猪繁殖与呼吸综合征病毒山西分离株ORF5基因的序列分析

›› 2013, Vol. 40 ›› Issue (2): 10-13.

猪繁殖与呼吸综合征病毒山西分离株ORF5基因的序列分析

刘文俊¹, 姚敬明¹, 吴忻¹, 王娟萍¹, 孟帆¹, 韩一超¹, 樊振华¹, 米瑞娟¹, 罗甜甜², 温永亮¹

1. 山西省农科院畜牧兽医研究所,山西太原 030032;
2. 山西省动物疫病预防控制中心,山西太原 030024

收稿日期:2012-09-06 出版日期:2013-02-20 发布日期:2013-02-06
通讯作者: 姚敬明(1957-),男,山西人,副研究员,主要从事畜禽传染病的研究。E-mail:jcbyjs@sohu.com;Tel:0351-7561941 E-mail:jcbyjs@sohu.com;Tel:0351-7561941
作者简介:刘文俊(1979-),男,山西人,硕士,助理研究员,主要从事动物疫病分子生物学检测与诊断技术的研究。
基金资助:
山西省科技攻关项目(20080311036-1);山西省基础研究项目(青年科技研究基金)(2012021028-1)。

Sequence Analysis of ORF5 Gene of Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus Isolated from Shanxi Area

LIU Wen-jun¹, YAO Jing-ming¹, WU Xin¹, WANG Juan-ping¹, MENG Fan¹, HAN Yi-chao¹, FAN Zhen-hua¹, MI Rui-juan¹, LUO Tian-tian², WEN Yong-liang¹

1. Institution of Animal Husbandry and Veterinary, Shanxi Academy of Agricultural Sciences, Taiyuan 030032, China;
2. Shanxi Provincial Center for Animal Disease Prevention and Control, Taiyuan 030024, China

Received:2012-09-06 Online:2013-02-20 Published:2013-02-06

摘要/Abstract

摘要： 采用RT-PCR方法对2009—2011年山西省疑似猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)阳性病料进行克隆和测序,获得5个ORF5基因片段,并对其基因序列和推导的氨基酸序列与国内外毒株进行了同源性分析。序列分析结果表明,5个ORF5基因序列之间核苷酸同源性为97.7%～98.5%,与欧洲型代表株LV、美洲型代表株VR-2332、2006—2007年国内分离的PRRSV变异株(JXA1、HuN、HUN4、HUB1)、2006年以前中国分离毒株(CH-1a、HB-1(sh)、HB-2(sh))和2个疫苗株(Resp PRRS MLV、MLV RespPRRS/Repro)核苷酸同源性分别为63.5%～64.0%、88.7%～89.2%、97.7%～99.3%、88.1%～96.7%和88.6%～89.1%;氨基酸同源性分别为56.1%～56.6%、87.8%～88.8%、96.6%～98.5%、85.9%～93.2%、86.8%～87.9%。结果表明山西地区的PRRSV流行毒株均属于美洲型,且毒株同源性很高,亲缘关系紧密。

关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒; ORF5基因; 变异分析

Abstract: Through RT-PCR amplification of tissue or blood sample from Shanxi province, the 5 ORF5 gene nucleotide sequences were obtained. The obtained sequences and the deduced amino acid were analyzed and compared with the other published PRRSV strains. The nucleotide homology were 97.7% to 98.5% among 5 ORF5,comparing with LV, the strains isolated from China in 2006 to 2007, the strains isolated before 2006, Resp PRRS MLV and MLV RespPRRS/Repro, the nucleotide homology were 63.5% to 64.0%, 88.7% to 89.2%, 97.7% to 99.3%, 88.1% to 96.7%, 88.6% to 89.1%.The aniniacid homology were 56.1% to 56.6%,87.8% to 88.8%,96.6% to 98.5%,85.9% to 93.2%,86.8% to 87.9%, respectively. The results showed that the prevalent PRRSV strains in Shanxi belong to North American genotype which had high homology and correlative genetic relationship.

Key words: PRRSV; ORF5 gene; variation analysis

中图分类号:

刘文俊, 姚敬明, 吴忻, 王娟萍, 孟帆, 韩一超, 樊振华, 米瑞娟, 罗甜甜, 温永亮. 猪繁殖与呼吸综合征病毒山西分离株ORF5基因的序列分析[J]. , 2013, 40(2): 10-13.

LIU Wen-jun, YAO Jing-ming, WU Xin, WANG Juan-ping, MENG Fan, HAN Yi-chao, FAN Zhen-hua, MI Rui-juan, LUO Tian-tian, WEN Yong-liang. Sequence Analysis of ORF5 Gene of Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus Isolated from Shanxi Area[J]. , 2013, 40(2): 10-13.

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