利用mtDNA细胞色素b分析贵州山羊的系统发育

›› 2010, Vol. 37 ›› Issue (5): 129-132.

利用mtDNA细胞色素b分析贵州山羊的系统发育

黄勤华1，刘若余2

(1.贵州六盘水职业技术学院，六盘水 553000； 2.贵州大学动物科学院，贵阳 550025)

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2010-05-20 发布日期:2010-05-20
通讯作者: 刘若余

To Analyze the Phylogeny of the Guizhou Goats by mtDNA Cytochrome b Gene

HUANG Qin-hua1，LIU Ruo-yu2

（1.Profession Technical College in Liupanshui，Liupanshui 553000，China；2.College of Animal Science， Guizhou University，Guiyang 550025，China)

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2010-05-20 Published:2010-05-20
Contact: LIU Ruo-yu

摘要/Abstract

摘要： 试验选取贵州山羊4个群体（共55只），设计引物对其mtDNA细胞色素b基因片段进行测序，测序结果与GenBank报道的8个山羊品种mtDNA细胞色素b基因进行比对分析。结果发现，在55只贵州山羊中有11个变异位点，其中转换10次，T／G颠换1次；10种单倍型中有7种单倍型为1个群体独享，3种单倍型为多个群体共享。4个山羊类群间存在较近的亲缘关系，既是独立的类群，其间也存在基因交流，其中贵州黑山羊和贵州麻羊的亲缘关系最近，与贵州白山羊的亲缘关系次之，与贵州小香羊的亲缘关系最远。从山羊品种间遗传距离构建的邻接树可见，贵州4个山羊类群均起源于镰刀状角羊。

关键词: 贵州山羊; 线粒体DNA; 细胞色素b基因; 系统发育; 亲缘关系

Abstract: The complete sequence of mitochondrial DNA cytochrome b gene was amplified and sequenced from the 55 samples in 4 Guizhou goats population， and compared and analyzed with mtDNA cytochrome b gene of 8 goat breeds downloaded from GenBank . Sum to 11 variable sites were found in 55 individuals of Guizhou goats of which converted 10 times， T/G transversion 1 time. There were 7 kinds of haplotypes of 10 as a group of exclusive，and three kinds of haplotypes were shared by multiple groups. 4 goats breeds closer genetic relationship existed between both independent breed， during the same time， there were also genetic exchange. Guizhou Black goat was the closest to Guizhou Ma goat，next to Guizhou White goat，furthest to Guizhou Xiaoxiang goat. From NJ tree based on matrix dA among goat breees can know that 4 goat breeds had arisen from Capra aegagrus.

Key words: Guizhou goat; mtDNA; Cytb; phylogenetic; relationship

中图分类号:

S827.3

黄勤华;刘若余. 利用mtDNA细胞色素b分析贵州山羊的系统发育[J]. , 2010, 37(5): 129-132.

HUANG Qin-hua;LIU Ruo-yu. To Analyze the Phylogeny of the Guizhou Goats by mtDNA Cytochrome b Gene [J]. , 2010, 37(5): 129-132.

[1]	韩大勇, 周春宝, 倪黎纲, 陈章言, 赵锦明. 苏姜猪mtDNA D-loop序列的遗传多样性分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1472-1479.
[2]	刘晓玮, 李瑞香, 王兴龙, 李晓. 基于mtDNA Cytb基因和D-loop区序列的陕西林麝遗传多样性分析[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(4): 1352-1363.
[3]	袁敬知, 杨莉瑶, 陈思宇, 蔡宗伶, 李珣, 廖玉英, 王晓晔. 活禽产业链中大肠杆菌耐药性及耐药基因调查[J]. 中国畜牧兽医, 2021, 48(7): 2661-2670.
[4]	江婉琳, 马勋, 王静, 平丽莹, 蔡思奇. 新疆克拉玛依地区奶牛源致病性大肠杆菌的血清型、系统进化群及MLST分析[J]. 中国畜牧兽医, 2021, 48(4): 1414-1422.
[5]	李静, 郭丽君, 王莉, 胡平, 肖逸, 韩建林, 王玉涛. 喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛mtDNA D-loop区遗传多样性及系统发育分析[J]. 中国畜牧兽医, 2020, 47(8): 2481-2492.
[6]	李莹, 何国戈, 王艳, 何静怡, 黄爱珍, 郑经成, 葛影影, 罗成龙. 4个优质鸡群体mtDNA D-loop区遗传多样性分析[J]. 中国畜牧兽医, 2020, 47(2): 469-478.
[7]	卜李那, 彭业博, 张春媛, 刘洋秀, 赵毅强. 基于祖源分析的猪遗传成分鉴定[J]. 中国畜牧兽医, 2020, 47(2): 544-553.
[8]	李兴才, 潘成勇, 李辉, 杨华婷, 陈林, 肖涛. 香炉山鸡线粒体DNA D-Loop区遗传多样性及系统进化研究[J]. 中国畜牧兽医, 2019, 46(9): 2633-2641.
[9]	徐冰冰, 张家新, 王瑞军, 王志英, 李学武, 宋国欣, 张美娜, 郭富强, 张俊杰, 张燕军, 苏蕊, 刘志红, 李金泉. 哺乳动物精子线粒体研究进展[J]. 中国畜牧兽医, 2019, 46(9): 2651-2657.
[10]	李义书, 侯冠彧, 曹婷, 施力光, 周汉林, 周雄. 基于线粒体DNA D-loop区全序列分析儋州鸡遗传多样性及其起源进化关系[J]. 《中国畜牧兽医》, 2019, 46(5): 1439-1446.
[11]	胡丽莉, 孙彦, 刘莹莹, 王晨, 卜艳珍. 细口杯环线虫形态学和分子特征分析[J]. 《中国畜牧兽医》, 2019, 46(1): 271-278.
[12]	吕雪峰, 邢巍婷, 许艳丽, 张敏, 王乐. 新疆引进羊驼遗传多样性与系统发育研究[J]. 《中国畜牧兽医》, 2017, 44(9): 2709-2715.
[13]	胡慧艳, 贾青, 刘津, 侯胜奎, 赵思思, 张伟峰. 中国地方猪种线粒体基因组遗传多样性及其系统发育分析[J]. 《中国畜牧兽医》, 2017, 44(8): 2360-2368.
[14]	尹亚军, 杜伟立, 王令, 张涛. 略阳乌鸡线粒体DNA控制区(D-loop)的遗传多样性分析[J]. 《中国畜牧兽医》, 2017, 44(1): 173-179.
[15]	李丽莎, 李祥龙, 周荣艳, 李兰会, 张永改, 马梦云. 酪氨酸相关蛋白酶1基因编码区系统发育分析和正选择位点检测[J]. 《中国畜牧兽医》---唯一指定的官方网站, 2015, 42(9): 2427-2435.