猪圆环病毒2型辽宁株全基因组克隆与序列分析

›› 2013, Vol. 40 ›› Issue (11): 26-29.

猪圆环病毒2型辽宁株全基因组克隆与序列分析

隋昀原, 荣柳, 陈美君, 朱耀才, 沈国顺

沈阳农业大学畜牧兽医学院, 辽宁沈阳 110866

收稿日期:2013-04-15 出版日期:2013-11-20 发布日期:2013-12-19
通讯作者: 沈国顺 E-mail:shenguoshun2000@126.com
作者简介:隋昀原(1987-),女,辽宁人,硕士生,研究方向:动物免疫学。
基金资助:
辽宁省科技计划项目(2011215014)。

Cloning and Sequence Analysis of Complete Genome of Porcine Circovirus Type 2 (PCV2) Liaoning Strain

SUI Yun-yuan, RONG Liu, CHEN Mei-jun, ZHU Yao-cai, SHEN Guo-shun

College of Animal Husbandry and Veterinary Medicine, Shenyang Agricultural University, Shenyang 110866, China

Received:2013-04-15 Online:2013-11-20 Published:2013-12-19

摘要/Abstract

摘要： 本试验从辽宁地区某猪场疑似患有断奶仔猪多系统衰竭综合征(PMWS)的猪群中采集病料,采用PCR方法进行猪圆环病毒2型(porcine circovirus type 2,PCV2)的检测,在此基础上对阳性病料进行PCV2全基因组克隆和序列分析。结果表明,PCV2辽宁分离株基因组全长为1768 bp,与国内外PCV2分离株的同源性为95.9%~99.5%,其中与丹麦分离株(EF565365)、澳大利亚分离株(AY424405)和江苏分离株(FJ158606)同源性最高,均为99.5%;与广东分离株(JX912915)同源性最低,为95.9%。

关键词: 猪圆环病毒2型; 全基因; 克隆; 序列分析

Abstract: In this study, some PMWS-suspected samples from a swine farm in Liaoning province were detected by PCR method,then we amplified the complete genome of PCV2 and made some sequence analysis. The results showed that the complete genome of PCV2 Liaoning strain was 1768 bp in length. The nucleotide homology between the PCV2 Liaoning strain and other strains ranged from 95.9% to 99.5%. Among these strains, the PCV2 Liaoning strain showed the highest homology with Denmark (EF565365), Australia (AY424405) and Jiangsu (FJ158606), all about 99.5%, the lowest homology was with Guangdong (JX912915) about 95.9%.

Key words: porcine circovirus type 2 (PCV2); complete genome; cloning; sequence analysis

中图分类号:

Q781

隋昀原, 荣柳, 陈美君, 朱耀才, 沈国顺. 猪圆环病毒2型辽宁株全基因组克隆与序列分析[J]. , 2013, 40(11): 26-29.

SUI Yun-yuan, RONG Liu, CHEN Mei-jun, ZHU Yao-cai, SHEN Guo-shun. Cloning and Sequence Analysis of Complete Genome of Porcine Circovirus Type 2 (PCV2) Liaoning Strain[J]. , 2013, 40(11): 26-29.

[1]	焦琳琳, 成玉婷, 吴庆国, 吴双, 吴植, 朱善元, 钱莺娟. 鸭坦布苏病毒Capsid蛋白原核表达及多克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(6): 2395-2402.
[2]	欧云文, 潘琴, 汪洋, 代军飞, 任绍科, 张洋, 张杰. 猪细小病毒6型ORF2基因的截短表达及多克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(6): 2487-2495.
[3]	刘佳隆, 张译文, 张悦然, 孙奇娟, 陈建, 何雷, 贾艳艳, 丁轲, 余祖华. 鸡ELAVL1基因克隆、原核表达及生物信息学分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(5): 1807-1817.
[4]	王雪平, 张孝俊, 李晓月, 王国栋, 张福良, 宋玉伟, 张明亮, 马磊. 高致病性禽腺病毒血清4型Hexon蛋白的原核表达及多克隆抗体的制备[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(5): 2053-2060.
[5]	余大新, 刘文静, 刘大鹏, 刘同, 张鹤, 盖凯, 李姝楠, 张贝贝, 侯水生, 周正奎. 鸭胸肌矿物元素含量全基因组关联分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1287-1295.
[6]	范冰峰, 李文, 刘理想, 赵向远, 邵静, 林乐丰, 孙慧敏, 张旭林, 许保增. 水貂AANAT基因克隆及生物信息学分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1307-1318.
[7]	刘红润, 朱思燃, 奉玲丽, 张坤, 颜港, 王钰滨, 张帅, 江山, 许迪, 兰干球, 梁晶. 大白猪CDO1基因克隆、生物信息学分析及组织表达定位[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1352-1363.
[8]	胡乐玉, 胡欣瑶, 李颖, 赵盛淼, 沈凤臻, 王长法, 李亮亮, 王彤彤, 任慧英. 德州驴HO-1基因生物信息学分析及多克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1499-1510.
[9]	王文婕, 茹鹏辉, 郁川, 杜付熙, 陈松彪, 尚珂, 张春杰, 程相朝. 猫细小病毒洛阳分离株VP2蛋白原核表达及多克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1511-1521.
[10]	王乐平, 潘艳, 谭奕舟, 李磊, 韩凯欧, 曹雅洁, 李军, 周雨晴, 廖玉英, 马东鑫, 龚俞, 彭昊, 王晓晔. 1株大肠杆菌噬菌体vB_EcoP_GN07的分离鉴定及全基因组分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1522-1531.
[11]	李翠函, 曲志娜, 高玉斌, 李彦, 王娟, 段笑笑, 王琳, 张喜悦, 赵格, 黄秀梅, 赵建梅, 张青青, 王君玮, 黄保续, 刘俊辉. 三类禽源碳青霉烯类耐药大肠杆菌流行病学调查及全基因组测序分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1653-1662.
[12]	黄巧辰, 廖彬如, 余春燕, 莫玉鹏, 黄炜乾, 李磊, 韩凯欧, 王乐平, 李珣, 王晓晔. 1株大肠杆菌噬菌体EP_H11的分离鉴定及生物学特性分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1684-1694.
[13]	张永杰, 隋志远, 张志帅, 王晨光, 李孝君, 邢凤. 多浪羊NPTX1基因克隆、生物信息学分析及在初情期的表达研究[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(3): 1048-1058.
[14]	刘新月, 栗利芳, 王振豹, 张文亮, 张欣, 赵洪涛, 李鹏宇, 郑昊天, 肖进, 齐鹏. 猪圆环病毒2型合成肽疫苗佐剂筛选与免疫保护性研究[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(3): 1068-1080.
[15]	刘可欣, 王超, 张傲, 刘佳利, 谭斌, 张淑琴. 牛病毒性腹泻病毒LN-1株的分离鉴定及基因组序列分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(3): 1150-1159.