黑羽鹌鹑的EST-SSR标记开发与应用

doi:10.16431/j.cnki.1671-7236.2016.05.030

›› 2016, Vol. 43 ›› Issue (5): 1323-1328.doi: 10.16431/j.cnki.1671-7236.2016.05.030

黑羽鹌鹑的EST-SSR标记开发与应用

白俊艳, 庞有志, 杨又兵, 祁艳霞, 李宏伟

河南科技大学动物科技学院, 洛阳 471003

收稿日期:2015-09-28 出版日期:2016-05-20 发布日期:2016-05-23
通讯作者: 庞有志 E-mail:pyzh2006@163.com
作者简介:白俊艳(1975-),女,内蒙古赤峰人,博士,副教授,研究方向:动物遗传育种,E-mail:junyanbai@163.com
基金资助:
河南省科技厅项目(2015HNCXY012)

Development and Application of EST-SSR Markers of Black Quail

BAI Jun-yan, PANG You-zhi, YANG You-bing, QI Yan-xia, LI Hong-wei

College of Animal Science and Technology, Henan University of Science and Technology, Luoyang 471003, China

Received:2015-09-28 Online:2016-05-20 Published:2016-05-23

摘要/Abstract

摘要： 本研究旨在加速分子标记在黑羽鹌鹑遗传育种等方面的应用,开发黑羽鹌鹑的EST-SSR标记。随机选取100只黑羽鹌鹑,心脏采血2mL,采用生物信息学方法开发黑羽鹌鹑的EST-SSR新标记,并检测EST-SSR标记在黑羽鹌鹑群体中的多态性。结果显示,在黑羽鹌鹑中成功的开发出了6个EST-SSR标记,EST-SSR标记检测到的观测等位基因数为2~6个,6个EST-SSR标记在黑羽鹌鹑的平均多态信息含量(PIC)为0.4962,平均期望杂合度(He)为0.5759。6个EST-SSR标记中P1和P2个为高度多态标记,其他4个EST-SSR为中度多态标记。新开发的6个EST-SSR标记可用于黑羽鹌鹑的遗传多样性分析,6个EST-SSR标记与鹌鹑的糖类代谢、黑色素的合成等有关系,但具体的机理还有待进一步分析。

关键词: 黑羽鹌鹑; EST-SSR; 生物信息学; 遗传多样性

Abstract: The purpose of this study was to accelerate the application of molecular markers in genetic breeding and other aspects of Black quail to develop EST-SSR markers for Black quail.100 Black quail were randomly chosen and blood samples were collected to develop EST-SSR new markers and determined the genetic polymorphism using bioinformatics.The results showed that there were 6 EST-SSR markers in the Black quail, the number of observed alleles in EST-SSR was 2 to 6.The average PIC of 6 EST-SSR markers in the Back quail was 0.4962 and the average He was 0.5759.Markers P1 and P2 were highly polymorphic markers among 6 EST-SSR and the rest EST-SSR markers were moderately polymorphic markers.These developed markers could be used for genetic diversity analysis of Black quail and the EST-SSR markers had some relationship with the carbohydrate metabolism, synthesis of melanin in Black quail, but the mechanism needed the further analysis.

Key words: Black quail; EST-SSR; bioinformatics; genetic diversity

中图分类号:

S839.2

白俊艳, 庞有志, 杨又兵, 祁艳霞, 李宏伟. 黑羽鹌鹑的EST-SSR标记开发与应用[J]. , 2016, 43(5): 1323-1328.

BAI Jun-yan, PANG You-zhi, YANG You-bing, QI Yan-xia, LI Hong-wei. Development and Application of EST-SSR Markers of Black Quail[J]. , 2016, 43(5): 1323-1328.

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Development and Application of EST-SSR Markers of Black Quail

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