不同物种CLPG基因部分序列生物信息分析及山羊染色体电子定位

›› 2007, Vol. 34 ›› Issue (10): 56-59.

不同物种CLPG基因部分序列生物信息分析及山羊染色体电子定位

沈祖楠，李祥龙，周荣艳，李兰会

河北农业大学动物科技学院，保定 071001

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2007-10-20 发布日期:2007-10-20

Bioinformatics Analysis of Partial CLPG Gene Sequences among Different Species and Chromosome Position Prediction of Goat

SHEN Zunan，LI Xianglong，ZHOU Rongyan，LI Lanhui


College of Animal Science and Technology, Agricultural University of Hebei, Baoding 071001,China

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2007-10-20 Published:2007-10-20

摘要/Abstract

摘要： 作者应用比较基因组学和生物信息学方法比较了绵羊、山羊、牛、狗、马、兔子、猪、挪威鼠的CLPG基因部分序列，并对该基因的遗传多样性和遗传分化进行了分析。结果表明，在被比对的12个基因序列中检测到176个多态位点，物种间及物种内的CLPG基因存在较丰富的遗传多样性。通过物种间生物信息分析将CLPG基因定位于山羊21号染色体。

关键词: CLPG基因; 生物信息; 山羊; 染色体定位

Abstract: Part of CLPG gene sequences of Ovis aries, Capra hircus, Bos taurus, Canis familiaris, Equus caballus, Oryctolagus cuniculus, Sus scrofa and Rattus norvegicuswas analyzed using the method of comparative genomics and bioinformatics in this paper. The results showed that a total of 176 polymorphic sites were detected from 12 sequences. More nucleotide diversity and amino acid diversity of the CLPG gene existed within and among species. The goat CLPG gene was predicted at chromosome 21 by bioinformatics analysis among species.

Key words: CLPG gene; bioinformatics; goat; chromosome position

中图分类号:

Q811.4

沈祖楠;李祥龙;周荣艳;李兰会. 不同物种CLPG基因部分序列生物信息分析及山羊染色体电子定位[J]. , 2007, 34(10): 56-59.

SHEN Zunan;LI Xianglong;ZHOU Rongyan;LI Lanhui. Bioinformatics Analysis of Partial CLPG Gene Sequences among Different Species and Chromosome Position Prediction of Goat [J]. , 2007, 34(10): 56-59.

[1]	王赛桥, 赵路, 翟振翰, 张丙雷, 贾万航, 王玉琴. 绵羊miR-449a/b前体序列组织表达及生物信息学分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(6): 2175-2184.
[2]	韦明邦, 边巴琼达, 肖青青, 段梦琪, 强巴央宗, 商鹏. 藏猪CDKN1B基因克隆、生物信息学及表达分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(6): 2196-2206.
[3]	吕春荣, 梁家充, 邵庆勇, 吴国权, 张玉梅, 权国波. 丙酮酸钠对山羊冷冻精子质量的影响[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(6): 2363-2369.
[4]	李永彬, 杨惠琳, 宋子豪, 张昱, 杨瑾, 孟佳, 崔小珍, 吕晓玲, 郑明学, 白瑞. 柔嫩艾美耳球虫MIF基因克隆及生物信息学分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(6): 2450-2459.
[5]	张殿琦, 马鑫浩, 杨志梅, 梅楚刚, 昝林森. 秦川肉牛PAI1基因生物信息学分析及其对肌内脂肪细胞增殖和分化的影响[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(5): 1729-1741.
[6]	李佳富, 莫小兵. 多杀性巴氏杆菌CRISPR-Cas系统生物信息学分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(5): 1742-1753.
[7]	王浩睿, 禹保军, 杨嘉翊, 魏榕, 付希, 王川川, 张迪, 李德生, 蔡正云, 顾亚玲, 张娟. 静原鸡DERA基因生物信息学分析及组织表达研究[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(5): 1764-1773.
[8]	陈玫婷, 郑从森, 梁泽贤, 林巧儿, 常传哲, 周俊, 冯军, 李林林, 覃丽梅. 1株J亚群禽白血病病毒env基因克隆及生物信息学分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(5): 1785-1795.
[9]	潘鹏丞, 雷宗全, 李显, 胡湘云, 秦谦涛, 覃兆鲜, 关志惠, 陈宝剑, 谢炳坤. 陆川猪MYL2基因生物信息学分析、真核表达载体构建及组织表达研究[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(5): 1796-1806.
[10]	刘佳隆, 张译文, 张悦然, 孙奇娟, 陈建, 何雷, 贾艳艳, 丁轲, 余祖华. 鸡ELAVL1基因克隆、原核表达及生物信息学分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(5): 1807-1817.
[11]	卓娜, 朱忠武, 李静, 胡世享, 王建昌, 林华, 陈朝林, 韩佃刚, 艾军, 陈培富. 猪源戊型肝炎病毒ORF2蛋白生物信息学分析及真核表达研究[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(5): 1959-1970.
[12]	陶庆华, 黄彩云, 陈超, 刘威, 孙宁宁, 李昂. 白羽番鸭LIF基因克隆及其组织表达差异分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1296-1306.
[13]	范冰峰, 李文, 刘理想, 赵向远, 邵静, 林乐丰, 孙慧敏, 张旭林, 许保增. 水貂AANAT基因克隆及生物信息学分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1307-1318.
[14]	贾新月, 马静, 张艳艳, 马勋, 王正荣, 薄新文. 细粒棘球绦虫EGR-07243和EGR-07244基因生物信息学分析及原核表达[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(3): 847-858.
[15]	李丹, 张海森, 王逸群, 高登科, 赵泓淙, 李超, 靳亚平, 陈华涛. 奶牛CRY1基因真核表达载体构建、生物信息学分析及组织表达谱研究[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(3): 870-881.