克隆猪印迹基因IGF2/H19印迹控制区的甲基化状态

›› 2011, Vol. 38 ›› Issue (11): 125-131.

克隆猪印迹基因IGF2/H19印迹控制区的甲基化状态

吴志强^1,2,3, 谢一妮^1,2,3, 张廷宇^1,2, 戴建军^1,2, 吴彩凤^1,2, 马恒东³, 张德福^1,2

1. 四川农业大学生命科学与理学院,四川雅安 625014;2. 上海农业科学院畜牧兽医研究所,上海 201106;3. 上海农业遗传育种重点实验室动物遗传工程研究室,上海 201106

收稿日期:2011-04-06 修回日期:1900-01-01 出版日期:2011-11-20 发布日期:2011-11-20
通讯作者: 张德福,马恒东

The Methylation Status of IGF2/H19 Imprinting Control Region in Cloned Pig

WU Zhi-qiang^1,2,3, XIE Yi-ni^1,2,3, ZHANG Ting-yu^1,2, DAI Jian-jun^1,2, WU Cai-feng^1,2, MA Heng-dong³, ZHANG De-fu^1,2

1. College of Life and Basic Sciences,Sichuan Agricultural University,Ya'an 625014,China;2. Institute of Animal Science and Veterinary Medicine,Shanghai Academy of Agricultural Sciences,Shanghai 201106,China;3. Division of Animal Genetic Engineering,Shanghai Municipal Key Laboratory of Agri-genetics and Breeding,Shanghai 201106,China

Received:2011-04-06 Revised:1900-01-01 Online:2011-11-20 Published:2011-11-20

摘要/Abstract

摘要： 为了探求核移植过程中DNA甲基化重编程是否充分,运用亚硫酸氢盐测序法分别检测新生死亡克隆猪和同期正常猪心脏、肝脏、脾脏、肺脏和肾脏组织中IGF2/H19基因印迹控制区(DMR1、DMR2、DMR3)的甲基化状态。结果发现,DMR1、DMR3在克隆猪和正常猪各组织中的甲基化水平不同,但差异不显著(P＞0.05)。DMR2在克隆猪肺脏组织表现为超甲基化,极显著高于正常猪(P＜0.01),且10个测序克隆中存在2处连续的全甲基化CpG位点(分别为4－9位和12－17位),而在其它组织中甲基化差异不显著(P＞0.05)。说明DMR2在克隆猪肺脏组织可能存在DNA甲基化重编程紊乱,这也可能是导致该克隆猪死亡的因素之一。

关键词: 差异甲基化区; DNA甲基化; 体细胞克隆; 表观重编程

Abstract: In order to make sure whether the DNA methylation reprogramming is efficient in SCNT animals,we analyzed the DNA methylation status of IGF2/H19 imprinting control region (DMR1,DMR2,DMR3) in heart,liver,spleen,lung and kidney of cloned pig using bisulfite sequencing analysis. The results demonstrated that the methylation level of DMR1 and DMR3 in dead cloned pig tissues were different from that of normal pig,but there was no significant differences among them (P＞0.05);The DMR2 showed hypermethylation in the lung of the dead cloned pig,and was significantly higher than that in the control(P＜0.01).Also,the tested CpGs sites from 4 to 9 and 12 to 17 exhibited full methylation. There was no significant differences among other tissues in the DMR2 (P＞0.05). Results showed that the abnormal DNA methylation proflies of DMR2 may occurred in the lung of cloned pig,which may be one of the factors for the death of cloned animals.

Key words: differentially methylated regions; DNA methylation; somatic cell cloning; epigenetic reprogramming

中图分类号:

吴志强;谢一妮;张廷宇;戴建军;吴彩凤;马恒东;张德福;. 克隆猪印迹基因IGF2/H19印迹控制区的甲基化状态[J]. , 2011, 38(11): 125-131.

WU Zhi-qiang;;XIE Yi-ni;;ZHANG Ting-yu;DAI Jian-jun;WU Cai-feng;MA Heng-dong;ZHANG De-fu;. The Methylation Status of IGF2/H19 Imprinting Control Region in Cloned Pig[J]. , 2011, 38(11): 125-131.

[1]	徐盼, 仲德, 马政, 刘林雨, 王怡晖, 赵旭庭. 基于全基因组差异甲基化分析鉴别影响苏姜猪体重的候选基因[J]. 中国畜牧兽医, 2021, 48(8): 2889-2900.
[2]	薛倩, 李国辉, 张会永, 殷建玫, 周成浩, 朱云芬, 邢伟杰, 苏一军, 邹剑敏, 韩威. 狼山鸡下丘脑和卵巢组织全基因组DNA甲基化分析[J]. 中国畜牧兽医, 2021, 48(2): 417-424.
[3]	任晓丽, 范玉营, 皇甫和平, 董青, 石冬梅, 刘云. 表观遗传调控机制在犬肿瘤中的研究进展[J]. 中国畜牧兽医, 2021, 48(11): 4319-4326.
[4]	张辉, 李晓雨, 狄冉, 刘玉芳, 储明星. AANAT基因在滩羊不同繁殖时期卵巢中的转录差异及DNA甲基化程度分析[J]. 中国畜牧兽医, 2021, 48(1): 226-234.
[5]	杜建文, 杨雪梅, 王丹, 朱桦, 何军敏, 阿布来提·苏来曼, 田月珍, 赵冰茹, 徐新明, 付雪峰, 哈尼克孜·吐拉甫, 吴伟伟, 田可川, 黄锡霞. ITGB2基因在苏博美利奴羊不同细度皮肤组织中的DNA甲基化及mRNA表达水平分析[J]. 中国畜牧兽医, 2020, 47(4): 1009-1017.
[6]	徐友信, 李宗珍, 王杰, 张乃锋. 蛋氨酸对动物表型性状的影响及DNA甲基化调控机制的研究进展[J]. 《中国畜牧兽医》, 2019, 46(4): 1108-1115.
[7]	王鹤洁, 秦本源, 王媛媛, 郭玉龙, 宋鹏康, 刘亚丹, 乐宝玉, 张宁芳, 成志敏, 高鹏飞, 郭晓红, 李步高, 曹果清. DNA甲基化与去甲基化调控脂肪沉积的研究进展[J]. 《中国畜牧兽医》, 2019, 46(2): 519-525.
[8]	王文娟, 岳媛, 安磊, 田见晖. 早期胚胎DNA甲基化研究进展[J]. 《中国畜牧兽医》, 2018, 45(9): 2531-2536.
[9]	曹俊国, 魏海军, 许保增. 哺乳动物生殖细胞冷冻保存对其DNA甲基化影响的研究进展[J]. 《中国畜牧兽医》, 2017, 44(3): 819-824.
[10]	姚力丹, 祖玲玲, 马晓燕, 依明·苏来曼, 决肯·阿尼瓦什. 新疆巴什拜羊肌肉生长抑制素基因DNA甲基化与mRNA表达量分析[J]. 《中国畜牧兽医》, 2017, 44(10): 2987-2993.
[11]	粟小平, 肖宁, 罗西尔, 雷薇, 崔奎青, 石德顺, 刘庆友. 水牛MBD3基因克隆分析及其真核表达载体的构建[J]. 《中国畜牧兽医》, 2016, 43(8): 1951-1959.
[12]	张恬, 张龙超, 王立刚, 王立贤. 猪脂肪沉积候选基因AOC3、PPARG1及SOD3 DNA甲基化差异研究[J]. 《中国畜牧兽医》, 2016, 43(11): 2820-2825.
[13]	徐礼杰, 孙武胜, 胡德宝, 方南洙, 李钟淑, 李福俊. 延边黄牛体细胞核移植的研究进展[J]. , 2015, 42(10): 2739-2744.
[14]	王梦楠，张明月，李宁，李世杰. ASCL2基因在体细胞克隆牛和自然繁殖牛肺脏中的甲基化分析[J]. 中国畜牧兽医, 2014, 41(8): 71-75.
[15]	郑宜文, 王春梅, 高学军, 李庆章. DNA甲基化与奶牛乳腺泌乳调控的研究进展[J]. , 2013, 40(1): 179-182.