2008-2009年部分地区新城疫病毒分离株的进化分析

›› 2011, Vol. 38 ›› Issue (8): 85-89.

2008-2009年部分地区新城疫病毒分离株的进化分析

尤永君^1,2, 王延树¹, 梁武¹, 杨保收¹, 李建丽¹, 邹立宏¹, 王和平¹, 乔健²

1. 瑞普(保定)生物药业有限公司,河北保定 071000;2. 中国农业大学动物医学院,北京 100193

收稿日期:2010-12-14 修回日期:1900-01-01 出版日期:2011-08-20 发布日期:2011-08-20

Sequence and Analyses on Newcastle Disease Virus from 2008 to 2009

YOU Yong-jun^1,2, WANG Yan-shu¹, LIANG Wu¹, YANG Bao-shou¹, LI Jian-li¹, ZOU Li-hong¹, WANG He-ping¹, QIAO Jian²

1. Ringpu (Baoding) Bio-Pharmaceutical Co.,Ltd.,Baoding 071000,China;2. College of Veterinary Medicine,China Agricultural University,Beijing 100193,China

Received:2010-12-14 Revised:1900-01-01 Online:2011-08-20 Published:2011-08-20

摘要/Abstract

摘要： 本研究旨在从分子水平上掌握中国新城疫病毒的变异情况和新城疫的流行规律,对2008-2009年从中国部分省市养殖场分离的9株新城疫病毒毒株,采用RT-PCR方法扩增其F和HN基因,经克隆和测序,对所得序列进行同源性和遗传进化分析。结果显示,9株分离株有8株为基因Ⅶ型,1株为基因Ⅱ型,F基因开放性阅读框架(ORF)为1662 bp,强毒株同La Sota的核苷酸同源性为83.5%~84.2%。HN基因开放性阅读框架(ORF)为1716或1734 bp,强毒株在538位缺失1个糖基化位点。结果表明,近年流行的ND疫情主要是由基因Ⅶ型NDV引起,F和HN基因的变异可能与频繁的疫苗免疫选择压力有关。

关键词: 新城疫病毒; F基因; HN基因; 序列分析; 基因型

Abstract: In order to explore the genetic mutations of the F gene and HN gene and the law of molecular epidemiology of Newcastle disease virus in China,nine influenza virus NDV were isolated from some poultry yards in China,the whole F and HN cDNA fragments of them were amplified by reverse transcription polymerase chain reaction,with primers specific to F gene and HN gene.After cloning and sequecing,gene sequences were analyzed on homology and heredity evolution.The sequence analysis showed 8 NDV isolates belonged to genotype Ⅶ,and 1 NDV isolates belonged to genotype Ⅱ.The F gene of NDV isolates had a 1662 bp open reading fragment (ORF) and the homology of the nucleotide of F gene is from 83.5% to 84.2%. The HN gene of NDV isolates had 1716 or 1734 bp.The glycosylation site of HN in virulent virus strains absence on 538 aa.The results revealed that Ⅶ genotype was the main genotype of NDV occurred in China now,variation of F gene and HN gene might be related to frequent vaccine selection pressure.

Key words: Newcastle disease virus (NDV); F gene; HN gene; sequence analysis; genotype

中图分类号:

S858.32

尤永君;王延树;梁武;杨保收;李建丽;邹立宏;王和平;乔健. 2008-2009年部分地区新城疫病毒分离株的进化分析[J]. , 2011, 38(8): 85-89.

YOU Yong-jun;WANG Yan-shu;LIANG Wu;YANG Bao-shou;LI Jian-li;ZOU Li-hong;WANG He-ping;QIAO Jian. Sequence and Analyses on Newcastle Disease Virus from 2008 to 2009[J]. China Animal Husbandry & Veterinary Medicine, 2011, 38(8): 85-89.

[1]	李天秀, 李昕鹏, 董新星, 兰国湘, 严达伟, 朱家位. 丽江猪HMOX2基因扩增、序列分析及组织表达研究[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(5): 2219-2231.
[2]	王珑欣, 于思梦, 鲁美希, 白向星, 侯水生. ABCG2基因不同基因型对蛋鸭蛋壳颜色、蛋品质和产蛋性能的影响[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(4): 1671-1680.
[3]	张学迪, 徐楷, 尹硕, 刘晶, 王仲浩, 秦建华, 吴鹏远, 王传文. 鸡皮刺螨羧酸酯酶2基因克隆、序列分析及其表达特征研究[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(7): 2973-2983.
[4]	汪文雅, 谢昕言, 闫大龙, 魏鹏浩, 杨建岭, 毕润, 李清, 马君, 邹丰才. 基于gdh基因分析云南牛源十二指肠贾第虫感染情况[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(6): 2644-2652.
[5]	黄丽清, 段安琴, 郑海英, 杨春艳, 尚江华. 水牛SFRP1基因序列分析、真核表达载体构建及组织表达分析[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(5): 1807-1818.
[6]	蒋立人, 冯贺龙, 姜鑫瑞, 王梓晨, 张高峰, 商雨, 曾哲, 姚伦, 汪宏才, 罗青平, 田光明, 温国元. 鸡胚免疫新城疫疫苗后宿主法氏囊转录组学分析[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(4): 1632-1641.
[7]	韩慧, 郭亚晶, 颜广智, 陈盛楠, 刘明杰, 莫美连, 黄良宗. 1株欧亚类禽猪流感病毒的分离鉴定及遗传进化分析[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(4): 1642-1650.
[8]	杨佳, 杨钦鸿, 王位, 张永仙, 代红炀, 尹红斌, 李素华. 云南野鸟源H9N2亚型AIV的遗传进化分析[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(11): 4899-4910.
[9]	毕峻铭, 董雅琴, 崔进, 沙洲, 顾丛丛, 郑辉, 魏荣, 孙福亮, 张锋, 张志宏. 山东地区1株牛病毒性腹泻病毒的分离鉴定及遗传进化分析[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(10): 4485-4499.
[10]	吴奥祺, 罗宇航, 任同伟, 王豪, 董覃婷, 覃一峰, 韦祖樟, 欧阳康, 陈樱, 黄伟坚, 潘艳, 李凤梅, 谢江. 广西地区1株牛细小病毒1型分离鉴定及遗传进化分析[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(10): 4540-4549.
[11]	窦俊峰, 汪最, 李丽, 卢琴, 金鑫鑫, 凌小淳, 罗青平, 翟新国. A、B、J亚群禽白血病病毒混合感染的鉴定及gp85基因序列分析[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(1): 302-311.
[12]	康丹菊, 彭秋云, 周嘉欣, 陈进军, 林红英, 周光现. 黄麻羽肉鸡β-防御素基因AvBD1和AvBD2克隆、生物信息学分析及组织表达[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(11): 4325-4337.
[13]	邢天琦, 许迪, 颜港, 王钰滨, 王梦影, 梁晶, 兰干球. 巴马小型猪ABCD4基因序列分析、真核表达载体构建及组织表达分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(11): 4338-4348.
[14]	李楠, 孟锦昕, 王建聂, 何于雯, 杨绍昌, 吕顺燕, 王静林. 牛结节性皮肤病病毒检测及蠓、蚊携带病毒调查[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(10): 4179-4187.
[15]	席静, 易继海, 王月丽, 徐朕宇, 李培东, 张江伟, 陈创夫. 牛A群轮状病毒G10型XJ-2022株分离鉴定及基因型分析[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(9): 3530-3538.