牛轮状病毒TaqMan实时荧光RT-PCR 快速检测方法的建立

›› 2011, Vol. 38 ›› Issue (4): 105-108.

牛轮状病毒TaqMan实时荧光RT-PCR 快速检测方法的建立

范晴, 谢芝勋, 刘加波, 庞耀珊, 邓显文, 谢志勤, 谢丽基, 彭宜

广西兽医研究所,广西南宁 530001

收稿日期:2010-09-16 修回日期:1900-01-01 出版日期:2011-04-20 发布日期:2011-04-20
通讯作者: 谢芝勋

Detection of Bovine Rotavirus by TaqMan Based Real-time Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction Assay

FAN Qing, XIE Zhi-xun, LIU Jia-bo, PANG Yao-shan, DENG Xian-wen, XIE Zhi-qin, XIE Li-ji, PENG Yi

Guangxi Veterinary Research Institute, Nanning 530001, China

Received:2010-09-16 Revised:1900-01-01 Online:2011-04-20 Published:2011-04-20

摘要/Abstract

摘要： 本研究按照牛轮状病毒(BRV)结构蛋白VP6基因序列,设计合成引物和探针,经各反应条件的优化,建立了BRV TaqMan实时荧光定量RT-PCR技术。对BRV进行了特异性、敏感性和重复性试验。结果表明,TaqMan实时荧光RT-PCR最低可检测到100个拷贝病毒RNA;与牛病毒性腹泻病毒(BVD)、猪瘟病毒(CSFV)、牛结核杆菌(MB)和牛传染性鼻气管炎病毒(IBRV)不发生交叉反应;所制作的标准曲线在10²~10⁹拷贝/μL浓度范围内有极好的线性关系且线性范围宽,相关系数为0.997;与常规的RT-PCR相比,该方法具有快速、特异、敏感、重复性好、可同时检测大量样品等优点。可对样品中微量BRV进行准确检测,对BRV的诊断有重要意义。

关键词: 牛轮状病毒; TaqMan实时荧光定量PCR; 检测

Abstract: A TaqMan based real-time RT-PCR was developed for the specific detection of bovine rotavirus (BRV). The specific primers and probes were designed according to the VP6 sequences of BRV. It was found that the specificity of this assay was high without any cross-reactions and had no CSFV, BVD, MB and IBRV. A good linear correlation was demonstrated in the standard curve for the real-time PCR assay within the range of 10² to 10⁹copies, with a correlation coefficient of 0.997. The detection limit of the real-time RT-PCR assay was 100 copies of viral RNA, indicating a good sensitivity of the assay. This TaqMan based real-time RT-PCR assay reported here is a valuable method with high specificity and sensitivity detection of BRV.

Key words: BRV; TaqMan based real-time RT-PCR; detection

中图分类号:

范晴;谢芝勋;刘加波;庞耀珊;邓显文;谢志勤;谢丽基;彭宜. 牛轮状病毒TaqMan实时荧光RT-PCR 快速检测方法的建立[J]. , 2011, 38(4): 105-108.

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