高原型藏绵羊KAP 基因单核苷酸多态性分析

›› 2010, Vol. 37 ›› Issue (10): 120-124.

高原型藏绵羊KAP 基因单核苷酸多态性分析

王志有1，2，祁全青3，陈玉林1

(1.西北农林科技大学动物科技学院，杨凌 712100；2.青海大学农牧学院，西宁 810016；3.青海省三角城种羊场，刚察 812300)

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2010-10-20 发布日期:2010-10-20
通讯作者: 陈玉林

Analysis on Single Nucleotide Polymorphisms of Keratin-associated Proteins Gene in Plateau Tibetan Sheep

WANG Zhi-you1，2，QI Quan-qing3，CHEN Yu-lin1

(1.College of Animal Science and Technology，Northwest A&F University， Yangling 712100， China；2.Agriculture and Animal Husbandry College， Qinghai University， Xining 810016， China； 3.Sanjiaocheng Sheep Breeding Farm of Qinghai Province， Gangcha 812300， China)

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2010-10-20 Published:2010-10-20
Contact: CHEN Yu-lin

摘要/Abstract

摘要： 试验旨在寻找角蛋白辅助蛋白(keratin-associated proteins，KAP)基因与产毛性状相关的多态位点，为藏绵羊产毛性状的分子标记提供理论依据。采用PCR-SSCP技术对高原型藏绵羊角蛋白辅助蛋白基因家族中KAP 3.2、KAP 7基因部分序列和KAP 8基因外显子进行多态性分析。结果表明，3个基因座都存在多态性，均检测到AA、AB和BB 3种基因型。KAP 3.2基因以A等位基因为优势等位基因，AA基因型为优势等位基因型；KAP 7和KAP 8基因均以B等位基因为优势等位基因，BB基因型为优势等位基因型。高原型藏绵羊在KAP 3.2和KAP 8基因座达中度多态，而在KAP 7基因座为低度多态，在KAP 3.2和KAP 8位点上基因型频率处于Hardy-Weinberg非平衡状态。测序分析结果表明，KAP 3.2和KAP 8基因上分别存在1个C→T（271 bp）和1个T→C(1122 bp）的突变，均属于同义突变，KAP 7基因5′调控区存在1个T→C（102 bp）的突变。

关键词: 高原型藏绵羊; 角蛋白辅助蛋白基因; 单核苷酸多态性; PCR-SSCP

Abstract: This study was conducted to analyze the polymorphisms of keratin-associated proteins (KAP) gene and aid to provide a theoretical foundation for molecular marker of wool production performance in tibetan sheep. The polymorphisms of partial sequence of KAP 3.2, KAP 7 and the exon of KAP 8 in plateau tibetan sheep were analyzed using PCR-SSCP. The results showed that there were polymorphisms in three gene locus, and were detected three genotypes (AA, AB, BB). The frequency of A allele was obviously higher than that of B allele, and the frequency of AA genotype was higher than AB and BB at KAP 3.2 locus, while the frequency of B allele was higher than A allele, and the frequency of BB genotype was higher than AA and AB at other two gene loci. The polymorphism was medium in KAP 3.2 and KAP 8 gene loci, while low in KAP 7 locus. The frequencies of genotype were deviated from the Hardy-Weinberg disequilibrium at KAP 3.2 and KAP 8 gene loci. The sequencing results showed that there was one mutation at 271 bp of KAP 3.2 and 1122 bp of KAP 8 gene, respectively, and there was one mutation at 102 bp of upstream regulatory region of KAP 7 gene. 

Key words: plateau tibetan sheep; keratin-associated proteins gene; single nucleotide polymorphism; PCR-SSCP

中图分类号:

S826

王志有;;祁全青;陈玉林. 高原型藏绵羊KAP 基因单核苷酸多态性分析[J]. , 2010, 37(10): 120-124.

WANG Zhi-you;;QI Quan-qing;CHEN Yu-lin. Analysis on Single Nucleotide Polymorphisms of Keratin-associated Proteins Gene in Plateau Tibetan Sheep[J]. , 2010, 37(10): 120-124.

[1]	张蕊, 穆春宇, 汤青萍, 卜柱, 杨明军, 夏爱萍, 杨晓明. 鸽GnIH基因多态性及其与产蛋性状的关联分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1412-1421.
[2]	龙安炬, 杨酸, 艾锦新, 翁吉梅, 张依裕, 蔡惠芬, 罗卫星. 黔北麻羊MC4R基因多态性及其与生长性状的关联分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(1): 198-209.
[3]	徐昊祺, 许静漪, 胡丽蓉, 张帆, 罗汉鹏, 张海亮, 师睿, 李想, 刘林, 刘巧香, 郭刚, 王雅春. 中国荷斯坦牛PIK3CB基因多态性及其与繁殖和产奶性状的关联分析[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(9): 3438-3452.
[4]	阮涌, 陈祥, 代林刚, 黄家锦, 安冬伟, 邹启顺. F3代波杂山羊VNN1基因多态性及其与产羔数的关联分析[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(4): 1384-1392.
[5]	张永浩, 肖逸, 郭丽君, 阿布都热合曼·吐尔逊, 王玉涛. 马可·波罗盘羊和5种家养绵羊MHC-DRB3基因第2外显子遗传多态性分析[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(3): 962-972.
[6]	李明明, 吴庆伟, 邓玉婷, 靳生伟, 贺娜, 张军霞. 藏羊BMPRⅡ基因多态性及其单倍型与产羔性状相关分析[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(2): 587-597.
[7]	赵玉强, 陈鑫, 李清春, 马继林, 董银河, 汪德明, 郭凌云, 黄涛. 大白猪ENO3基因多态性及其与生长性状的关联分析[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(1): 188-196.
[8]	杨晓斌, 何莉莉, 张扬, 周瑞锋, 后康丽, 张芸芸, 王月丽, 李青青, 石斌刚, 胡江. 牦牛乳铁蛋白基因多态性及其与乳品质性状的关联分析[J]. 中国畜牧兽医, 2021, 48(5): 1655-1663.
[9]	张凡, 徐杰, 李刚, 周永顺, 何营, 韩凯, 陈福龙, 高剑峰. 哈萨克羊iNOS基因多态性与布鲁氏菌病的相关性分析[J]. 中国畜牧兽医, 2021, 48(3): 1102-1111.
[10]	刘海霞, 韩大勇, 朱爱文, 闫伟, 王步忠, 蔡子健. 乌湖杂交羊GnRHR与INHA基因多态性及其互作效应对产羔数的影响[J]. 中国畜牧兽医, 2020, 47(3): 780-788.
[11]	马雪珍, 徐杰, 高剑峰, 李刚. 哈萨克绵羊DRB1基因外显子1和4多态性与布鲁氏菌病的相关性研究[J]. 中国畜牧兽医, 2020, 47(12): 3844-3851.
[12]	朴政玉, 夏广军, 严昌国, 冯健. 延边黄牛SCD1基因多态性及其与经济性状的关联分析[J]. 中国畜牧兽医, 2019, 46(9): 2642-2650.
[13]	罗成, 王元元, 王会敏, 谭君, 周光普, 高剑峰. 中国美利奴羊TLR2基因多态性及其与布鲁氏菌病的相关性分析[J]. 《中国畜牧兽医》, 2018, 45(5): 1145-1152.
[14]	王旭平, 杨胜林, 柳诚刚, 陆曼, 杨汝才, 谭斌, 周美迪, 王达娜, 李潇蒙. 番鸭下丘脑组织的RNA-Seq特征分析[J]. 《中国畜牧兽医》, 2018, 45(3): 604-611.
[15]	胡伟, 李明丽, 张燕林, 严达伟, 李中昌, 董新星, 计春律, 兰国湘, 潘玉春, 鲁绍雄. 长白猪prepro-orexin基因多态性及其与采食和生长性状的关联分析[J]. 《中国畜牧兽医》, 2018, 45(3): 712-720.