巢湖鸭生长素基因和垂体特异性转录因子1基因的PCR-SSCP检测

›› 2009, Vol. 36 ›› Issue (5): 107-111.

巢湖鸭生长素基因和垂体特异性转录因子1基因的PCR-SSCP检测

李俊营1，詹凯1，许月英1，王德圣2，赵瑞宏1，唐中节3

（1.安徽省农业科学院畜牧兽医研究所, 合肥 230031;2.江苏省海安县海安镇畜牧兽医站, 海安 226600;3.安徽省庐江县巢湖鸭保种场, 庐江 231490）

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2009-05-20 发布日期:2009-05-20
通讯作者: 詹凯

PCR-SSCP Detection of Ghrelin and Pit-1 Gene in Chaohu Duck

LI Jun-ying1, ZHAN Kai1, XU Yue-ying1, WANG De-sheng2, ZHAO Rui-hong1, TANG Zhong-jie3

(1.Institute of Animal Husbandry and Veterinary, Agricultural Academy of Anhui Province, Hefei 230031, China;2.Haian Town Livestock Farm Veterinary Station of Haian County of Jiangsu Province, Haian 226600, China;3.Chaohu Duck Breeding Farm of Lujiang County of Anhui Province, Lujiang 231490, China)

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2009-05-20 Published:2009-05-20
Contact: ZHAN Kai

摘要/Abstract

摘要： 以生长素基因Ghrelin和垂体特异性转录因子1 Pit-1基因为候选基因，采用PCR-SSCP和DNA测序技术检测2个候选基因在巢湖鸭群体中的单核苷酸多态性(SNPs)。结果表明，Ghrelin基因exon 3第54 bp位置有G→A碱基的点突变，在巢湖鸭群体中检测到AA、AB、BB 3种基因型，A等位基因频率为0.49，B等位基因频率为0.51；在exon 5第149位和166位发生了C→A和G→T的突变，检测到MM、MN、NN 3种基因型，M等位基因频率为0.19，N等位基因频率为0.81。Pit-1基因的2对引物的扩增片段均未检测到多态性，说明所检测的Pit-1基因外显子3和4序列比较保守。

关键词: 巢湖鸭; 生长素基因; 垂体特异性转录因子1; SNPs

Abstract: Ghrelin gene and pituitary specific transcription factor 1 (Pit-1) gene were studied as candidate genes on the Chaohu duck in this study. Polymorphisms of Ghrelin and Pit-1 gene had been analyzed by PCR-SSCP and DNA sequencing method. The results showed that three SNPs were identified at Ghrelin gene, one SNP (G54A) located at the third exon, another two in the fifth exon were transitions of C to A (149) and G to T (166). The frequency of A/B alleles for Ghrelin gene in the population was 0.49 and 0.51, and that of M/N alleles was 0.19 and 0.81. No polymorphisms were detected in the amplified regions of two pairs of primers in Chaohu duck population tested, which may indicate that the sequences of exons 3 and 4 of Pit-1 gene were rather conserved.

Key words: Chaohu duck; Ghrelin gene; Pit-1 gene; SNPs

中图分类号:

S834.2

李俊营;詹凯;许月英;王德圣;赵瑞宏;唐中节. 巢湖鸭生长素基因和垂体特异性转录因子1基因的PCR-SSCP检测[J]. , 2009, 36(5): 107-111.

LI Jun-ying;ZHAN Kai;XU Yue-ying;WANG De-sheng;ZHAO Rui-hong;TANG Zhong-jie. PCR-SSCP Detection of Ghrelin and Pit-1 Gene in Chaohu Duck [J]. , 2009, 36(5): 107-111.

[1]	冯小品, 李隐侠, 张晨俭, 张俊, 孟春花, 钱勇, 曹少先. 波尔山羊PLAG1基因克隆、多态性鉴定及其与出生体重、体尺性状的关联分析[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(9): 3465-3474.
[2]	邓伊华, 王天娇, 王洪亮, 董依萌, 刘欣, 邢秀梅. 基于重测序技术的塔河马鹿特异性SNP位点筛选[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(4): 1413-1421.
[3]	周雅, 张禾垟, 刘琳玲, 李浩东, 郑军军, 王桂武. 梅花鹿MSRB3基因多态性及其与茸重性状的关联分析[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(11): 4279-4287.
[4]	刘鹏程, 张继, 邱淦远, 龚俞, 李雪松, 李维, 张依裕, 刘若余. 关岭牛TBC1D7基因多态性及其与生长性状的关联分析[J]. 中国畜牧兽医, 2021, 48(8): 2853-2863.
[5]	周志楠, 吴雨, 陈祥, 宋汝谋, 陈伟. 贵州地方黄牛GHR基因遗传变异、功能预测及其与生长性状的关联性分析[J]. 中国畜牧兽医, 2021, 48(3): 932-945.
[6]	张凡, 徐杰, 李刚, 周永顺, 何营, 韩凯, 陈福龙, 高剑峰. 哈萨克羊iNOS基因多态性与布鲁氏菌病的相关性分析[J]. 中国畜牧兽医, 2021, 48(3): 1102-1111.
[7]	孙凌翥, 冉雪琴, 刘畅, 牛熙, 黄世会, 王嘉福. 香猪基因组外显子SNPs检测及繁殖和体型性状候选基因分析[J]. 中国畜牧兽医, 2021, 48(2): 537-553.
[8]	郑海英, 杨春艳, 郑威, 于农淇, 文崇利, 韦科龙, 李玲玉, 黄春丽, 黄加祥, 尚江华. 摩拉水牛PRKAA2基因多态性与生长性状的关联分析[J]. 中国畜牧兽医, 2020, 47(3): 789-798.
[9]	冯健, 李英花, 严昌国. 延边黄牛黑皮质素受体-4基因多态性及其与肉质性状的相关性分析[J]. 《中国畜牧兽医》, 2017, 44(5): 1406-1413.
[10]	王元元, 严国, 罗成, 齐江姣, 周光普, 谭君, 高剑峰. 哈萨克羊DQB2基因外显子2多态性及遗传变异分析[J]. 《中国畜牧兽医》, 2017, 44(12): 3543-3553.
[11]	赵冰茹, 黄锡霞, 田可川, 付雪峰, 徐新明, 柏妍, 田月珍. 细毛羊LAMB1基因外显子多态性及其与羊毛纤维直径的关联性分析[J]. 《中国畜牧兽医》, 2016, 43(9): 2401-2411.
[12]	谢三磊, 文凤云, 李俊强, 王晴, 梁钰, 刘艺婷, 李磊, 陈艺. 黑羽鹌鹑ESRβ基因外显子多态性及其与产蛋性状的相关性分析[J]. 《中国畜牧兽医》, 2016, 43(12): 3293-3299.
[13]	李俊, 张勇, 杨红, 张雄. 从江香猪SIM1基因SNPs筛查及生物信息学分析[J]. 《中国畜牧兽医》---唯一指定的官方网站, 2015, 42(9): 2224-2232.
[14]	李维, 刘若余, 林家栋, 谢海强, 李思, 杜雪琴, 肖超能. 兔解偶联蛋白1基因第2外显子基因多态性研究[J]. , 2015, 42(8): 2131-2136.
[15]	邓廷贤, 庞春英, 朱鹏, 段安琴, 陆杏蓉, 杨炳壮, 梁贤威. 飞行时间质谱法检测水牛黑素皮质素受体4基因多态性[J]. , 2015, 42(7): 1800-1806.