2011年—2014年广西猪流行性腹泻病毒检测及其M基因的序列分析

doi:10.11843/j.issn.1671-7236.2015.03.007

《中国畜牧兽医》---唯一指定的官方网站 ›› 2015, Vol. 42 ›› Issue (3): 549-557.doi: 10.11843/j.issn.1671-7236.2015.03.007

2011年—2014年广西猪流行性腹泻病毒检测及其M基因的序列分析

卢冰霞¹, 秦毅斌¹, 何颖¹, 李莹莹^1,2, 梁家幸¹, 黎珂钰^1,2, 李斌¹, 苏乾莲¹, 周英宁¹, 蒋冬福¹, 卢敬专¹, 闭炳芬¹, 梁保忠¹, 段群棚¹, 赵武¹

1. 广西兽医研究所, 广西畜禽疫苗新技术重点实验室, 南宁 530001;
2. 广西大学动物科学技术学院, 南宁 530005

收稿日期:2014-08-06 出版日期:2015-03-20 发布日期:2015-03-30
通讯作者: 赵武 E-mail:zhaowu168866@163.com
作者简介:卢冰霞(1986-),女,广西桂平人,硕士,助理研究员,研究方向:动物传染病病原与分子生物学,E-mail:lubingxia13@163.com
基金资助:
广西水产畜牧兽医局科研项目(桂渔牧科12049031);广西畜禽疫苗新技术重点实验室系统性研究课题(12-071-28-A-5);广西基本科研业务费专项(桂科专项14-2)

Detection of Porcine Epidemic Diarrhea Virus from 2011 to 2014 in Guangxi Provine and Sequence Analysis of their M Genes

LU Bing-xia¹, QIN Yi-bin¹, HE Ying¹, LI Ying-ying^1,2, LIANG Jia-xing¹, LI Ke-yu^1,2, LI Bin¹, SU Qian-lian¹, ZHOU Ying-ning¹, JIANG Dong-fu¹, LU Jing-zhuan¹, BI Bing-fen¹, LIANG Bao-zhong¹, DUAN Qun-peng¹, ZHAO Wu¹

1. Guangxi Key Laboratory of Animal Vaccines and New Technology, Guangxi Veterinary Research Institute, Nanning 530001, China;
2. College of Animal Science and Technology, Guangxi University, Nanning 530005, China

Received:2014-08-06 Online:2015-03-20 Published:2015-03-30

摘要/Abstract

摘要： 本试验应用RT-PCR方法对2011年1月—2014年4月采自广西南宁、玉林等14个地区的331份仔猪腹泻粪便样品进行猪流行性腹泻病毒(PEDV)检测.结果显示331份样品中有210份为PEDV阳性,阳性率为63.44%.对其中25份阳性样品的PEDV M基因进行克隆和测序,将测序结果与GenBank中PEDV参考毒株的M 基因序列进行同源性比对分析并构建系统进化树.25个PEDV M基因序列与51个参考毒株M基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为96.0%~99.9%、94.3%~99.6%.PEDV M基因遗传变异分析结果表明,广西2013年—2014年的PEDV流行毒株与北京、安徽、武汉、河北、广东等地2010年—2013年的流行毒株亲缘关系较近,而与中国早期分离株CH/S(GenBank登录号:JN547228)、疫苗株CV777(GenBank登录号:AF353511)和Attenuated DR13(GenBank登录号:JQ023162)的遗传距离较远.提示广西现流行的PEDV与早期毒株相比已发生较为明显的变异.

关键词: 猪流行性腹泻病毒(PEDV); M 基因; 遗传变异

Abstract: 331 piglets diarrhea fecal samples,collected from Nanning,Yulin and other 12 cites in Guangxi from January 2011 to April 2014,were used to detect porcine epidemic diarrhea virus (PEDV) by RT-PCR method.210 samples were PEDV positive,the positive rate was 63.44%.25 PEDV M genes were cloned from the PEDV positive samples.25 M genes were sequenced,analyzed and compared with 51 PEDV reference strains which were published in GenBank,and the phylogenetic tree was drew.The nucleotide and amino acid homologies of M gene were 96.0% to 99.9% and 94.3% to 99.6%,respectively.The genetic variation analysis of M gene showed that the PEDV prevalent strains of Guangxi province in 2013 to 2014 were genetically close to the prevalent strains of Beijing,Anhui,Wuhan,Hebei,Guangdong and other places of China from 2010 to 2013.But there were genetically different from the early Chinese isolates CH/S (GenBank No.JN547228),the vaccine strains CV777 (GenBank No.AF353511) and Attenuated DR13 (GenBank No.JQ023162).The results suggested that in recent years Guangxi PEDV epidemic strains had obvious variations compared with the early Chinese PEDV isolates.

Key words: porcine epidemic diarrhea virus (PEDV); M gene; genetic variation

中图分类号:

卢冰霞, 秦毅斌, 何颖, 李莹莹, 梁家幸, 黎珂钰, 李斌, 苏乾莲, 周英宁, 蒋冬福, 卢敬专, 闭炳芬, 梁保忠, 段群棚, 赵武. 2011年—2014年广西猪流行性腹泻病毒检测及其M基因的序列分析[J]. 《中国畜牧兽医》---唯一指定的官方网站, 2015, 42(3): 549-557.

LU Bing-xia, QIN Yi-bin, HE Ying, LI Ying-ying, LIANG Jia-xing, LI Ke-yu, LI Bin, SU Qian-lian, ZHOU Ying-ning, JIANG Dong-fu, LU Jing-zhuan, BI Bing-fen, LIANG Bao-zhong, DUAN Qun-peng, ZHAO Wu. Detection of Porcine Epidemic Diarrhea Virus from 2011 to 2014 in Guangxi Provine and Sequence Analysis of their M Genes[J]. , 2015, 42(3): 549-557.

参考文献

[1] Debouck P,Pensaert M.Experimental infection of pigs with a new porcine enteric coronavirus,CV777[J].Am J Vet Res,1980,41(2):219-223.

[2] Debouck P,Pensaert M,Coussement W.The pathogenesis of an enteric infection in pigs,experimentally induced by coronavirus-like agent,CV777[J].Vet Microbiol,1981,6(2):157-165.

[3] 林初文,庄金秋,谢印乾.我国主要猪病毒性腹泻疾病的特点及其防治对策[J].中国畜牧兽医,2007,34(5):121-123.

[4] Chasey D,Cartwright S F.Virus-like particles associated with porcine epidemic diarrhea[J].Res Vet Sci,1978,25(2):255-256.

[5] Pensaert M B,DeBouck P.A new coronavirus-like particles associated with diarrhea in swine[J].Arch Virol,1978,58:243-247.

[6] Sueyoshi M,Tsuda T,Yamazaki K,et al.An immunohistochemical investigation of porcine epidemic diarrhea[J].J Comp Pathol,1995,113(1):59-67.

[7] Xuan H,Xing D,Wang D,et al.Study on the culture of porcine epidemic diarrhea virus adapted to fetal porcine intestine primary cell monolayer[J].Chin J Vet Sci,1984,4:202-208.

[8] 田小艳,孙华,邓雨修,等.3种致猪腹泻病毒的多重RT-PCR检测[J].动物医学进展,2009,30(9):54-57.

[9] 杨敏.猪流行性腹泻病毒结构蛋白基因的克隆及特异性分析[D].兰州:甘肃农业大学,2006.

[10] 张红垒,董洁,梁亚冰,等.猪流行性腹泻病毒的RT-PCR鉴定及其M、N和E基因的序列分析[J].西北农业学报,2012,21(9):24-28.

[11] 王隆柏,吴学敏,车勇良,等.猪流行性腹泻病毒ORF3和M基因的克隆与序列分析[J].中国动物传染病学报,2012,20(3):67-72.

[12] Sun R,Cai R,Chen Y,et al.Outbreak of porcine epidemic diarrhea in suckling piglets,China[J].Emerg Infect Dis,2012,18:161.

[13] 杜坚,蒋玉雯,白安斌,等.广西猪流行性腹泻流行病学调查[J].动物科学与动物医学,2004,6:52-53.

[14] 甘海霞,梁晟,韦显凯,等.2011年广西猪群猪流行性腹泻和猪传染性胃肠炎调查[J].动物医学进展,2012,33(10):125-127.

[15] 郭旋,陈静,刘欢,等.广西仔猪腹泻病毒病原流行病学调查[J].南方农业学报,2013,44(1):155-160.

2011年—2014年广西猪流行性腹泻病毒检测及其M基因的序列分析

Detection of Porcine Epidemic Diarrhea Virus from 2011 to 2014 in Guangxi Provine and Sequence Analysis of their M Genes

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[1]	史秋颖, 段宝敏, 李颖, 牛登云, 耿晨阳, 周佳伟, 王蕊, 冯敬敬. 2020—2021年中国部分地区猪流行性腹泻病毒S1基因遗传变异分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(6): 2468-2478.
[2]	龙凤, 谢守玉, 崔鹏飞, 施开创, 韦显凯, 冯淑萍, 屈素洁, 陆文俊, 李剑锋, 尹彦文, 邓国华. 2016－2021年广西H9亚型禽流感病毒HA和NA基因遗传进化动态分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(5): 1947-1958.
[3]	韩大勇, 周春宝, 倪黎纲, 陈章言, 赵锦明. 苏姜猪mtDNA D-loop序列的遗传多样性分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1472-1479.
[4]	霍明凯, 关飞虎, 邱润辉, 魏春燕, 于海涛, 朱嘉乐, 张辉. DDX1影响猪流行性腹泻病毒复制的机制研究[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1556-1566.
[5]	刘家兴, 韩雪英, 张鑫茹, 邓嘉昕, 姚伦广, 刘阳坤. 携带猪流行性腹泻病毒抗原表位的铁蛋白纳米颗粒制备与免疫原性分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1567-1574.
[6]	王帅杰, 谭子涵, 李晗博, 孙香雪, 艾思含, 王蕾, 赵迪, 侯永清. 槲皮素对PEDV感染幼龄仔猪肠道形态、抗氧化功能及空肠脂质代谢基因表达的影响[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(9): 3391-3399.
[7]	汪曼丽, 谭子涵, 王帅杰, 李倩, 曾一桐, 王蕾, 赵迪, 张倩, 侯永清. 槲皮素对PEDV感染幼龄仔猪的生长性能、血液生化指标和肠道吸收与屏障功能的影响[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(9): 3411-3418.
[8]	翟新国, 郑培培, 苏金辉, 李庆阳, 焦贺静, 张若冰, 李朋辉. 猪流行性腹泻病毒HB/HEBEU/2020株全基因组遗传变异与重组分析[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(8): 3140-3150.
[9]	宋诗莹, 郭玮璐, 夏学峰, 张雪, 毕振威, 张雪寒, 范宝超, 董海龙, 李彬. 猪IFN-δ5的表达纯化及其抗PEDV感染的作用分析[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(8): 3171-3179.
[10]	刘雨桐, 姚妍婷, 黎芮伶, 韩文琪, 石婷, 王一丹, 任玉鹏. 中国西南部分地区2020－2021年猪流行性腹泻病毒遗传变异分析[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(6): 2279-2290.
[11]	张鑫杰, 薛少华, 吕紫欣, 黄喜荣, 陈羽璇, 范克伟, 杨小燕, 戴爱玲. 闽粤地区PPV7与PCV2的混合感染调查及PPV7 Cap基因的遗传变异分析[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(6): 2291-2297.
[12]	王梓行, 邓兴梅, 邱润辉, 朱德馨, 李佳, 陶婷婷, 朱嘉乐, 孙志华, 张辉. 长链非编码RNA在PEDV感染Vero-E6细胞中对自噬的调控作用[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(5): 1942-1950.
[13]	张明亮, 耿亚春, 连凯琪, 马磊, 常莹, 王双山, 张福良. 猪流行性腹泻病毒截短M基因克隆、生物信息学分析及其截短片段表达[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(4): 1479-1487.
[14]	颜忠, 杨汉春. 2018-2020年中国部分省市猪流行性腹泻病毒S1基因的监测及遗传变异分析[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(2): 424-434.
[15]	陶志云, 朱春红, 刘宏祥, 施祖灏, 章双杰, 徐文娟, 宋卫涛, 王志成, 李慧芳. 鸭产蛋量相关遗传变异和功能基因筛选及鉴定[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(11): 4107-4118.