抗原表位鉴定方法的研究进展

›› 2012, Vol. 39 ›› Issue (7): 66-70.

抗原表位鉴定方法的研究进展

文雪霞, 陈化兰, 熊永忠, 王秀荣

中国农业科学院哈尔滨兽医研究所,农业部动物流感重点开放实验室,兽医生物技术国家重点实验室,黑龙江哈尔滨 150001

修回日期:2012-01-10 出版日期:2012-07-20 发布日期:2012-07-16
通讯作者: 王秀荣。E-mail:wxr@hvri.ac.cn E-mail:wxr@hvri.ac.cn
作者简介:文雪霞(1987－),女,河北人,硕士生,主要从事流感病毒分子诊断学研究。
基金资助:
哈尔滨市科技创新人才研究专项(RC2011XK002029);公益行业科研专项(200903055)。

Research Advance in Epitope Identification Methods

WEN Xue-xia, CHEN Hua-lan, XIONG Yong-zhong, WANG Xiu-rong

Animal Influenza Laboratory of Ministry of Agriculture,National Key Laboratory of Veterinary Biotechnology, Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Harbin 150001, China

Revised:2012-01-10 Online:2012-07-20 Published:2012-07-16

摘要/Abstract

摘要： 抗原表位是抗原分子中能与相应淋巴细胞表面的受体结合的特殊化学基团,一般由几个氨基酸残基序列或其空间结构组成。它是引起免疫应答的物质基础,其性质决定了抗原的特异性。抗原表位的鉴定方法主要有肽扫描技术、氨基酸定点突变技术、X-ray衍射或核磁共振技术、质谱技术、噬菌体展示肽技术及生物信息技术预测等,文章将从这几方面入手对近几年来鉴定抗原表位的方法作一综述。

关键词: 抗原表位; 鉴定方法; 研究进展

Abstract: An epitope is the part of an antigen that is combined with lymphocyte surface receptors. Generally, it is composed of several amino acid residues or their spatial structure. It is the material basis of the immune response, and its nature decides the specificity of antigen. Epitope identification methods include peptides scanning techniques, amino acid mutagenesis techniques, X-ray or nuclear magnetic resonance, mass spectrometry, peptide phage display technology and bioinformatics prediction. The common approaches for epitopes study in recent years were reviewed in this paper.

Key words: epitope; identification methods; research advance

中图分类号:

S852.4⁺3

文雪霞, 陈化兰, 熊永忠, 王秀荣. 抗原表位鉴定方法的研究进展[J]. , 2012, 39(7): 66-70.

WEN Xue-xia, CHEN Hua-lan, XIONG Yong-zhong, WANG Xiu-rong. Research Advance in Epitope Identification Methods[J]. China Animal Husbandry & Veterinary Medicine, 2012, 39(7): 66-70.

参考文献

1 张婷,张学光,瞿秋霞,等.计算机模建和点突变分析抗人CD40单克隆抗体5C11识别的抗原表位[J].中国肿瘤生物治疗杂志,2011,18: 355~361.
2 杜承.恶性疟原虫Pf332抗原的免疫原性分析.长春:吉林大学,2010.
3 Anna S＇, Aneta S, Marlena K, et al. Identification of the epitope for anti-cystatin C antibody[J].Journal of Molecular Recognition,2011,24(4):687~699.
4 Buus S, Lauemoller S L, Worning P, et al. Sensitive quantitative predictions of peptide-MHC binding by a 'Query by Committee’ artificial neural network approach[J]. Tissue Antigens,2003,62(5):378~384.
5 Christina A S, Rupert E C, Mark G R,et al. Identification and characterization of HLA-A*0301 epitopes in HIV-1 gag proteins using a novel approach[J]. Journal of Immunological Methods,2010,352:118~125.
6 Davide C, Jarrod V, Steven J G, et al. A neutralizing antibody selected from plasma cells that binds to group 1 and group 2 influenza A hemagglutinins[J]. Science,2011,33(6044): 850~856.
7 DÖnnes P, Elofsson A.Prediction of MHC classⅠbinding peptides, using SVMHC[J].BMC Bioinformatics,2002, 3:25.
8 Dnnes P, Kohlbacher O.SVMHC: a server for prediction of MHC-binding peptides[J]. Nucleic Acids Res,2006,34: W194~W197.
9 Hochleitner E O, Gorny M K, Zolla-Pazner S, et al. Mass sectrometric characterization of a discontinous epitope of the HIV envelope protein HIV-gp120 recognized by the human monoclonal antibodies 1331A[J]. J Immuno,2000,164(8): 4156~4161.
10 Jayaprakasam M, Prabhu R P, Gandhirajan A, et al. Identification and characterization of nematode specific protective epitopes of Brugia malayi TRX towards development of synthetic vaccine construct for lymphatic filariasis[J]. Vaccine,2010,28:5038~5048.
11 Jemmerson R,Paterson Y. Mapping epitopes on a protein antigen by the proteolysis of antigen-antibody complexes[J]. Science,1986,232(4753): 1001~1004.
12 Jens E P L, Ole L, Morten N.Improved method for predicting linear B-cell epitopes[J]. Immunome Research, 2006, 2:2.
13 Jiang L, Zhou J M, Yin Y, et al.Selection and identification of B-cell epitope on NS1 protein of dengue virus type 2[J].Virus Research,2010,150: 49~55.
14 Manpreet K, Hema C, Harpreet S,et al.Identification and characterization of immunodominant B-cell epitope of the C-terminus of protective antigen of Bacillus anthracis[J]. Molecular Immunology,2009,46: 2107~2115.
15 Merrill J R, Karen O’Connor, Lakshmi W.Phage display for epitope determination: a paradigm for identifying receptor-ligand interactions[J]. Biotechnology Annual Review, 2004,10:151~188.
16 Noguchi H, Kato R, Hanai T, et al.Hidden Markov model-based prediction of antigenic peptides that interact with MHC class Ⅱ molecules[J].J Biosci Bioeng,2002, 94(3): 264~270.
17 Saha S, Raghava G P. Prediction of continuous B-cell epitopes in an antigen using recurrent neural network[J]. Proteins,2006,65(1): 40~48.

[1]	王小格, 司煊瑛, 闫志伟, 王飞, 尤龙琪, 刘梗, 蔡茂, 梁珺珹, 梁玉秀, 杜永坤, 张改平. 非洲猪瘟病毒p22蛋白单克隆抗体制备及其抗原表位鉴定[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(2): 781-791.
[2]	张国庆, 姜宇航, 张爽, 李乐天, 郝嘉翼, 陈竞, 邹万成, 李昌, 李太元, 高旭, 金宁一. 猪δ冠状病毒RBD蛋白多肽抗体的制备与鉴定[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1575-1583.
[3]	张婧旭, 徐玉, 梁海英, 曾智勇, 汤德元, 王彬, 徐松平, 万娟, 祝羊. 伪狂犬病病毒贵州分离株与疫苗株遗传进化和抗原表位分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(3): 1093-1106.
[4]	徐娅玲, 张霁辉, 牛熙, 李升, 黄世会, 冉雪琴, 王嘉福. 非洲猪瘟病毒P72蛋白合成肽疫苗的构建及其免疫效力评估[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(8): 3083-3090.
[5]	张振宇, 王勇. 乳与乳制品中黄曲霉毒素检测研究进展[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(7): 2820-2830.
[6]	莫红芳, 揭凯, 陈鑫, 文威, 刘文强, 陈焕春, 钱平, 李祥敏. 猪塞尼卡谷病毒单克隆抗体的制备及鉴定[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(1): 307-317.
[7]	潘晨浩, 张欣, 赵瑞利, 姜轩, 金天明, 于恩远, 李留安, 曾君, 于晓雪, 宋淇淇, 胡烨. 猪链球菌重组靶向表位蛋白DCpep-GSE的构建及细胞毒性检测[J]. 中国畜牧兽医, 2021, 48(8): 2990-3001.
[8]	孙正楠, 张焕容. 羊口疮病毒B2L蛋白抗原表位预测及重组蛋白设计与验证[J]. 中国畜牧兽医, 2020, 47(3): 686-695.
[9]	杨亚军, 何金科, 白天鸽, 宋胜男, 杨宁宁, 陈创夫, 王震. 奶牛妊娠相关糖蛋白2的表达及结构功能预测分析[J]. 中国畜牧兽医, 2020, 47(10): 3039-3048.
[10]	韩斐, 江明锋, 王刚. 胰高血糖素样肽-2及其在畜牧生产中的应用[J]. 《中国畜牧兽医》, 2019, 46(6): 1612-1618.
[11]	林厦菁, 苟钟勇, 蒋守群. 2017-2018年黄羽肉鸡饲料营养研究进展[J]. 《中国畜牧兽医》, 2019, 46(4): 1018-1030.
[12]	吴阳开, 范文胜, 张雪莲, 李智丽, 郭锦玥, 李文锋, 黄淑坚. 新型鸭呼肠孤病毒QY株σB蛋白基因特征、二级结构预测及其细胞抗原表位分析[J]. 中国畜牧兽医, 2019, 46(10): 2851-2859.
[13]	孙宏宇, 索朗斯珠, 徐业芬, 牛家强, 姚一龙, 张入丹, 王冬经. 牛主要抗病候选基因的研究进展[J]. 《中国畜牧兽医》, 2018, 45(7): 1912-1918.
[14]	孙正楠, 毛从剑, 张焕容. 山羊口疮病毒四川分离株F1L基因分子特征分析及抗原表位预测[J]. 《中国畜牧兽医》, 2018, 45(7): 1942-1948.
[15]	赵学亮, 王梦雅, 孙柯, 冯陈晨, 王文龙. 斯氏副柔线虫GP基因的克隆、抗原表位预测及生物信息学分析[J]. 《中国畜牧兽医》, 2018, 45(6): 1645-1652.