牦牛病毒性黏膜病病毒P125基因的克隆及序列分析

›› 2012, Vol. 39 ›› Issue (12): 27-31.

牦牛病毒性黏膜病病毒P125基因的克隆及序列分析

刘亚刚, 孙凯, 王研, 王盼盼, 胡炳峰, 王文伯

西南民族大学生命科学与技术学院,四川成都 610041

收稿日期:2012-07-10 出版日期:2012-12-20 发布日期:2012-12-19
作者简介:刘亚刚(1959-),男,四川人,教授,博士,研究方向:兽医免疫学。
基金资助:
四川省科技厅攻关项目(04ZY029-006-04);国家民委项目(07XN03)。

Cloning and Bioinformatics Analysis of the P125 Gene of Bovine Viral Diarrhea Virus Strain Yak

LIU Ya-gang, SUN Kai, WANG Yan, WANG Pan-pan, HU Bing-feng, WANG Wen-bo

School of Life Science and Technology, Southwest University for Nationalities, Chengdu 610041,China

Received:2012-07-10 Online:2012-12-20 Published:2012-12-19

摘要/Abstract

摘要： 试验参考GenBank中发表的牛病毒性腹泻病毒(bovine viral diarrhea virus,BVDV)毒株基因组序列设计了5对引物,利用PCR扩增出预期的3475 bp目的片段;将扩增产物连接至pMD19-T 载体,经质粒PCR鉴定及双酶切鉴定获得阳性重组质粒并进行核苷酸序列测定。经BLAST同源性分析表明,牦牛BVDV P125基因与BVDV-Ⅰ型的NADL毒株P125基因的同源性为63.4%。系统分析结果表明,牦牛P125基因与BVDV标准毒株P125基因在遗传进化与亲缘关系上均较远,这可能是因为环境诱变的结果或该毒株具有新的遗传衍化来源。

关键词: 牦牛; 牛病毒性腹泻病毒; P125基因; 克隆测序; 生物信息学分析

Abstract: According to the sequence data of BVDV strain published by GenBank, five set of primers were designed and used to amplify P125 gene of BVDV strain yak by the method of PCR. A specific 3475 bp DNA segment was amplified, which was cloned into pMD19-T vector. The positive recombinant clone was identified by plasmid PCR and restriction enzyme digestion. Compared with BLAST, the P125 gene of BVDV strain yak exhibited the highest homology with strain NADL, but they only shared 63.4%, showing that the P125 gene of BVDV strain yak had great variation. This might be the virus to adapt to yak and the ecological environment of the plateau,or the virus might also have an independent source of genetic.

Key words: yak; bovine viral diarrhea virus; P125 gene; cloning; bioinformatics analysis

中图分类号:

刘亚刚, 孙凯, 王研, 王盼盼, 胡炳峰, 王文伯. 牦牛病毒性黏膜病病毒P125基因的克隆及序列分析[J]. , 2012, 39(12): 27-31.

LIU Ya-gang, SUN Kai, WANG Yan, WANG Pan-pan, HU Bing-feng, WANG Wen-bo. Cloning and Bioinformatics Analysis of the P125 Gene of Bovine Viral Diarrhea Virus Strain Yak[J]. China Animal Husbandry & Veterinary Medicine, 2012, 39(12): 27-31.

参考文献

1 于吉锋,刘亚刚,冯英阳,等.牦牛病毒性腹泻病毒5'-UTR基因和E0基因的克隆与序列分析[J].黑龙江畜牧兽医,2009,340(9):80~82.
2 王新平,刘红,宣华,等.绵羊感染牛病毒性腹泻——粘膜病病毒的调查研究[J].兽医大学学报,1993,13(3):219~221.
3 王新平,宣华,朱维正,等.鹿感染牛病毒性腹泻粘膜病病毒的调查[J].中国畜禽传染病,1995,4:45~46.
4 王新平,涂长春,李卫红,等.牛病毒性腹泻病毒P125 基因重要区的比较与分析[J].中国兽医学报,1995,4:45~46.
5 刘亚刚,殷中琼,刘世贵,等.牦牛病毒性腹泻/粘膜病的防制研究[J].中国预防兽医学报,2003,25(6):487~490.
6 刘亚刚.猪瘟疫苗防制奶牛、牦牛病毒性腹泻/粘膜病的研究.成都:四川大学,2004.
7 李有智,姜福兰. 牦牛病毒性腹泻——粘膜病的防制[J]. 中国畜牧兽医, 2007, 34(1): 141~142.
8 西南民族学院"拉稀病"课题组.牦牛病毒性腹泻/黏膜病的研究[J].西南民族学院学报(畜牧兽医版),1984(40):1~7.
9 Brownlie J. Pathogenesis of mucosal disease and molecular aspects of bovine viral diarrhea virus. Vet Microbiol, 1990, 23: 371~382.
10 De Moerlooze L, Desport M , Renard A. The coding region for the 54 kDa protein of several pestiviruses lacks host insert ions but reveals a 'zinc fingerlike’ domain. Virology, 1990, 177: 812~815.
11 Greisis W I, Dittmar K E, Liess B. Heterogeneous expression of the nonstructural protein p80/p125 in cells infected with different pestiviruses. J Gen Virol, 1992, 73: 47~52.
12 Greiser W I, Hass L, Dittmar K. RNA insertions and gene duplication in the nonstructural protein P125 region of pestivirus strains and isolates in vitro and in vivo. Virology, 1993, 193: 977~980.
13 Jones L R,Weber E L.Application of single stranded conformation polymorphism to the study of bovine viuraldiarrhea virus islates[J].J Vet Diagn Invest, 2001(13):50~56.
14 Larsson B,Travén M,Hultén C,et al. Serum concentrations of thyroid hormones in calves with a transient or persistent infection with bovine viral diarrhoea virus.Res Vet Sci, 1995,58(2):186~189.
15 Meyers G, Tautz N, Dubovi E J,et al. Cytopathogenicity correlated with integration of ubiquitincoding sequences. Virology, 1991, 180: 602~616.

[1]	黎小银, 刘萌, 武新学, 罗璠, 高彦华. β-防御素yTAP对小鼠肠道形态及菌群多样性的影响[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(5): 2379-2391.
[2]	赖秋爽, 黎凌铄, 李姝熠, 田维, 余青婷, 张康林, 李德鹏, 刘骏, 姜菲, 彭忠利, 吴建平, 黄艳玲. 不同蛋白质水平饲粮中添加过瘤胃蛋氨酸对牦牛生长性能、瘤胃发酵及养分表观消化率的影响[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(4): 1567-1578.
[3]	林伟山, 马豆豆, 雷萌桐, 魏斌, 李国才, 王光华, 王戈平, 简莹娜, 李秀萍. 青海海北地区牦牛病毒性腹泻病毒流行病学调查及5'-UTR遗传进化分析[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(3): 1241-1249.
[4]	赵文卿, 薄新文, 普娜, 张玉霞, 陈旭珂, 张艳艳, 孙艳, 齐萌, 王正荣. 细粒棘球绦虫EgBAL蛋白的生物信息学分析及原核表达[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(2): 801-810.
[5]	曹萍, 李瑞哲, 陈生梅, 薛斌, 韩生兰, 梅萨, 达桑, 才加, 孙永刚, 马志杰. 青海省果洛藏族自治州4个牦牛群体父系遗传分子评估[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(9): 3948-3957.
[6]	刘照, 董倩倩, 吴澳迪, 王凯月, 梁成哲, Adnan Ali, 盛金良. 1株进口胎牛血清源牛病毒性腹泻病毒的分离鉴定及小鼠致病性分析[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(9): 4052-4059.
[7]	娄新建, 马万浩, 郝力壮, 刘书杰, 马世科, 拜彬强. 牦牛肉品质研究进展[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(8): 3394-3409.
[8]	赵宇田, 陈付菊, 伊平昌, 马敏, 王守宁, 全七十六. 基于转录组测序挖掘犊牦牛肾周脂质沉积关键基因[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(7): 2727-2738.
[9]	敬科民, 张鹏, 李雨谦, 田园, 董文静, 柴志欣, 王吉坤, 钟金城, 蔡欣. 不同嫩度牦牛背最长肌中SERPINE1基因克隆、生物信息学及表达分析[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(6): 2308-2318.
[10]	李燕, 唐智慧, 符立发, 黄家艳, 吴丹, 曹随忠, 王保宁. 四川、西藏部分地区牦牛场球虫感染情况调查[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(5): 2101-2109.
[11]	闫尊强, 梁毓豪, 宋科林, 滚双宝, 王鹏飞. 合作猪SIRT3基因克隆、生物信息学分析及组织表达研究[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(4): 1390-1399.
[12]	马荣, 喇永福, 包鹏甲, 郭宪, 路建卫, 扎老, 赵雪, 梁春年, 成述儒. 美仁牦牛MYL9基因克隆、生物信息学分析及组织表达研究[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(4): 1410-1419.
[13]	索朗多吉, 张群英, 张强, 平措占堆, 巴多, 巴桑旺堆, 龙瑞军, 洛桑顿珠. 西藏阿里地区改则县野血牦牛屠宰性能及其肉品质特性研究[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(4): 1603-1612.
[14]	张哓兰, 赵志东, 石斌刚, 胡江. 双氢睾酮和褪黑素在牦牛毛囊细胞中的互作效应研究[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(12): 5198-5208.
[15]	张宜宸, 孙明军, 邓昌顺, 丁家波, 徐宝梁, 陈磊, 全春兰, 赵康, 范学政, 秦彤. 基于重组E2蛋白的牛病毒性腹泻病毒间接ELISA抗体检测方法的建立与评价[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(12): 5459-5469.