猪Lbx2基因的克隆、序列分析及表达

中国畜牧兽医 ›› 2013, Vol. 40 ›› Issue (8): 26-30.

猪Lbx2基因的克隆、序列分析及表达

晁哲^1,3, 郑心力¹, 孙瑞萍^1,2, 魏立民^1,2, 刘圈炜^1,2, 刘海隆^1,2, 黄丽丽¹, 王峰¹

1. 海南省农业科学院畜牧兽医研究所, 海南海口 571100;
2. 海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室, 海南海口 571100;
3. 华中农业大学, 湖北武汉 430070

收稿日期:2013-01-28 出版日期:2013-08-20 发布日期:2013-08-16
通讯作者: 王峰 E-mail:chaozhe.cn@163.com
作者简介:晁哲(1984- ),男,河南人,博士,助理研究员,研究方向:动物遗传育种与繁殖。郑心力(1970- ),男,海南人,学士,副研究员,研究方向:家畜遗传育种。晁哲与郑心力对本文具有同等贡献,并列为第一作者。
基金资助:
国家科技支撑计划(2012BAI39B04);国家"863"项目(2011AA100300);海南省重点科技计划项目(090136)。

Cloning, Sequence Analysis and Expression of Lbx2 Gene in Pig

CHAO Zhe^1,3, ZHENG Xin-li¹, SUN Rui-ping^1,2, WEI Li-min^1,2, LIU Quan-wei^1,2, LIU Hai-long^1,2, HUANG Li-li¹, WANG Feng¹

1. Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Hainan Academy of Agricultural Sciences, Haikou 571100, China;
2. Hainan Key Laboratory of Tropical Animal Reproduction & Breeding and Epidemil Disease Research, Haikou 571100, China;
3. Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China

Received:2013-01-28 Online:2013-08-20 Published:2013-08-16

摘要/Abstract

摘要： 试验利用PCR扩增猪Lbx2基因组序列,通过克隆测序寻找基因中的突变位点,采用半定量RT-PCR分析猪不同组织中Lbx2基因的表达情况。结果显示,Lbx2基因在肝脏、肾脏和脾脏中微弱表达,在肌肉组织中不表达;通过比较不同物种氨基酸序列,结果发现猪Lbx2与牛、猩猩、犬进化关系较近;此外,在猪Lbx2基因组中发现5处突变位点,其中1个缺失突变(缺失11 bp)位于基因启动子区,另外4个单核苷酸突变分别位于第1外显子和内含子中。该试验结果为下一步Lbx2基因的功能研究奠定了基础。

关键词: 猪; Lbx2基因; 表达; 生物信息学分析

Abstract: In this study, the Lbx2 gene was amplified by PCR, then the gene mutation was identified by sequencing. The gene expression profile of different tissues in pig was analyzed by semi-quantitative RT-PCR method. The results showed that Lbx2 was lowly expressed in liver, kidney and spleen. A phylogenetic tree was constructed by aligning the amino acid sequences of different species, which revealed that the porcine Lbx2 had a closer genetic relationship with the Lbx2 of Bos taurus, Pongo abelii, Canis familiaris than with those of other species. Moreover, five mutations were detected in the Lbx2 genomic fragment, including one deletion mutation and four single nucleotide polymorphisms. These results would provide a foundation for further studies on Lbx2 function.

Key words: pig; Lbx2 gene; expression; bioinformatics analysis

中图分类号:

S828

晁哲, 郑心力, 孙瑞萍, 魏立民, 刘圈炜, 刘海隆, 黄丽丽, 王峰. 猪Lbx2基因的克隆、序列分析及表达[J]. 中国畜牧兽医, 2013, 40(8): 26-30.

CHAO Zhe, ZHENG Xin-li, SUN Rui-ping, WEI Li-min, LIU Quan-wei, LIU Hai-long, HUANG Li-li, WANG Feng. Cloning, Sequence Analysis and Expression of Lbx2 Gene in Pig[J]. China Animal Husbandry & Veterinary Medicine, 2013, 40(8): 26-30.

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