标记辅助选择在猪育种中应用效果的研究

›› 2009, Vol. 36 ›› Issue (8): 67-72.

标记辅助选择在猪育种中应用效果的研究

李娅兰^1,2，张豪¹,张勤³,王青来⁴,陈瑶生^5

（1.华南农业大学动物科学院，广州 510642； 2.广东省农科院畜牧研究所，广州 510640； 3.中国农业大学动物科技学院，北京 100193； 4. 广东华农温氏畜牧股份有限公司，新兴 527400； 5.中山大学生命科学学院，广州 510006）

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2009-08-20 发布日期:2009-08-20
通讯作者: 陈瑶生

Research on the Efficiency of Marker-assisted Selection in Pig Breeding System

LI Ya-lan^1,2，ZHANG Hao¹，ZHANG Qin³，WANG Qing-lai⁴，CHEN Yao-sheng⁵

（1.College of Animal Science, South China Agricultural University, Guangzhou 510642，China； 2.Institute of Animal Science, Guangdong Academy of Agricultural, Guangzhou 510640，China； 3.College of Animal Science, China Agricultural University, Beijing 100193，China；4.Guangdong Huanong Wins Animal Husbandry Co.Ltd., Xinxing 527400，China； 5.College of Life Science, Sun Yat-Sen University, Guangzhou 510006，China）

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2009-08-20 Published:2009-08-20
Contact: CHEN Yao-sheng

摘要/Abstract

摘要： 本研究针对猪育种中重点考虑的窝产活仔猪数（NBA）、达100 kg体重日增重（ADG）、饲料利用率（FCR）、达100 kg体重的背膘厚（BF）、肌内脂肪含量（IMF） 5个性状，利用连锁平衡（linkage equilibrium，LE）、连锁不平衡（linkage disequilibrium，LD）标记和直接标记（direct marker，DR）3种类型的分子遗传标记，设计了3个规模不同的基础群，母猪数分别为100、200、300头，公猪数都为10头，基础群个体间无亲缘关系，育种群实施闭锁繁育。用Monte Carlo方法模拟了MAS的5个世代选择试验。育种值估计采用标准BLUP（Standard BLUP，SBLUP）模型（此育种值作为对照）、QBLUP模型（使用DR标记）、MBLUP模型（使用LD和LE标记）。结果表明，利用DR标记在各种情况下都比利用LD和LE标记获得的选择效率高；5个性状中，MAS对低遗传力、限性性状NBA的选择效率最高；当性状的QTL方差占遗传方差基本相同时，中等遗传力性状FCR的选择效率比高遗传力性状BF的更高；当性状的遗传力差异不大时，QTL方差占遗传方差比例大的性状FCR的选择效率比QTL方差占遗传方差比例小的性状ADG的更高。当利用QBLUP模型时，MAS对NBA的选择效率最高，ADG的选择效率最低。

关键词: 猪; 标记辅助选择（MAS）; 选择效率

Abstract: The found of the genetic markers tightly linked to the Quantitative Trait Loci (QTL) and some major genes for economic traits in husbandry animals has led to more and more research focusing on MAS (marker-assisted selection) and GAS ( gene-assisted selection). According to the distance between the genetic marker and the QTL, the genetic marker was divided into three types: LE (linkage equilibrium) marker, LD (linkage disequilibrium) marker and DR marker (direct marker, the QTL). To study the selection efficiency for 5 traits selected in the swine breeding plan by LE, LD and DR marker in MAS and GAS in 5 discrete generations, respectively, 3 closed nucleus base populations were designed: 100, 200, 300 sows, and 10 boars each population, where the pigs were unrelated. The 5 traits were NBA (number born-alive), FCR (feed-conversion ratio), ADG (average daily-gain), BF (Back-fat), IMF (Intramuscular fat). The model to estimate the breeding value of the 5 traits were SBLUP (standard BLUP) model(no marker used), MBLUP model (LD and LE markers used), by QBLUP(DR marker used). The selection efficiency by MAS and GAS was compared for 5 traits using MAS and GAS in 3 populations.

Key words: swine; marker-assisted selection; selection efficiency

中图分类号:

S828.2

李娅兰;张豪;张勤;王青来;陈瑶生. 标记辅助选择在猪育种中应用效果的研究[J]. , 2009, 36(8): 67-72.

LI Ya-lan;ZHANG Hao;ZHANG Qin;WANG Qing-lai;CHEN Yao-sheng . Research on the Efficiency of Marker-assisted Selection in Pig Breeding System[J]. , 2009, 36(8): 67-72.

[1]	杨玉铭, 赵鑫铭, 谭宝华, 肖丽窈, 芦格言, 翟立君, 黄奕扬, 洪林君, 顾婷. 长链非编码RNA MSTRG.14200对猪骨骼肌卫星细胞分化及肌纤维转化的影响[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(2): 453-461.
[2]	吴丹宁, 张亚南, 黄涛, 周晓龙, 汪涵, 李向臣, 李洪军, 文军, 张琪, 赵阿勇, 杨松柏. 饲喂全株青贮玉米对藏香猪肠道微生物的影响[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(2): 530-539.
[3]	孙耀威, 刘金松, 刘玉兰, 代兵, 牛玉, 张瑞强. 规模化猪场臭气减排技术研究进展[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(2): 591-600.
[4]	王佳伦, 陈辉, 孙浩玮, 郭瑶瑶, 梁国栋, 马云会, 高磊. 猪精液冷冻保存技术研究进展[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(2): 639-648.
[5]	郭紫艳, 宋延平, 年霞, 苏敏. 基于网络药理学和分子对接探讨郁金散加减方治疗猪传染性胃肠炎的作用机制[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(2): 809-819.
[6]	陈虹伶, 赵怡, 陈家骥, 韦秋旭, 李禧梦, 冯国越, 胡焜翔, 胡庭俊. 猪圆环病毒Ⅱ型感染3D4/2细胞的转录组学分析[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(1): 42-51.
[7]	杨黎宇, 李燕玲, 范舒钰, 李健. 芪蓝复方对妊娠母猪免疫增强作用研究[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(1): 64-73.
[8]	李虹仪, 杨雪芬, 林泽森, 吴晓菲, 吕祺欣, 余佳莉, 张茂. 罗伊氏乳杆菌替代抗生素对仔猪肠道miRNA表达的影响[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(1): 74-85.
[9]	许迪, 颜港, 张帅, 张坤, 江山, 邢天琦, 王钰滨, 王梦影, 兰干球, 梁晶. 大白猪生长性状影响因素分析及遗传参数估计[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(1): 193-202.
[10]	朱凯晴, 朱悦, 刘迎迎, 崔亚男, 蒋秉妤, 李妍. ETEC感染猪小肠上皮细胞初期差异表达cricRNA的筛选[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(9): 3490-3498.
[11]	沈海燕, 王松祺, 张斌, 刘志成, 张建峰, 廖明, 张春红. 猪A3Z2基因生物信息学分析及其对PEDV复制的抑制作用[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(9): 3695-3706.
[12]	字嘉鑫, 连英杰, 陈敏仪, 李秋煦, 张伟泽, 陆梦可, 张阳洋, 区浩炫, 马骏, 白挨泉. 4株广东地区2型猪链球菌耐药性及致病性研究[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(9): 3740-3751.
[13]	何娅, 王召贺, 陈波, 宋玉平, 周明光, 徐高原. 猪源A型多杀性巴氏杆菌灭活疫苗制备及免疫效果评估[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(9): 3752-3761.
[14]	王首元, 贠红梅, 史明月, 秦云梦, 李熊, 陈军舟, 周琛帛, 曹果清. 猪RPL36A基因对PK15细胞增殖过程的影响[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(8): 3035-3044.
[15]	张婷, 魏立民, 刘光亮, 王峰, 晁哲, 任钰为, 刘海隆, 郑心力, 黄丽丽, 孙瑞萍. 五指山猪和长白猪断奶仔猪肠道免疫性能及微生物多样性比较分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(8): 3113-3122.