线虫fat-1基因密码子优化设计

›› 2010, Vol. 37 ›› Issue (10): 68-71.

线虫fat-1基因密码子优化设计

杜新华1，赵志辉2，于浩2，李俊雅1，高雪1，许尚忠1

（1.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所，农业部畜禽遗传资源与利用重点开放实验室，北京 100193；2.吉林大学畜牧兽医学院，长春 130062）

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2010-10-20 发布日期:2010-10-20
通讯作者: 许尚忠

Codon Optimization of fat-1 Gene from Caenorhabditis elegan

DU Xin-hua1,ZHAO Zhi-hui2,YU Hao2,LI Jun-ya1,GAO Xue1,XU Shang-zhong1

(1.Key Laboratory of Farm Animal Genetic Resources and Utilization of Ministry of Agriculture, Institute of Animal Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100193, China;2.Husbandry and Veterinary College, Jilin University, Changchun 130062, China)

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2010-10-20 Published:2010-10-20
Contact: XU Shang-zhong

摘要/Abstract

摘要： 本研究旨在优化线虫fat-1基因，使其在牛肌肉组织中高效表达，为进一步生产fat-1转基因肉牛提供目的基因。试验在不改变fat-1基因编码氨基酸序列的基础上，参考了11个牛肌肉蛋白相关基因的密码子使用频率，对fat-1基因进行了密码子优化。结果发现，共改变了65个碱基，涉及65个密码子、7个氨基酸，约占fat-1基因总碱基数的5.38%，G+C含量从45.08%上升到50.04%，且分布均匀利于基因的表达。结构预测结果显示，该优化后的基因能够在牛肌肉中高效表达。

关键词: fat-1基因; 密码子优化; 牛; 肌肉蛋白

Abstract: The objective of his study was to optimize the fat-1 condon from caenorhaditis elean. In this study, on the basis of no changing the amino acid sequence of fat-1 gene, we optimized the condon of fat-1 gene based on the codon preference of bovine muscle protein gene, in order to make fat-1 gene had high-level expression in cattle muscle. It could make a preparation for the production of fat-1 transgenic cattle. We changed 65 bases, which concering 65 codons and 7 amino acid. It accounted 5.38％ for all the fat-1 gene bases. G+C contents increased from 45.08% to 50.04% and distributed uniformly, which was beneficial to the expression of the gene. The prediction result of the RNA secondary structure showed that the optimized gene could have high-level expression in cattle muscle.

Key words: fat-1 gene; codon optimization; cattle; muscle protein

中图分类号:

Q755

杜新华;赵志辉;于浩;李俊雅;高雪;许尚忠. 线虫fat-1基因密码子优化设计[J]. , 2010, 37(10): 68-71.

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