猪繁殖与呼吸综合征病毒分离株GP5蛋白ORF5基因的克隆与序列分析

›› 2014, Vol. 41 ›› Issue (11): 40-43.

猪繁殖与呼吸综合征病毒分离株GP5蛋白ORF5基因的克隆与序列分析

吴晓薇¹, 刘晓慧², 杨谦³, 熊蕊², 郭凤柳², 郭霄峰³, 阳佑天³, 陈茹¹

1. 广东出入境检验检疫局, 广东广州 510642;
2. 保定出入境检验检疫局, 河北保定 071051;
3. 华南农业大学, 广东广州 510640

收稿日期:2014-04-04 出版日期:2014-11-20 发布日期:2014-12-06
作者简介:吴晓薇(1975-),女,江苏人,硕士,兽医师,主要从事动物检疫研究。
基金资助:
广东省科技计划项目(2011B020306004)。

Cloning and Sequence Analysis of GP5 Genes of Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus Prevalence Strains

WU Xiao-wei¹, LIU Xiao-hui², YANG Qian³, XIONG Rui², GUO Feng-liu², GUO Xiao-feng³, YANG You-tian³, CHEN Ru¹

1. Guangdong Entry-exit Inspection and Quarantine Bureau, Guangzhou 510642, China;
2. Baoding Entry-exit Inspection and Quarantine Bureau, Baoding 071051, China;
3. South China Agricultural University, Guangzhou 510640, China

Received:2014-04-04 Online:2014-11-20 Published:2014-12-06

摘要/Abstract

摘要： 为揭示广东地区猪繁殖与呼吸综合征(porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)可能的流行规律,本研究采用RT-PCR的方法扩增5株来自广东地区猪场临床样品的猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus, PRRSV)分离株的GP5蛋白ORF5基因,将其克隆、测序后与国内外部分毒株相应基因进行核苷酸序列比较。结果表明,PRRSV-2011-GD2、PRRSV-2011-GD3、PRRSV-2013-GD1、PRRSV-2013-GD2和PRRSV-2013-GD3株与美洲型参考株(VR-2332) 的核苷酸序列同源性分别为88.8%、99.5%、88.7%、88.7%和83.5%。系统进化树分析结果表明,PRRSV-2011-GD2、PRRSV-2011-GD3、PRRSV-2013-GD1、PRRSV-2013-GD2和PRRSV-2013-GD3株均属于美洲型。以上结果为更好地了解PRRSV的分子流行病学特征和抗原变异规律提供依据, 同时为研制基因工程疫苗奠定了基础。

关键词: 猪繁殖与呼吸综合征; GP5蛋白; 序列分析

Abstract: In order to reveal the Guangdong region of porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRS) epidemic law, 5 strains of swine clinical samples amplified from Guangdong region of PRRSV GP5 genes of the isolates with the method of RT-PCR, cloned, sequenced and domestic and foreign strains corresponding gene nucleotide sequence comparison in this study.The results showed that PRRSV-2011-GD2, PRRSV-2011-GD3, PRRSV-2013-GD1, PRRSV-2013-GD2 and PRRSV-2013-GD3 strains with the American type reference strains (ATCC VR-2332 U87392) nucleotide sequence homology were 88.8%, 99.5%, 88.7%, 88.7% and 83.5%,respectively. The phylogenetic tree analysis indicated that PRRSV-2011-GD2, PRRSV-2011-GD3, PRRSV-2013-GD1, PRRSV-2013-GD2 and PRRSV-2013-GD3 strains belonged to the American.The results provided the basis for a better understanding of the molecular epidemiology of PRRSV features and antigenic variation law, also laid the foundation for the study of gene engineering vaccine.

Key words: porcine reproductive and respiratory syndrome; GP5 protein; sequence analysis

中图分类号:

S854.4⁺3

吴晓薇, 刘晓慧, 杨谦, 熊蕊, 郭凤柳, 郭霄峰, 阳佑天, 陈茹. 猪繁殖与呼吸综合征病毒分离株GP5蛋白ORF5基因的克隆与序列分析[J]. , 2014, 41(11): 40-43.

WU Xiao-wei, LIU Xiao-hui, YANG Qian, XIONG Rui, GUO Feng-liu, GUO Xiao-feng, YANG You-tian, CHEN Ru. Cloning and Sequence Analysis of GP5 Genes of Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus Prevalence Strains[J]. , 2014, 41(11): 40-43.

[1]	康溥, 任照文, 蔡汝健, 吕宗吉, 黄育浩, 王晓虎. 广东及周边省份猪繁殖与呼吸综合征病毒2型谱系8毒株变异规律和传播研究[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(5): 2001-2011.
[2]	陈天宝, 王娅妮, 刘宝玲, 王刚, 王晓虎, 柳旭辉, 蔡汝健, 贺东生. 中药抗猪繁殖与呼吸综合征病毒的作用机制研究进展[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(5): 2114-2129.
[3]	李华玮, 郭科威, 王旭英, 张小雨, 路紫微, 李新锋, 马辉, 侯文静. 猪繁殖与呼吸综合征病毒非结构蛋白7真核表达及亚细胞定位[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(3): 1160-1168.
[4]	宋春, 王柏林, 李梅, 文明, 王开功, 陈常秀, 程振涛. 鸡滑液囊支原体贵州株的分离鉴定及VlhA基因序列分析[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(4): 1516-1523.
[5]	韦云芳, 李飞翔, 星云, 黄庆国, 李居东, 万九生, 陈方良. 昆明犬IGF2基因克隆、生物信息学分析及其时空表达研究[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(3): 866-875.
[6]	何献铭, 任广彩, 叶俊贤, 兰虹, 刘郁夫, 熊挺, 杨泽坤, 徐婷, 陈瑞爱. 1株传染性法氏囊病病毒的分离鉴定及VP2基因序列分析[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(3): 1005-1014.
[7]	刘庆庆, 吴鹏, 李培东, 张江伟, 陈创夫, 肖陈诚. 表达猪繁殖与呼吸综合征病毒N蛋白的重组腺病毒的构建及其免疫原性分析[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(3): 1024-1031.
[8]	蔡杰, 吴佳怡, 潘苑霞, 呼高伟, 张林州. 1株大黄鱼源金黄杆菌的分离鉴定和耐药性分析[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(3): 1135-1143.
[9]	王兆丽, 杨思宇, 吴艳梅, 宋晓晓, 穆祥, 张涛. 猪繁殖与呼吸综合征病毒-脂多糖刺激对中性粒细胞黏附猪肺微血管内皮细胞的影响[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(2): 471-479.
[10]	胡晓冰, 林标声, 王振伟, 郑黎静. 1株利用乳酸的猪源丁酸梭菌的分离鉴定及基因组序列分析[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(2): 569-578.
[11]	孙璐, 张静, 尹苗, 程耀蝶, 代锟, 吴倩, 赵洪, 陈希文. 4种清热解毒复方中草药体外抑菌及抗PRRSV活性研究[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(2): 746-754.
[12]	楚品品, 蒋智勇, 李春玲, 勾红潮, 李艳, 蔡汝健. 纳米银体外抗猪繁殖与呼吸综合征病毒的作用研究[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(11): 4356-4363.
[13]	寇美玲, 苗海生, 李乐, 谢佳芮, 李华春, 宋建领. 云南边境地区帕利亚姆血清群中山病病毒的分离与鉴定[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(11): 4401-4409.
[14]	汪志艳, 孙玉洁, 徐鑫, 黄柏成, 田克恭. 猪δ冠状病毒HeN10株的分离鉴定及致病性研究[J]. 中国畜牧兽医, 2021, 48(8): 2982-2989.
[15]	刘健, 白艺兰, 鞠厚斌, 潘子豪, 俞向前, 杨显超, 朱晓英, 葛菲菲, 葛杰, 于讳茹, 陶田谷晟, 王建, 赵洪进. 犬瘟热病毒SH202003株全基因组序列分析[J]. 中国畜牧兽医, 2021, 48(7): 2559-2568.