犬瘟热病毒分离株N、H、F蛋白基因的变异分析

›› 2011, Vol. 38 ›› Issue (8): 71-77.

犬瘟热病毒分离株N、H、F蛋白基因的变异分析

王旭荣, 王小辉, 张世栋, 李世宏, 潘虎, 严作廷

中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所中国农业科学院临床兽医学研究中心,甘肃兰州 730050

收稿日期:2010-12-21 修回日期:1900-01-01 出版日期:2011-08-20 发布日期:2011-08-20

Genetic Diversity Analysis of the N, H, F Protein Genes of Canine Distemper Virus Isolate

WANG Xu-rong, WANG Xiao-hui, ZHANG Shi-dong, LI Shi-hong, PAN Hu, YAN Zuo-ting

Research Center of Clinical Veterinary Medicine,Chinese Academy of Agricultural Sciences, Lanzhou Institute of Animal Science and Veterinary Pharmaceutics, Chinese Academy of Agricultural Sciences,Lanzhou 730050,China

Received:2010-12-21 Revised:1900-01-01 Online:2011-08-20 Published:2011-08-20

摘要/Abstract

摘要： 通过RT-PCR方法扩增到犬瘟热病毒(canine distemper virus,CDV)分离株GS0812-4的N、H、F蛋白基因,然后克隆入pGEM-T Easy载体并进行序列分析和抗原表位预测分析。结果表明,GS0812-4分离株的N、H、F蛋白基因与其他分离株相应序列的核苷酸同源性分别为93.2%~97.8%、90.3%~97.3%、93.2%~97.8%,其推定的氨基酸同源性分别为96.6%~98.7%、91.3%~97.9%和96.6%~98.7%;GS0812-4分离株N、H、F蛋白基因与疫苗株相应序列的核苷酸同源性分别为93.1%~93.8%、89.4%~90.5%、93.1%~93.8%,其推定的氨基酸同源性分别为96.4%~97.3%、89.3%~91.3%、96.4%~97.3%。由基因系统发育树可知,GS0812-4与疫苗株处于不同的分支,其中与MKY-KM08的亲缘关系最近,但GS0812-4在N、H、F 3个基因系统发育树上与其他同一毒株的亲缘关系远近不同。H、F蛋白的抗原表位预测结果表明,GS0812-4与MKY-KM08和疫苗株的抗原表位均有差异。说明GS0812-4是野毒株,与MKY-KM08属于同一基因型,来源于同一毒株,但两毒株间的H蛋白和F蛋白的抗原表位仍有差异。

关键词: 犬瘟热病毒; H蛋白; H蛋白; F蛋白; 变异分析

Key words: CDV; nucleoprotein(N); fusion protein(F); haemgagglutinin protein(H); genetic diversity

中图分类号:

王旭荣;王小辉;张世栋;李世宏;潘虎;严作廷. 犬瘟热病毒分离株N、H、F蛋白基因的变异分析[J]. , 2011, 38(8): 71-77.

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