高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒BJSD株和BJPG株序列分析

›› 2011, Vol. 38 ›› Issue (12): 111-118.

高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒BJSD株和BJPG株序列分析

刘永宏^1,2,3, 赵丽^1,2, 刘俊峰¹, 王凤龙², 刘月焕³

1. 塔里木大学动物科学学院/新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室,新疆阿拉尔 843300;2. 内蒙古农业大学动物科学与医学学院,内蒙古呼和浩特 010018;3. 北京市农林科学院畜牧兽医研究所,北京 100097

收稿日期:2011-04-20 修回日期:1900-01-01 出版日期:2011-12-20 发布日期:2011-12-20
通讯作者: 刘月焕

The Sequence Analysis of BJSD and BJPG Strain of Highly Pathogenicity Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus

LIU Yong-hong^1,2,3, ZHAO Li^1,2, LIU Jun-feng¹, WANG Feng-long², LIU Yue-huan³

1. Key Laboratory of Tarim Animal Husbandry Science and Technology of Xinjiang Production & Construction Corps, College of Animal Science,Tarim University,Alar 843300,China;2. College of Animal Science and Medicine, Inner Mongolia Agricultural University,Hohhot 010018,China;3. Institute of Animal Husbandry and Veterinary Medicine,Beijing Academy of Agriculture and Forestry Sciences,Beijing 100097,China

Received:2011-04-20 Revised:1900-01-01 Online:2011-12-20 Published:2011-12-20

摘要/Abstract

摘要： 本研究旨在预测与分析高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒BJSD株和BJPG株序列特点,为其下一步研究作准备。利用分子生物学软件及服务器,对BJSD株和BJPG株全序列及各结构蛋白的生化特性、溶解性和核定位信号等进行了分析,结果显示BJSD株和BJPG株至少有12个非结构蛋白和6个结构蛋白;同源性比较结果显示GP3和GP5蛋白变异性高,M和N蛋白保守。GP3、GP5和M蛋白糖基化位点与参考株相比有变化,GP2、GP4和N蛋白糖基化位点与所有参考株一致。服务器预测BJSD株和BJPG株GP2、M和N蛋白生化特性显示各项数据完全一致,其中N蛋白的碱性氨基酸比例明显高于其他蛋白,总平均亲水值明显低于其他蛋白;GP2、GP3和GP4蛋白不稳定,GP5、M和N蛋白稳定。BJSD株和BJPG株可溶性只有GP3和GP5略有差别,其余蛋白数据一致,6个结构蛋白预测不溶性概率均在66%以上,GP3不溶性概率最高。BJSD株和BJPG株结构蛋白核定位结果显示,两株仅GP3和GP5有差异,其余蛋白分布情况完全一致。可以利用以上一些不同于以往各代表株的特点,对PRRS的诊断和防制做进一步的研究。

关键词: 高致病性; 猪繁殖与呼吸综合征; 序列分析; BJSD株; BJPG株

Abstract: Predicting and analysising the properties of HP-PRRSV BJSD and BJPG sequence,which will prepare for further study of this strain. Molecular biology software and server are used to analysis the complete sequence of HP-PRRSV BJSD and BJPG strain,the biochemistry properties,solubility of various structural proteins and nuclear location singal (NLS). The results show that there are 12 non-structural and 6 structual protein at least in HP-PRRSV BJSD and BJPG. When we compare different protein homology,we found that GP3 and GP5 are high mutant,M and N are conservative. The protein glycosylation site of GP3,GP5 and M are different from the reference strains,but GP2,GP4 and N are the same. Server shows that biochemical characteristics of GP2,M and N protein of BJSD and BJPG strains is identical,the ratio of alkaline amino acid of N is higher than GP2 and M,and the total average hydrophilic value obviously lower than other proteins. GP2,GP3 and GP4 are unstable; GP5,M and N are opposite. The solubility of all proteins of BJSD and BJPG strains is consistent but GP3 and GP5 has somewhat different. Prediction of 6 structural protein insoluble probability are accounted for more than 66 percent,GP3 is highest. The nuclear localization of structural proteins of BJSD and BJPG strains show that distribution of all proteins is identical but GP3 and GP5. The properties of above strains can pave the way for the diagnosis and treatment of PRRS.

Key words: highly pathogenicity; porcine reproductive and respiratory syndrome(PRRS); sequence analysis; BJSD strain; BJPG strain

中图分类号:

刘永宏;赵丽;刘俊峰;王凤龙;刘月焕. 高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒BJSD株和BJPG株序列分析[J]. , 2011, 38(12): 111-118.

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