鸭多巴胺受体D1基因CDS区多态性与生长性状的关联性分析

中国畜牧兽医

鸭多巴胺受体D1基因CDS区多态性与生长性状的关联性分析

潘兰兵^1,2，张依裕^1,2，林家栋^1,2，李思^1,2，李万贵^1,2,杨永强^1,2，刘若余^1,2

(1.贵州大学动物科学学院，贵州贵阳 550025；2.高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室，贵州贵阳 550025)

出版日期:2014-01-20 发布日期:2014-02-27
通讯作者: 张依裕（1976—），男，博士，副教授，从事动物遗传资源保护与利用研究。E-mail:zyy8yyc@163.com 林家栋（1963—），男，硕士，教授，从事动物遗传学研究。E-mail:linjiadong2008@163.com
作者简介:潘兰兵（1986—），男，贵州人，硕士生，研究方向：动物遗传育种。
基金资助:
贵州大学博士基金［贵大人基合字（2010）037号］；国家自然科学基金(31160453)；贵州省自然科学基金（黔科合J字［2011］2220号）。

Associations of Polymorphisms of DRD1 Gene CDS Region with Growth Traits in Duck

PAN Lan-bing^1,2,ZHANG Yi-yu^1,2,LIN Jia-dong^1,2,LI Si^1,2,LI Wan-gui^1,2,YANG Yong-qiang^1,2,LIU Ruo-yu^1,2

(1.College of Animal Science,Guizhou University,Guiyang 550025,China;2.Key Laboratory of Animal Genetics, Breeding and Reproduction in the Plateau Mountainous Region, Ministry of Education, Guiyang 550025,China)

Online:2014-01-20 Published:2014-02-27

摘要/Abstract

摘要： 本研究采用PCR-SSCP法与DNA直接测序技术相结合对兴义鸭和樱桃谷鸭多巴胺受体D1 (dopamine receptor D1,DRD1)基因编码序列(coding sequence，CDS)区130－587 bp区域的多态性进行检测，并分析其多态性对樱桃谷鸭生长性状的影响。结果表明，在樱桃谷鸭和兴义鸭DRD1基因编码区130－587 bp区域内均检测到3种基因型：AA、BB和AB，2个等位基因：A和B；AA基因型均为优势基因型，频率分别为0.7416和0.5643，等位基因A均为优势等位基因，频率分别是0.8539和0.7204；多态信息含量分别为0.2184和0.3217，分别处于低度多态和中度多态位点，樱桃谷鸭群体中该座位基因型分布处于Hardy-Weinberg平衡（P>0.05），兴义鸭群体则偏离了Hardy-Weinberg平衡（P<0.05）；序列比对发现2个SNPs位点，其中c.189 T＞C为同义突变，c.507 T＞A为错义突变，导致丝氨酸（S）变成精氨酸（R）。关联分析结果显示，BB基因型樱桃谷鸭个体的8周龄重和12周龄体斜长显著高于AB基因型（P<0.05），10周龄重、12周龄重和12周龄胸深显著高于AA和AB基因型（P<0.05）。研究结果揭示该多态座位可能是影响鸭生长性状的一个标记辅助选择位点。

关键词: 鸭; 多巴胺受体D1基因; 编码序列; PCR-SSCP; SNPs

Abstract: PCR-SSCP and DNA direct sequencing technology were used in this study to identify the polymorphisms of CDS 130—587 bp region of DRD1 gene in individuals of Cherry Valley duck and Xingyi duck, the association between SNPs and growth traits were also performed subsequently. The results showed that 2 alleles named A, B that resulted in 3 genotypes included AA, BB and AB respectively were confirmed in this study. AA genetype was predominant in two duck breeds with frequencies of 0.7416 and 0.5643, respectively, moreover, allele A was predominant compared to allele B for two duck breeds with frequencies of 0.8539 and 0.7204. The polymorphism information content (PIC) were 0.2184 and 0.3217 which belonged to low polymorphism and moderate polymorphism. Chi-square test demonstrated that the genotypes distribution of SNPs locus in the population of Cherry Valley duck was agreement with Hardy-Weinberg equilibrium (P>0.05) and deviated significantly from Hardy-Weinberg equilibrium (P<0.05) in the population of Xingyi duck. The results showed that two SNPs of c.189 T＞C and c.507 T＞A which belonged to synonymous mutation and missense mutation that resulted in the change from serine to arginine. Association analysis showed that the weight of 8 weeks and body length of 12 weeks of Cherry Valley duck for BB genotype individuals were significantly higher than AB genotype (P<0.05). Weight of 10 and 12 weeks and chest depth of 12 weeks of BB genotype individuals were significantly higher than AB and AA genotypes (P<0.05). Results disclosed that the SNPs locus might be an important marker of marker assisted breeding for growth trait of duck.

Key words: duck; DRD1 gene; CDS; PCR-SSCP; SNPs

潘兰兵，张依裕，林家栋，李思，李万贵，杨永强，刘若余. 鸭多巴胺受体D1基因CDS区多态性与生长性状的关联性分析[J]. 中国畜牧兽医.

PAN Lan-bing,ZHANG Yi-yu,LIN Jia-dong,LI Si,LI Wan-gui,YANG Yong-qiang,LIU Ruo-yu. Associations of Polymorphisms of DRD1 Gene CDS Region with Growth Traits in Duck[J]. .

参考文献

1 邓小英，郑芝田，叶嗣秋，等.实验性溃疡大鼠胃肠道单胺类物质含量的变化［J］.中国医学科学院学报，1996,18（3）:229～233.
2 王翠，李世军，李闯，等.鸭多巴胺受体1(DRD1)基因克隆与多态性检测［A］.中国畜牧兽医协会第十五次全国家禽学术讨论会论文集［C］.2011.
3 李凡，舒斯云，包新民，等.多巴胺受体的结构和功能［J］.中国神经科学杂志，2003，19（6）:405～406.
4 任二军，刘宗岳，赵子瑜，等. 蓝狐多巴胺受体D2基因部分序列的克隆测序［J］.中国畜牧兽医，2011，38(10):73～75.
5 徐海平，周敏，罗成龙，等.DRD1及DRD2基因多态性与鸡冠高和体重的相关性［J］.中国农业大学学报，2010，15(2):64～70.
6 曾春雨，杨志伟，吴丽娟，等.D3多巴胺受体基因敲除小鼠高血压产生机制的探讨［J］.中华心血管病杂志，2005，33(12)：1132～1136.
7 De Keyser J, De Backer J P, Vauquelin G, et al. The effect of aging on the D1 dopamine receptors in human frontal cortex［J］. Brain Res, 1990, 528(2):308～310.
8 Fung M M, Rana B K, Tang C M, et al. Dopamine D1 receptor (DRD1) genetic polymorphism:Pieiotropic effects on heritable renal traits［J］.Kidney Lnt,2009,76(10):1070～1080.
9 Novak G, LeBlanc M, Zai C, et al. Association of polymorphisms in the BDNF,DRD1 and DRD3 genes with tobacco smoking in schizophrenia［J］.Ann Hum Genet,2010,74(4):291～298.
10 Rybakowski J K, Borkowska A, Czerski P M, et al.An association study of dopamine receptors polymorphisms and the wisconsin card sorting test in schizophrenia［J］.J Neural Trans,2005,112(3):1575～1582.
11 Wang C，Li S, Li C, et al. Molecular cloning, expression profile, polymorphism and the genetic effects of the dopamine D1 receptor gene on duck reproductive traits［J］. Mol Biol Rep,2012,39(23):9239～9246.
12 Xu H, Shen X, Zhou M, et al.The genetic effects of the dopamine D1 receptor gene on chicken egg production and broodiness traits［J］.BMC Genetics,2010,8(11):17～19.
13 Youngren O M, Chaiseha Y, Halawani M E. Regulation of prolactin secretion by dopamine and vasoactive instinal peptide at the ievel of the pituitary in the turkey［J］. Neuroendocriolgy,2008,12(68):319～325.

[1]	焦琳琳, 成玉婷, 吴庆国, 吴双, 吴植, 朱善元, 钱莺娟. 鸭坦布苏病毒Capsid蛋白原核表达及多克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(6): 2395-2402.
[2]	余大新, 刘文静, 刘大鹏, 刘同, 张鹤, 盖凯, 李姝楠, 张贝贝, 侯水生, 周正奎. 鸭胸肌矿物元素含量全基因组关联分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1287-1295.
[3]	陶庆华, 黄彩云, 陈超, 刘威, 孙宁宁, 李昂. 白羽番鸭LIF基因克隆及其组织表达差异分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1296-1306.
[4]	谢守玉, 王睿敏, 崔鹏飞, 施开创, 韦显凯, 冯淑萍, 龙凤, 屈素洁, 陆文俊, 黄金山, 黄凤梅, 温新瑞, 尹彦文, 邓国华. 2株海鸭源H3亚型禽流感病毒全基因组分子特征分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1319-1328.
[5]	陈吉敏, 李辉煌, 赖连杰, 杨银华, 杨悦, 林瑞意. 鸭坦布苏病毒检测方法及疫苗研究进展[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1329-1339.
[6]	张鹤, 刘大鹏, 唐贺贺, 刘同, 余大新, 于思梦, 盖凯, 侯水生, 周正奎. 北京鸭和连城白鸭胸肌脂质组鉴定与分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(3): 904-912.
[7]	祝希辉, 李艳兰, 王志伟, 庞喆羽, 李玉保, 刘成, 司振书, 路建彪, 曹胜亮, 薛希娟. 1株鸭疫里默氏杆菌的全基因组测序及耐药性与遗传进化分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(3): 1140-1149.
[8]	程龙飞, 廖维连, 陈红梅, 江南松, 傅秋玲, 万春和, 刘荣昌, 施少华, 黄瑜, 傅光华. 宽谱鸭疫里默氏菌噬菌体筛选及生物学特性研究[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(3): 1169-1176.
[9]	陈栋, 张言浩, 张阳, 李森, 周祖涛, 李自力. 3株鸭疫里氏杆菌的分离鉴定与药敏试验[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(3): 1250-1258.
[10]	梁铭其, 陈伟, 张亚男, 夏伟光, 黄雪冰, 李凯潮, 郑春田, 王爽. 生物素对产蛋高峰期蛋鸭产蛋性能、蛋品质、血液生化指标、卵巢发育及胫骨性状的影响[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(2): 564-572.
[11]	刘珍妮, 雷小文, 李建军, 曾庆远, 谭东海, 钟云平, 张强, 谢华亮. 发酵脐橙粕对番鸭肠道形态结构、肠黏膜免疫功能和微生物多样性的影响[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(2): 573-585.
[12]	罗干, 邹宏, 任绍科, 吴春霞, 邹瑶, 娄银莹, 周洋, 程方俊, 郭建华. 鸭源致病性大肠杆菌O抗原与毒力基因检测及药敏试验[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(2): 713-721.
[13]	赵陆原, 邹晨浩, 曹久爱, 郭燕珊, 刘莉君, 占秀安, 林刚, 刘兵, 余东游. 复合有机微量元素减量添加对肉鸭血清生化、免疫功能和抗氧化能力的影响[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(1): 86-96.
[14]	徐景峨, 李婷, 陈汝佳, 余波, 张亚楠, 杨莉, 赵滨, 蒲龄. 鸭疫里氏杆菌二价灭活疫苗制备及免疫效力研究[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(1): 290-299.
[15]	张薇, 武华, 阴雅洁, 李松励, 侯绍华. 新型鸭呼肠孤病毒分离鉴定及其σC基因序列分析[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(9): 3520-3529.