禽流感病毒株A/duck/Fujian/31/2007(H5N1)株M1基因的克隆及序列分析

›› 2012, Vol. 39 ›› Issue (5): 27-30.

禽流感病毒株A/duck/Fujian/31/2007(H5N1)株M1基因的克隆及序列分析

布日额^1,2, 任晓峰³, 李明刚⁴, 吴金花^1,2, 孙立杰^1,2

1. 内蒙古民族大学生命科学学院, 内蒙古通辽 028043;2. 内蒙古民族大学乳源性致病菌研究所, 内蒙古通辽 028043;3. 东北农业大学动物医学院, 黑龙江哈尔滨 150030;4. 北京庄笛浩禾生物医学科技有限公司, 北京 100043

收稿日期:2011-11-21 修回日期:1900-01-01 出版日期:2012-05-20 发布日期:2012-05-20

Cloning and Sequencing Analysis M1 Gene of Avian Influenza Virus Strain A/duck/Fujian/31/2007(H5N1)

BU Ri-e^1,2, REN Xiao-feng³, LI Ming-gang⁴, WU Jin-hua^1,2, SUN Li-jie^1,2

1. College of Life Science, Inner Mongolia University for Nationalities, Tongliao 028043, China;2. Research Institute of Pathogenic in Milk, Inner Mongolia University for Nationalities, Tongliao 028043, China;3. Collgege of Veterinary Medicine, Northeast Agricultural University, Harbin 150030, China;4. Beijing Zhuang Di Hao He Biomedical Technology Co., Ltd., Beijing, 100043, China

Received:2011-11-21 Revised:1900-01-01 Online:2012-05-20 Published:2012-05-20

摘要/Abstract

摘要： 参照GenBank公布的禽流感病毒基质蛋白M1基因序列,设计合成了1对特异性引物,采用RT-PCR法成功扩增并克隆了禽流感病毒M1基因。序列测定结果为M1基因cDNA全长759 bp,编码252个氨基酸。将其序列与数株甲型流感病毒M1基因序列进行比较,M1基因核苷酸同源性为99.1%~99.6%,推导氨基酸同源性为98.8%~99.6%,生物信息学分析表明,M1基因编码的蛋白质具有亲水性,有很强的抗原性,M1蛋白共有6个潜在的N-糖基化位点,可能存在3个蛋白激酶C磷酸化位点,存在2个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点。

关键词: 禽流感病毒; M1基因; 克隆; 序列分析

Abstract: A pair of primer was designed according to the sequences of avian influenza virus (AIV) on GenBank website. Total RNA from AIV was taken as template to make RT-PCR amplification. The M1 gene of AIV was amplified by RT-PCR.M1 gene was 759 bp in length, encoding 252 amino acids. Comparing with other published M1 cDNA sequences. It showed that the homology of M1 gene was from 99.1% to 99.6%, and the homology of amino acids was from 98.8% to 99.60%.Bioinformatics analysis of this sequence showed that the protein of M1 was hydrophilicand highly antigenic. M1 includes six potential N-glycosylation sites, three potential proteinkinase C phosphorylation sites, two potential caseinkinaseⅡ phosphorylation sites.

Key words: avian influenza virus; M1 gene; cloning; sequence analysis

中图分类号:

布日额;任晓峰;李明刚;吴金花;孙立杰;. 禽流感病毒株A/duck/Fujian/31/2007(H5N1)株M1基因的克隆及序列分析[J]. , 2012, 39(5): 27-30.

BU Ri-e;REN Xiao-feng;LI Ming-gang;WU Jin-hua;SUN Li-jie;. Cloning and Sequencing Analysis M1 Gene of Avian Influenza Virus Strain A/duck/Fujian/31/2007(H5N1)[J]. China Animal Husbandry & Veterinary Medicine, 2012, 39(5): 27-30.

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