水牛信号转导子和转录激活子1基因电子克隆及序列分析

中国畜牧兽医

水牛信号转导子和转录激活子1基因电子克隆及序列分析

邓廷贤，庞春英，陈明棠，王建，杨炳壮，梁贤威

中国农业科学院广西水牛研究所，农业部(广西)水牛遗传繁育重点实验室，广西南宁 530001

收稿日期:2014-02-14 出版日期:2014-08-20 发布日期:2014-08-22
通讯作者: 梁贤威（1962—），男，广西人，硕士，研究员，研究方向：动物遗传育种。E-mail：liangbri@126.com；Tel：0771-2371660
作者简介:邓廷贤（1983—），男，湖南人，硕士，助理研究员，研究方向：分子遗传学。
基金资助:
桂渔牧科（1204917）；桂渔牧科（1304512）；广西‘特聘专家’专项；国家国际科技合作专项（2014DFA31970）。

Silico Cloning and Sequence Analysis of STAT1 Gene in Water Buffalo (Bubalus bubalis)

DENG Ting-xian, PANG Chun-ying, CHEN Ming-tang, WANG Jian, YANG Bing-zhuang, LIANG Xian-wei

Key Laboratory of Buffalo Genetics, Breeding and Reproduction Technology, Ministry of Agriculture (Guangxi), Guangxi Buffalo Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Nanning 530001, China

Received:2014-02-14 Online:2014-08-20 Published:2014-08-22

摘要/Abstract

摘要： 本研究运用生物信息学方法对水牛信号转导子和转录激活子1(signal transduction and activators of transcription 1，STAT1)基因进行电子克隆及其序列分析。以牛STAT1基因序列作为探针电子克隆了水牛STAT1基因完整的编码序列并进行了RT-PCR验证。序列分析结果表明，水牛的STAT1基因序列长3437 bp，包含1个2244 bp的开发阅读框，共编码747个氨基酸。该基因cDNA编码区序列与普通牛、绵羊、人、猪、大鼠、小鼠和山羊同源性比对结果表明，其相似性分别为99%、98%、89%、93%、86%、85%和87%。经聚类分析结果表明，水牛与普通牛的分子进化关系最近。

关键词: 水牛; 信号转导子和转录激活子1基因; 电子克隆; 生物信息学

Abstract: The buffalo STAT1 gene was silico cloned and analyzed by bioinformatics method in this study. Using the Bos taurus STAT1 sequences to get and identify the buffalo STAT1 gene sequences by the silico cloning and RT-PCR technology. The results showed that the buffalo STAT1 gene length size was 3437 bp, contained an open reading frame (ORF) of 2244 bp that encoded 747 amino acids. The CDS of the obtained buffalo STAT1 gene showed that 99%，98%，89%，93%，86%，85% and 87% identity with that of Bos taurus, Ovi saries, Homo sapiens, Sus scrofa, Rattus norvegicus, Mus musculus and Capra hircus. Analysis of the phylogenetic tree showed that the nearest relationship existed between buffalo and Bos taurus.

Key words: buffalo; STAT1 gene; silico cloning; bioinformatics

邓廷贤，庞春英，陈明棠，王建，杨炳壮，梁贤威. 水牛信号转导子和转录激活子1基因电子克隆及序列分析[J]. 中国畜牧兽医.

DENG Ting-xian, PANG Chun-ying, CHEN Ming-tang, WANG Jian, YANG Bing-zhuang, LIANG Xian-wei. Silico Cloning and Sequence Analysis of STAT1 Gene in Water Buffalo (Bubalus bubalis)[J]. .

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