibrium with chi-aquare analysis. Statistical analysis revealed an intermediate polymorphism information content (PIC) in Black cattle. Three genotypes (HH, Hh, hh) determined by SNP at 872 (C→G) were detected using primer 4.Their genotype frequencies were 0.104, 0.417, 0.479, which were in Hardy-Weinberg equilibrium with chi-aquare analysis. Statistical analysis revealed an intermediate polymorphism information content (PIC) in Black cattle.

Key words: Black cattle; H-FABP gene; SNP

中图分类号:

Q349⁺.53

赵仕全, 董雅娟, 柏学进, 牛召珊, 杨莉, 张新浩. 布莱凯特黑牛心脏脂肪酸结合蛋白基因单核苷酸多态性的研究[J]. , 2013, 40(11): 42-45.

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