乌珠穆沁羊生长分化因子11基因外显子1序列CpG位点的甲基化模式分析

doi:10.16431/j.cnki.1671-7236.2016.02.007

›› 2016, Vol. 43 ›› Issue (2): 333-339.doi: 10.16431/j.cnki.1671-7236.2016.02.007

乌珠穆沁羊生长分化因子11基因外显子1序列CpG位点的甲基化模式分析

何小龙¹, 李蓓², 付绍印¹, 刘永斌¹, 祁云霞¹, 王标¹, 特日格勒¹, 荣威恒¹, 达赖¹

1. 内蒙古自治区农牧业科学院, 呼和浩特 010031;
2. 内蒙古农业大学动物科学学院, 呼和浩特 010018

收稿日期:2015-08-14 出版日期:2016-02-20 发布日期:2016-03-02
通讯作者: 刘永斌 E-mail:ybliu117@126.com
作者简介:何小龙(1983-),男,陕西宝鸡人,博士,副研究员,研究方向:生物技术与草食家畜育种,Tel:0471-5303209;E-mail:hexiaolong1983@163.com
基金资助:
内蒙古自治区农牧业科学院青年创新基金(2013QNJJM01);国家肉羊产业技术体系(CARS-39);内蒙古自治区农牧业科学院创新基金(2015CXJJM02)

Analysis of the CpG Methylation Pattern on GDF11 Gene Exon 1 in Ujumqin Sheep

HE Xiao-long¹, LI Bei², FU Shao-yin¹, LIU Yong-bin¹, QI Yun-xia¹, WANG Biao¹, TERI Gele¹, RONG Wei-heng¹, DA Lai¹

1. Inner Mongolia Academy of Agricultural & Animal Husbandry Sciences, Hohhot 010031, China;
2. College of Animal Science, Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot 010018, China

Received:2015-08-14 Online:2016-02-20 Published:2016-03-02

摘要/Abstract

摘要： 为了探讨乌珠穆沁羊生长分化因子11 (growth differentiation factor 11,GDF11)基因外显子1的甲基化模式,本研究采用亚硫酸氢盐测序PCR (BSP)的方法对普通乌珠穆沁羊和多脊椎乌珠穆沁羊GDF11基因外显子1的甲基化水平进行检测,通过检测发现普通乌珠穆沁羊GDF11基因外显子1的平均甲基化率为0.123,多脊椎乌珠穆沁羊的平均甲基化率为0.569,差异显著性检验表明这两组数据间差异极显著(P<0.01),即多脊椎乌珠穆沁羊GDF11基因外显子1中的CpG甲基化率极显著高于普通乌珠穆沁羊(P<0.01).通过分析GDF11基因外显子1的13个CpGs位点发现,多脊椎乌珠穆沁羊CpG_11和CpG_13位点的甲基化率值最高,达到90%,推测这两个位点的甲基化可能与乌珠穆沁羊的脊椎数增加有关,是导致多脊椎发生的主要原因.

关键词: 乌珠穆沁羊; GDF11基因; CpG位点; 甲基化; 亚硫酸氢盐测序

Abstract: In order to investigate the methylation patterns on growth differentiation factor 11 (GDF11) gene exon 1 in Ujumqin sheep,we compared the level of methylation of GDF11 gene exon 1 in common Ujumqin sheep (CUS) and multi-vertebrae Ujumqin sheep (MUS) using the bisulfite sequencing PCR (BSP) method.The results showed that the average methylation rate of GDF11 gene exon 1 for MUS was extremely significantly higher than that for CUS (P<0.01),the average methylation rate of common Ujumqin sheep and multi-vertebrae Ujumqin sheep were 0.123 and 0.569.Analysis of 13 CpGs of GDF11 gene exon 1 showed that the CpG_11 and CpG_13 methylation sites had the highest methylation rate with a combined methylation value of 90% for MUS.Our results suggested that differential DNA methylation of GDF11 gene exon 1,in particular at these two sites,might cause the increase in the number of vertebrae in Ujumqin sheep.

Key words: Ujumqin sheep; GDF11 gene; CpG site; methylation; bisulfite sequencing

中图分类号:

S826.8⁺2

何小龙, 李蓓, 付绍印, 刘永斌, 祁云霞, 王标, 特日格勒, 荣威恒, 达赖. 乌珠穆沁羊生长分化因子11基因外显子1序列CpG位点的甲基化模式分析[J]. , 2016, 43(2): 333-339.

HE Xiao-long, LI Bei, FU Shao-yin, LIU Yong-bin, QI Yun-xia, WANG Biao, TERI Gele, RONG Wei-heng, DA Lai. Analysis of the CpG Methylation Pattern on GDF11 Gene Exon 1 in Ujumqin Sheep[J]. , 2016, 43(2): 333-339.

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乌珠穆沁羊生长分化因子11基因外显子1序列CpG位点的甲基化模式分析

Analysis of the CpG Methylation Pattern on GDF11 Gene Exon 1 in Ujumqin Sheep

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