钩棘单睾吸虫和扇棘单睾吸虫ITS2序列测定及其种系发育分析

doi:10.16431/j.cnki.1671-7236.2015.08.004

›› 2015, Vol. 42 ›› Issue (8): 1943-1949.doi: 10.16431/j.cnki.1671-7236.2015.08.004

钩棘单睾吸虫和扇棘单睾吸虫ITS2序列测定及其种系发育分析

梅雪芳¹, 李树清², 胡长红¹, 黄腾飞³, 陈志飞², 黄维义¹

1. 广西大学动物科技学院, 南宁 530005;
2. 上海出入境检验检疫局, 上海 200135;
3. 罗氏诊断产品(上海)有限公司, 上海 200335

修回日期:2015-04-15 出版日期:2015-08-20 发布日期:2015-08-27
通讯作者: 黄维义 E-mail:wyhuang@gxu.edu.cn
作者简介:梅雪芳(1990-),女,河南驻马店人,硕士生,研究方向:动物寄生虫学与分子免疫学,E-mail:384280442@qq.com
基金资助:
上海出入境检验检疫局科研项目(HK002-2014);国家质检总局科技专项(2010IK013)

ITS2 Sequencing and Phylogenetic Analysis of Haplorchis pumilio and H.taichui

MEI Xue-fang¹, LI Shu-qing², HU Chang-hong¹, HUANG Teng-fei³, CHEN Zhi-fei², HUANG Wei-yi¹

1. College of Animal Science and Technology, Guangxi University, Nanning 530005, China;
2. Shanghai Entry-exit Inspection and Quarantine Bureau, Shanghai 200135, China;
3. Roche Diagnostics (Shanghai) Limited, Shanghai 200335, China

Revised:2015-04-15 Online:2015-08-20 Published:2015-08-27

摘要/Abstract

摘要： 本试验将从犬猫肠道中分离的钩棘单睾吸虫和扇棘单睾吸虫用盐酸卡红染色后观察其形态学特征;PCR扩增其ITS2基因序列并测序,并将测序结果与GenBank同属异形科的多棘单睾吸虫和横川后殖吸虫序列进行比对;应用Mega 6.05软件采用邻位相连法构建种系发育树进行分析。盐酸卡红染色后显示,钩棘单睾吸虫和扇棘单睾吸虫各形态学特征符合经典的分类学描述。PCR测序后获得钩棘单睾吸虫和扇棘单睾吸虫ITS2序列长度分别为295和297 bp,G+C含量分别为49.5%(146/295)和54.2%(161/297)。提交至GenBank后获得登录号分别为钩棘单睾吸虫KJ137221~KJ137223,KP165437~KP165439;扇棘单睾吸虫KP165440。序列比对结果显示,钩棘单睾吸虫和扇棘单睾吸虫种内差异性为0,4种异形吸虫种间差异为15.2%~28.9%。基于ITS2序列建立的种系发育树显示钩棘单睾吸虫和扇棘单睾吸虫构成自展值为78%的拓扑分支。

关键词: 钩棘单睾吸虫; 扇棘单睾吸虫; ITS2基因; 种系发育分析

Abstract: The morphological features of Haplorchis pumilio (H.pumilio) and H.taichui were observed with hydrochloric acid carmine staining; The ITS2 sequences were amplified by PCR, analyzed by sequencing, and compared with sequences of H.yokogawai and Metagonimus yokogawai of Heterophyidae trematodes downloaded from GenBank; And the phylogenetic tree was constructed by Mega 6.05.The morphological characteristics of H.pumilio and H.taichui from dog and cat were conformed to the classical taxonomic description.The ITS2 sequences of H.pumilio and H.taichui were 295 and 297 bp, and the percentages of G+C content of ITS2 were 49.5% (146/295) and 54.2% (161/297), respectively.The sequences were submitted to GenBank and the accession numbers of H.pumilio were KJ137221-KJ137223 and KP165437-KP165439, the accession number of H.pumilio was KP165440.The sequence alignment results showed that H.pumilio and H.taichui intraspecific difference was 0, interspecific differernce with four heterophyes was 15.2% to 28.9%.The phylogenetic tree based on ITS2 showed that H.pumilio and H.taichui were at the same clade with the bootstrap value of 99%.

Key words: Haplorchis pumilio; Haplorchis taichui; ITS2 gene; phylogenetic analysis

中图分类号:

梅雪芳, 李树清, 胡长红, 黄腾飞, 陈志飞, 黄维义. 钩棘单睾吸虫和扇棘单睾吸虫ITS2序列测定及其种系发育分析[J]. , 2015, 42(8): 1943-1949.

MEI Xue-fang, LI Shu-qing, HU Chang-hong, HUANG Teng-fei, CHEN Zhi-fei, HUANG Wei-yi. ITS2 Sequencing and Phylogenetic Analysis of Haplorchis pumilio and H.taichui[J]. , 2015, 42(8): 1943-1949.

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ITS2 Sequencing and Phylogenetic Analysis of Haplorchis pumilio and H.taichui

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