山羊角蛋白14基因启动子分析及其多态性研究

中国畜牧兽医

山羊角蛋白14基因启动子分析及其多态性研究

阿如汗^1,2, 勿都巴拉^1,2, 张燕军^1,2, 张文广^1,2, 李金泉^1,2

1. 内蒙古农业大学动物科学学院,内蒙古呼和浩特 010018;
2. 内蒙古农业大学遗传育种与繁殖重点实验室,内蒙古呼和浩特 010018

收稿日期:2011-12-23 出版日期:2012-08-20 发布日期:2012-08-24
通讯作者: 李金泉 E-mail:lijinquan_nd@126.com; atcgnmbi@yahoo.com.cn
作者简介:阿如汗(1987-),女,内蒙古人,硕士生,研究方向:动物遗传育种。
基金资助:
"现代农业产业技术体系建设专项资金资助"(CARS-40-05)。

Sequence Analysis and Polymorphism of K14 Gene Promoter in Goat

A Ru-han^1,2, WUDUBALA^1,2, ZHANG Yan-jun^1,2, ZHANG Wen-guang^1,2, LI Jin-quan^1,2

1. College of Animal Science,Inner Mongolia Agricultural University,Hohhot 010018,China;
2. Key Laboratory of Animal Genetics, Breeding and Reproduction, Inner Mongolia Agricultural University,Hohhot 010018,China

Received:2011-12-23 Online:2012-08-20 Published:2012-08-24

摘要/Abstract

摘要： 以内蒙古白绒山羊DNA为模板,参照牛的角蛋白14(keratin 14,K14)基因序列设计引物,PCR扩增获得长度为2834 bp(GenBank登录号:JQ063036)的片段,包括山羊K14基因启动子区2631 bp和结构基因第1外显子区203 bp。序列比对山羊K14基因启动子序列及其多态性分析结果发现,山羊K14基因启动子结构与人K14基因启动子不同,只含有Sox-5、GATA-1、GATA-1/2结合位点等3个共同的转录因子结合位点。但与牛K14基因启动子有较高的相似性,含有Sox-5、SRY、CdxA、MyoD、MZF1、GATA-1/3、Nkx-2结合位点等7个共同的转录因子结合位点;并发现山羊K14基因启动子区存在deltaE、GATA-2、GATA-1、Sp-1、AML-1a等5处独有的转录因子结合位点。此外,对山羊K14基因启动子进行多态性分析,发现4处单核苷酸多态位点,其中2处SNPs位于Nkx-2(-2004—-1996 bp)转录因子结合位点或Nkx-2(-1590—-1583 bp)临近几个碱基内。

关键词: 山羊; K14基因启动子; 转录因子; 多态性

Abstract: According to the bovine keratin 14 (K14) gene sequence designed the PCR primers,and acquired the 2834 bp gene sequence(GenBank accession:JQ063036) by the DNA of Inner Mongolia Cashmere goat. This region included 2631 bp promoter region and 203 bp the first exon of structural gene of goat K14 gene. Sequence aligenment and analysis,and study the polymorphism of K14 promoter. It was found that goat’s and human’s structure of K14 promoter were different,both only having three common transcription factor binding sites such as Sox-5,GATA-1,GATA-1/2 binding sites. However,with the cattle’s had a higher similarity,containing the Sox-5,SRY,CdxA,MyoD,MZF1,GATA-1/3,Nkx-2 binding sites etc.7 common transcription factor binding sites. And it was found that goat K14 promoter region had five unique transcription factor binding sites,such as deltaE,GATA-2,GATA-1,Sp-1,AML-1a binding sites. In addition,the single nucleotide polymorphism (SNP) of goat K14 promoter was investigated,including four SNPs. Among these two novel SNPs were located in Nkx-2 binding site(-2004—-1996 bp) or near the several bases of Nkx-2 binding site Nkx-2(-1590—-1583 bp).

Key words: goat; K14 gene promoter; transcription factor; polymorphism

中图分类号:

S813.3

阿如汗, 勿都巴拉, 张燕军, 张文广, 李金泉. 山羊角蛋白14基因启动子分析及其多态性研究[J]. 中国畜牧兽医.

A Ru-han, WUDUBALA, ZHANG Yan-jun, ZHANG Wen-guang, LI Jin-quan. Sequence Analysis and Polymorphism of K14 Gene Promoter in Goat[J]. China Animal Husbandry & Veterinary Medicine.

[1]	徐扩卫, 冷堂健, 熊宝, 李金燕, 郭盘江, 吴培福, 陈粉粉, 周杰珑. 宁蒗高原鸡全基因组选择信号分析[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(5): 1941-1954.
[2]	管凇, 施力光, 林雨, 蒋剑箫, 武洪志, 彭维祺. 海南黑山羊GDF9基因nsSNP功能性预测及与产羔数的关联分析[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(5): 2166-2176.
[3]	杨洋, 袁超, 陈浩林, 粟朝芝, 韩勇, 赵彦频. 努贵杂交F1代羊与贵州黑山羊屠宰性能及肉品质比较研究[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(4): 1694-1704.
[4]	安兆翔, 荀文娟, 周汉林, 施力光. 热应激对海南黑山羊精液抗氧化能力及精浆代谢组学特征的影响[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(3): 1191-1201.
[5]	刘泽武, 樊月圆, 袁嘉芮, 格桑卓嘎, 班旦, 白卫兵, 茶金龙, 四朗玉珍, 富国文. 1株羊源伪结核棒状杆菌的分离鉴定及耐药性分析[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(3): 1405-1415.
[6]	艾小楠, 程俐芬, 白璞, 陈正灏, 薛丽娜, 周胜花. 灵丘青背山羊ACSL1基因克隆、生物信息学分析及其在脂肪细胞分化过程中的表达研究[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(2): 499-511.
[7]	雷志刚, 潘宏, 张丹丹, 刘权辉, 孙哲, 邓珊, 黄奔. 马山黑山羊MAPK8基因克隆、生物信息学分析及真核表达载体构建[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(2): 534-544.
[8]	李君, 余倩倩, 李佳琳, 李忠莹, 韩浩园, 施会彬, 刘昆, 张浩, 权凯. 硬脂酸对奶山羊乳腺上皮细胞活力和乳脂合成的影响[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(2): 574-581.
[9]	李静轩, 林岩娇, 黄琼君, 韩新燕, 张月朗. 山羊骨骼肌发育相关非编码RNA研究进展[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(2): 582-592.
[10]	杨金林, 李辉, 赵德鹏, 石钰仕, 龙霞, 谭启松. 赤水乌骨鸡EDNRB2基因多态性及其与肤色性状的关联分析[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(2): 759-770.
[11]	周光现, 谭嘉泳, 杨健, 刘艳芬, 甘尚权, 赵志辉, 康丹菊. 雷州山羊TBX15基因多态性及其与体尺性状的关联分析[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(9): 3930-3938.
[12]	曹萍, 李瑞哲, 陈生梅, 薛斌, 韩生兰, 梅萨, 达桑, 才加, 孙永刚, 马志杰. 青海省果洛藏族自治州4个牦牛群体父系遗传分子评估[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(9): 3948-3957.
[13]	王常童, 杨连弟, 殷丽, 王乐, 张进, 左福元, 黄文明. 热应激对山羊粪便菌群结构及代谢产物的影响[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(8): 3288-3300.
[14]	李子健, 江炎庭, 兰蓉, 朱兰, 叶朗惠, 龚翔, 欧阳依娜. 基于GBS测序技术分析云上黑山羊主配公羊亲缘关系及近交系数[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(8): 3447-3460.
[15]	刘茵, 王志武, 赵鹏, 张丽, 郭宏宇, 王豪俊. 活性干酵母对晋岚绒山羊生长性能、屠宰性能及血清生化指标的影响[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(7): 2810-2822.