江苏地方山羊品种H-FABP基因的SNPs检测及群体遗传学分析

›› 2012, Vol. 39 ›› Issue (3): 159-162.

江苏地方山羊品种H-FABP基因的SNPs检测及群体遗传学分析

王兰萍¹, 耿荣庆¹, 冀德君², 常洪²

1. 盐城师范学院生命科学与技术学院,江苏盐城 224051;2. 扬州大学动物科学与技术学院,江苏扬州 225009

收稿日期:2011-08-14 修回日期:1900-01-01 出版日期:2012-03-20 发布日期:2012-03-20
通讯作者: 常洪

SNPs Detection and Genetic Analysis on H-FABP Gene of Jiangsu Local Goat Breeds

WANG Lan-ping¹, GENG Rong-qing¹, JI De-jun², CHANG Hong²

1. College of Life Science and Technology,Yancheng Teachers University,Yancheng 224051,China;2. College of Animal Science and Technology,Yangzhou University,Yangzhou 225009,China

Received:2011-08-14 Revised:1900-01-01 Online:2012-03-20 Published:2012-03-20

摘要/Abstract

摘要： 采用PCR-SSCP和DNA测序技术对2个江苏地方山羊品种的心脏型脂肪酸结合蛋白(heart fatty acid binding protein,H-FABP)基因进行单核苷酸多态性(SNP)检测和群体遗传学分析。结果表明,在所扩增的片段中,仅在H-FABP基因外显子2的第132位检测到G/C碱基突变,形成GG和GC基因型,2个山羊群体均是纯合GG基因型占主导优势,且该位点处于Hardy-Weinberg平衡状态;黄淮山羊群体的杂合度、有效等位基因数和多态信息含量指标均高于长江三角洲白山羊群体,表明其群体内的遗传变异程度相对较大、遗传多样性也更为丰富。

关键词: 山羊; H-FABP基因; SNPs; PCR-SSCP

Abstract: PCR-SSCP and DNA sequencing approaches were applied to assess the single nucleotide polymorphisms (SNPs) and analyze the population genetics of heart fatty acid binding protein (H-FABP) gene of two goat breeds in Jiangsu province. The results showed that only the 132 G/C mutation was detected at the H-FABP gene exon 2 of the amplified fragments, with the formation of GG and GC genotypes. Homozygous GG was the dominant genotype of two goat groups, and the locus was at Hardy-Weinberg equilibrium. Heterozygosity, effective number of alleles and polymorphism information content of Huanghuai goat population was higher than the Yangtze River Delta white goat populations, indicating a relatively large degree of genetic variation and more abundant genetic diversity within population.

Key words: goat; H-FABP gene; SNPs; PCR-SSCP

中图分类号:

王兰萍;耿荣庆;冀德君;常洪. 江苏地方山羊品种H-FABP基因的SNPs检测及群体遗传学分析[J]. , 2012, 39(3): 159-162.

WANG Lan-ping;GENG Rong-qing;JI De-jun;CHANG Hong. SNPs Detection and Genetic Analysis on H-FABP Gene of Jiangsu Local Goat Breeds[J]. , 2012, 39(3): 159-162.

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