猪红细胞生成素受体基因遗传变异分析

›› 2011, Vol. 38 ›› Issue (2): 125-127.

猪红细胞生成素受体基因遗传变异分析

张龙超，王立刚，赵克斌，李勇，颜华，王立贤

(中国农业科学院北京畜牧兽医研究所，北京 100193)

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2011-02-20 发布日期:2011-02-20

Genetic Variations in Porcine Erythropoietin Receptor Gene

ZHANG Long-chao, WANG Li-gang, ZHAO Ke-bin, LI Yong, YAN Hua, WANG Li-xian

(Institute of Animal Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100193, China)

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2011-02-20 Published:2011-02-20

摘要/Abstract

摘要：

根据GenBank中登录的猪红细胞生成素受体（erythropoictin receptor,EPOR）基因mRNA序列（登录号：AF274305）和其基因组序列（登录号：EU407778）设计8对引物，以10头北京黑猪和10头大白猪DNA混合池为模板，采用测序的方法研究猪EPOR全基因序列的遗传变异。研究结果发现，EPOR基因长约5.2 kb，含有1个5′UTR、8个外显子、7个内含子及1个3′UTR。经混合DNA池测序，共在内含子区发现9个SNP位点：g.705G＞T位于内含子1；g.1450C＞T 位于内含子2；g.2373C＞T 位于内含子4；g.2882C＞T、g.3035A＞G、g.3132A＞T、g.3295C＞T、g.3942C＞T、g.4106G＞A位于内含子6，为进一步研究EPOR基因与产仔性状的关联奠定了基础。

关键词: 猪; EPOR基因; 遗传变异

Abstract: In this study, 8 pair primers were designed based on erythropoietin receptor (EPOR) RNA (AF274305) and DNA (EU407778) sequences in porcine which were submitted on GenBank. Genetic variation was analyzed by sequencing using a DNA pool from 10 Beijing Black pigs and 10 Large white pigs. The results showed that the porcine EPOR gene contains one 5′untranslated region (UTR), eight exons, seven introns, and one 3′UTR, covering at least 5.2 kb of genomic DNA. 9 new single nucleotide polymorphisms (SNPs) were identified: g.705G＞T in intron 1, g.1450C＞T in intron 2, g.2373C＞T in intron 4, and g.2882C＞T, g.3035A＞G, g.3132A＞T, g.3295C＞T, g.3942C＞>T and g.4106G>A in intron 6.

Key words: pig; EPOR gene; genetic variation

中图分类号:

S813

张龙超;王立刚;赵克斌;李勇;颜华;王立贤. 猪红细胞生成素受体基因遗传变异分析[J]. , 2011, 38(2): 125-127.

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