粪便DNA中筛选普氏原羚微卫星引物并应用于个体识别

›› 2009, Vol. 36 ›› Issue (2): 68-71.

粪便DNA中筛选普氏原羚微卫星引物并应用于个体识别

洪艳云^1,2，李迪强²，易图永¹，张于光²，刘毅¹

（1.湖南农业大学，长沙 410128； 2.中国林业科学院森林生态环境与保护研究所，北京 100091）

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2009-02-20 发布日期:2009-02-20
通讯作者: 李迪强

Screening Microsatellite Primers and their Application for Individual Identification in Faecal DNA from Procapra praprzewalski

HONG Yan-yun1,2, LI Di-qiang2, YI Tu-yong1, ZHANG Yu-guang2, LIU Yi1

（1.Hunan Agricultural University,Changsha 410128,China; 2.Institute of Forestry Ecology, Environment and Protection, Chinese Academy of Forestry,Beijing 100091,China)

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2009-02-20 Published:2009-02-20
Contact: LI Di-qiang

摘要/Abstract

摘要： 为了更好地保护极度濒危的普氏原羚物种，选择非损伤性样品——粪便作为研究材料,应用10对非洲糜羚微卫星引物和10对绵羊微卫星引物对普氏原羚的基因组DNA进行PCR扩增，通过聚丙烯酰胺凝胶电泳，结果发现，有8对引物在普氏原羚基因组DNA中扩增出了多态性位点。各位点基因杂合度介于0.71~0.84，平均杂合度为0.78，有效等位基因数介于 3.40~6.59，平均有效等位基因为5.98，同时利用这8对多态性引物对39个粪便样品的个体进行识别，结果发现这39个粪便样品来自35个不同的个体。

关键词: 普氏原羚; 微卫星; 个体识别; 粪便DNA

Abstract:

To protect Procapra praprzewalskii appointed as CR (Critically Endangered), twenty pairs of microsatellite primers from Granti’s gazelle and sheep separately were used to identify the individual of przewalskii gazelle through PCR method, we found that 8 loci were polymorphic. The values of gene heterozygosity is 0.71~0.84, the values of effective number of alleles is 3.40~6.59. At the same time, we took advantage of the 8 loci to identify 35 individuals from 39 faecal samples from Procapra praprzewalskii

Key words: Pracapra praprzewalskii; microsatellite; individual identification; faecal DNA

中图分类号:

Q754

洪艳云;李迪强;易图永;张于光;刘毅 . 粪便DNA中筛选普氏原羚微卫星引物并应用于个体识别 [J]. , 2009, 36(2): 68-71.

HONG Yan-yun;LI Di-qiang;YI Tu-yong;ZHANG Yu-guang;LIU Yi. Screening Microsatellite Primers and their Application for Individual Identification in Faecal DNA from Procapra praprzewalski[J]. , 2009, 36(2): 68-71.

[1]	彭阳翔, 杨振标, 闫奎友, 王瀚, 呼德, 王尊, 刘宁, 赵连生. 从人工到智能:牛个体识别技术研究进展[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(5): 1855-1866.
[2]	庄明亮, 李剑飞, 葛蓬, 王琦, 王志, 戚竞文, 牛庆生, 李志勇. 长白山中华蜜蜂遗传多样性分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(12): 4992-4999.
[3]	张强, 洛桑顿珠, 巴桑旺堆, 彭阳洋, 俄广鑫, 尼玛次仁, 索朗多吉, 巴多, 旦巴, 鲜莉莉, 旦巴加参, 支张, 平措占堆. 利用微卫星遗传标记评估5个西藏牦牛群体遗传多样性及群体结构[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(6): 2228-2238.
[4]	胡明月, 刘正喜, 赵中利, 曹阳, 马惠海, 闫守庆. 绵羊(ATAG)_n四碱基微卫星位点的筛选及其在亲子鉴定中的应用[J]. 中国畜牧兽医, 2021, 48(7): 2484-2494.
[5]	李彬, 任亭亭, 邱梅玉, 李志强, 阎晓菲, 韩冰, 刘明军, 贺三刚, 依明·苏来曼. 基于微卫星多重PCR技术的特克塞尔×哈萨克杂交羊亲子鉴定[J]. 中国畜牧兽医, 2020, 47(7): 2171-2180.
[6]	迟浩斌, 郎侠, 王彩莲, 刘立山. 盘羊及其杂交后代微卫星遗传多样性分析[J]. 中国畜牧兽医, 2020, 47(4): 1109-1120.
[7]	赵志达, 王欣悦, 石田培, 胡文萍, 尚明玉, 张莉. 基于微卫星标记鉴定湖羊家系[J]. 中国畜牧兽医, 2020, 47(11): 3573-3583.
[8]	张瑞, 郎侠, 吴建平, 刘婷, 宫旭胤, 王彩莲, 迟浩斌, 梁婷玉. 岷县黑裘皮羊微卫星遗传多样性分析[J]. 《中国畜牧兽医》, 2019, 46(8): 2360-2370.
[9]	迟浩斌, 韩向敏, 郎侠, 王彩莲. 早胜牛微卫星多态性及其与生长性状的关联分析[J]. 《中国畜牧兽医》, 2019, 46(7): 1976-1985.
[10]	王敏, 张新浩, 崔冉, 刘宇, 杨莉, 李海静, 赵春江. 利用微卫星标记鉴定德州驴亲子关系[J]. 《中国畜牧兽医》, 2019, 46(7): 2003-2011.
[11]	吴盈萍, 高凤, 彭箫, 王俊花, 米思佳, 孙苗, 刘晓晓, 李海英, 卢立志. 利用微卫星标记分析伊犁鹅的保种效果[J]. 《中国畜牧兽医》, 2019, 46(6): 1746-1755.
[12]	乌仁套迪, 白俊艳, 巴拉, 周俊文, 张文彬. 阿拉善戈壁双峰驼的微卫星多态性与体尺性状关联分析[J]. 《中国畜牧兽医》, 2018, 45(7): 1881-1890.
[13]	欧阳依娜, 江炎庭, 孙利民, 袁跃云, 李东江, 梁家充, 洪琼花. 10个云南地方猪种微卫星遗传多样性分析[J]. 《中国畜牧兽医》, 2018, 45(4): 992-1001.
[14]	刘延鑫, 孙宇, 李业亮, 翟磊, 郝万清, 高腾云. 2个与HSP70基因连锁的微卫星座位与牛运输应激性状的关联分析[J]. 《中国畜牧兽医》, 2018, 45(2): 456-462.
[15]	俞春英, 杨燕燕, 周建华, 林玮, 王训立. 3个品种兔微卫星标记的遗传多样性研究[J]. 《中国畜牧兽医》, 2018, 45(12): 3486-3496.