利用miRNA芯片筛选不同月龄香猪肝脏中差异表达的miRNA

doi:10.16431/j.cnki.1671-7236.2017.03.008

《中国畜牧兽医》 ›› 2017, Vol. 44 ›› Issue (3): 673-678.doi: 10.16431/j.cnki.1671-7236.2017.03.008

利用miRNA芯片筛选不同月龄香猪肝脏中差异表达的miRNA

李升¹, 许亚楠¹, 牛熙¹, 冉雪琴²

1. 贵州大学农业生物工程研究院, 贵阳 550025;
2. 贵州大学动物科学学院, 贵阳 550025

收稿日期:2016-09-07 出版日期:2017-03-20 发布日期:2017-03-21
通讯作者: 李升 E-mail:listen318@163.com
作者简介:李升(1982-),男,重庆人,博士,副教授,研究方向:分子生物学与基因工程
基金资助:
国家自然科学基金（31401091）；贵州省科学技术基金（黔科合J字[2013]2100号）

Determine the Different Expression miRNAs in Different Months Old Xiang Pigs by miRNA Microarray

LI Sheng¹, XU Ya-nan¹, NIU Xi¹, RAN Xue-qin²

1. Institute of Agro-bio Engineering, Guizhou University, Guiyang 550025, China;
2. Faculty of Animal Science, Guizhou University, Guiyang 550025, China

Received:2016-09-07 Online:2017-03-20 Published:2017-03-21

摘要/Abstract

摘要：

为研究miRNA在香猪发育时期的调控功能，试验对3和7月龄香猪肝脏组织中存在表达差异的miRNA进行了筛选。提取3和7月龄香猪肝脏组织总RNA，通过与miRNA芯片杂交，经统计学分析，以变化倍数≥2倍（P<0.05）为阈值，筛选3和7月龄香猪肝脏中表达丰度差异的miRNA，并运用实时荧光定量PCR进行验证。结果发现，与3月龄相比，7月龄香猪肝脏中有11条miRNA表达下调和9条miRNA表达上调，下调倍数最多的是miR-27b，上调倍数最多的是miR-155。对选取的4条差异表达的miRNA进行实时荧光定量PCR反应，结果显示，4条miRNA表达变化趋势与芯片结果一致。本研究结果表明，不同月龄香猪肝脏中的miRNA表达丰度有差异，其中一些可能参与了机体生长发育时期肝细胞的脂肪代谢过程。

关键词: miRNA表达谱; 香猪; 肝脏

Abstract:

To determine the roles of miRNA in the developmental stages of Xiang pig,we investigated the miRNA expression patterns in different months old of Xiang pigs.The total RNA from 3 and 7 months old of Xiang pigs were collected separately. Then,the total RNA were hybridized with the miRNA microarray and the threshold (fold-change>2, P<0.05) were used to identify the different expression miRNA. The quantitative Real-time PCR was performed to verify the microarray result. Compared to the 3 months old group,there were 11 miRNA down regulated and 9 miRNA were up regulated in the 7 months old group. The lowest down regulated miRNA was miR-27b whereas the highest up regulated one was miR-155.The result of quantitative Real-time PCR consistented with the microarray result. The result suggested that some of the dysregulated expression of miRNA might participate in the lipid metabolism in hepatic cells.

Key words: miRNA expression profile; Xiang pig; liver

中图分类号:

S828

李升, 许亚楠, 牛熙, 冉雪琴. 利用miRNA芯片筛选不同月龄香猪肝脏中差异表达的miRNA[J]. 《中国畜牧兽医》, 2017, 44(3): 673-678.

LI Sheng, XU Ya-nan, NIU Xi, RAN Xue-qin. Determine the Different Expression miRNAs in Different Months Old Xiang Pigs by miRNA Microarray[J]. , 2017, 44(3): 673-678.

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利用miRNA芯片筛选不同月龄香猪肝脏中差异表达的miRNA

Determine the Different Expression miRNAs in Different Months Old Xiang Pigs by miRNA Microarray

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