中国9个地方山羊品种的遗传多样性和群体结构分析

›› 2010, Vol. 37 ›› Issue (1): 95-99.

中国9个地方山羊品种的遗传多样性和群体结构分析

樊睿¹，王志刚²，刘丑生²，罗军¹，张桂香²，韩旭²，胡志帅³，徐丽梅⁴

(1.西北农林科技大学动物科技学院，杨凌 712100； 2.农业部全国畜牧总站畜禽牧草种质资源保存利用中心，北京 100193； 3.山西农业大学动物科技学院，太谷 030801； 4.甘肃农业大学动物科学技术学院，兰州 730070)

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2010-01-20 发布日期:2010-01-20
通讯作者: 刘丑生

Genetic Diversity and Population Structure in Nine Chinese Indigenous Goat Breeds

FAN Rui¹， WANG Zhi-gang²， LIU Chou-sheng²， LUO Jun¹， ZHANG Gui-xiang²， HAN Xu²， HU Zhi-shuai³， XU Li-mei^4

（1.College of Animal Science and Technology, Northwest Sci-Tech University of Agriculture & Forestry, Yangling 712100, China; 2.National Center of Preservation and Utilization of Genetic Resources of Domestic Animals and Forage, National Animal Husbandry and Veterinary Service, Beijing 100193, China; 3.College of Animal Science and Technology,Shanxi Agricultural University,Taigu 030801,China; 4.College of Animal Science and Technology, Gansu Agricultural University, Lanzhou 730070, China）

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2010-01-20 Published:2010-01-20
Contact: LIU Chou-sheng

摘要/Abstract

摘要： 采用联合国粮农组织（FAO）和国际动物遗传学会（ISAG）联合推荐的数据库中选取的16对微卫星引物对中国9个地方山羊品种和1个引进品种（波尔山羊）的遗传多样性及群体结构进行分析。结果表明，在15个微卫星位点上共检测到159个等位基因；9个地方山羊品种的Fst值为89.5%，说明89.5%的遗传变异存在于品种内，而10.5%的遗传变异存在于品种间；依据Da遗传距离构建UPGMA系统发生树，表明波尔山羊分开独自聚为一类，9个地方山羊品种分为两类；采用Structure软件对10个山羊品种的群体结构进行分析，可以将其分为4组。所得到的群体关系同聚类图得到的结果基本一致。

关键词: 中国地方山羊品种; 微卫星; 遗传多样性; 群体结构

Abstract: Nine Chinese indigenous goat breeds and Boer were genotyped using 16 microsatellite markers recommended by the FAO and ISAG. 15 of the 16 microsatellite markers which had more than four alleles were used to analyze the genetic variation within the population and the genetic relationship and structure among the populations. A total of 159 microsatellite alleles were detected. Mean F-statistic (0.105) for nine indigenous breeds indicated that 89.5% of the variation was detected within the breeds and 10.5% of the genetic variation existed among the indigenous breeds. The UPGMA phylogenetic tree was constructed based on Da genetic distance and three clusters was obtained. The Boer separated from the indigenous breeds and formed one cluster. The indigenous goat breeds were divided into two clusters. The analysis of the population for the ten breeds showed they were separated into four clusters. The results showed that the population relationship is nearly the same to the UPGMA phylogenetic tree. 

Key words: Chinese indigenous goat breeds; microsatellite; genetic diversity; population structure

中图分类号:

S826.8

樊睿;王志刚;刘丑生;罗军;张桂香;韩旭;胡志帅;徐丽梅. 中国9个地方山羊品种的遗传多样性和群体结构分析[J]. , 2010, 37(1): 95-99.

FAN Rui;WANG Zhi-gang; LIU Chou-sheng; LUO Jun; ZHANG Gui-xiang;HAN Xu; HU Zhi-shuai; XU Li-mei. Genetic Diversity and Population Structure in Nine Chinese Indigenous Goat Breeds[J]. China Animal Husbandry & Veterinary Medicine, 2010, 37(1): 95-99.

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