绵羊Cdkn1c的DNA甲基化分析

›› 2010, Vol. 37 ›› Issue (4): 85-87.

绵羊Cdkn1c的DNA甲基化分析

赵丽霞¹，赵高平²，郭荣启³，王丙萍¹，周欢敏^1，2

（1.内蒙古农业大学生物工程学院，呼和浩特 010018； 2.内蒙古农业大学动物科学与医学学院，呼和浩特 010018； 3.内蒙古呼伦贝尔市农业科学研究所，扎兰屯 162650）

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2010-04-20 发布日期:2010-04-20
通讯作者: 周欢敏

DNA Methylation Pattern of Sheep Cyclin-dependent Kinase Inhibitor 1C

ZHAO Li-xia¹，ZHAO Gao-ping²，GUO Rong-qi³，WANG Bing-ping¹，ZHOU Huan-min^1，2

(1.Bioengineering College，Inner Mongolia Agricultural University，Hohhot 010018，China; 2.College of Animal Science and Veterinary Medicine，Inner Mongolia Agricultural University，Hohhot 010018，China; 3.Hulunbeier Institute of Agricultural Science, Zhalantun 162650，China)

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2010-04-20 Published:2010-04-20

摘要/Abstract

摘要： 为了探究绵羊Cdkn1c的甲基化状态，本研究对绵羊及其它3个物种的Cdkn1c mRNA序列进行了生物信息学分析，并通过亚硫酸氢盐测序法（BSP）对新生羔羊肾脏和肺脏Cdkn1c CpG岛上的CpG位点进行了甲基化分析。结果显示，整个编码区富含CG，为CpG岛；绵羊Cdkn1c所有分析位点均非甲基化，暗示该区域并非差异甲基化区域(DMR)。

关键词: Cdkn1c; BSP; DNA甲基化; 印记

Abstract: In order to determine the DNA methylation profile of sheep Cdkn1c, its mRNA sequences of sheep, cattle, human and mouse were subjected to bioinformatic analysis in the present study. Then bisulfite sequencing method (BSP) was used to examine the DNA methylation pattern of CpG island in Cdkn1c. The results of bioinformatic analysis exhibited that the coding region of Cdkn1c was a big CpG island in four species. And bisulfite sequencing results showed that all the analyzed CpG sites were completely non-methylated in the tissues of kidney and lung, suggesting that the analyzed region was not differential methylated region (DMR) in sheep.

Key words: cyclin-dependent kinase inhibitor 1C; bisulfite sequencing method; DNA methylation; imprinting

中图分类号:

S826

赵丽霞;赵高平;郭荣启;王丙萍;周欢敏;. 绵羊Cdkn1c的DNA甲基化分析[J]. , 2010, 37(4): 85-87.

ZHAO Li-xia;ZHAO Gao-ping;GUO Rong-qi;WANG Bing-ping;ZHOU Huan-min;. DNA Methylation Pattern of Sheep Cyclin-dependent Kinase Inhibitor 1C[J]. China Animal Husbandry & Veterinary Medicine, 2010, 37(4): 85-87.

[1]	孙灿, 魏硕, 鄢余静, 赵天艺, 朱德馨, 邓兴梅, 郭嘉, 张辉, 孙志华. 布鲁氏菌BspF蛋白生物信息学分析及其对巨噬细胞炎症因子表达的影响[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(5): 1846-1856.
[2]	张康, 巴桑珠扎, 次仁罗布, 旦增洛桑, 尼玛仓决, 斯朗旺姆, 普布曲珍, 德吉玉珍, 索朗曲吉. 高原动物低氧适应的表观遗传学机制研究[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(4): 1582-1592.
[3]	杨雅琼, 程鸿星, 梁明霞, 刘玉兰, 付书林, 张晶, 陈洪波, 任红艳, 郭玲, 晁哲. 4个基因在副猪嗜血杆菌感染仔猪脑组织中DNA甲基化与mRNA表达联合验证[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(4): 1651-1659.
[4]	张思岚, 支飞杰, 丁剑, 宋银娟, 郑福英, 付强, 储岳峰, 史慧君, 许健. 布鲁氏菌效应蛋白BspE基因缺失株的构建及其生物学特性研究[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(12): 5128-5137.
[5]	肖洋洋, 马忠臣, 李芮芮, 陈创夫, 郑炜, 王勇, 王鹏雁. 布鲁氏菌分泌蛋白BspI生物信息学分析及多克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(8): 3112-3121.
[6]	徐盼, 仲德, 马政, 刘林雨, 王怡晖, 赵旭庭. 基于全基因组差异甲基化分析鉴别影响苏姜猪体重的候选基因[J]. 中国畜牧兽医, 2021, 48(8): 2889-2900.
[7]	薛倩, 李国辉, 张会永, 殷建玫, 周成浩, 朱云芬, 邢伟杰, 苏一军, 邹剑敏, 韩威. 狼山鸡下丘脑和卵巢组织全基因组DNA甲基化分析[J]. 中国畜牧兽医, 2021, 48(2): 417-424.
[8]	李芮芮, 马忠臣, 张弘扬, 王震, 努尔赛力克·努素甫, 王勇, 陈创夫. 布鲁氏菌分泌蛋白BspD多克隆抗体制备及其生物信息学分析[J]. 中国畜牧兽医, 2021, 48(2): 676-684.
[9]	任晓丽, 范玉营, 皇甫和平, 董青, 石冬梅, 刘云. 表观遗传调控机制在犬肿瘤中的研究进展[J]. 中国畜牧兽医, 2021, 48(11): 4319-4326.
[10]	张辉, 李晓雨, 狄冉, 刘玉芳, 储明星. AANAT基因在滩羊不同繁殖时期卵巢中的转录差异及DNA甲基化程度分析[J]. 中国畜牧兽医, 2021, 48(1): 226-234.
[11]	杜建文, 杨雪梅, 王丹, 朱桦, 何军敏, 阿布来提·苏来曼, 田月珍, 赵冰茹, 徐新明, 付雪峰, 哈尼克孜·吐拉甫, 吴伟伟, 田可川, 黄锡霞. ITGB2基因在苏博美利奴羊不同细度皮肤组织中的DNA甲基化及mRNA表达水平分析[J]. 中国畜牧兽医, 2020, 47(4): 1009-1017.
[12]	徐友信, 李宗珍, 王杰, 张乃锋. 蛋氨酸对动物表型性状的影响及DNA甲基化调控机制的研究进展[J]. 《中国畜牧兽医》, 2019, 46(4): 1108-1115.
[13]	王鹤洁, 秦本源, 王媛媛, 郭玉龙, 宋鹏康, 刘亚丹, 乐宝玉, 张宁芳, 成志敏, 高鹏飞, 郭晓红, 李步高, 曹果清. DNA甲基化与去甲基化调控脂肪沉积的研究进展[J]. 《中国畜牧兽医》, 2019, 46(2): 519-525.
[14]	王文娟, 岳媛, 安磊, 田见晖. 早期胚胎DNA甲基化研究进展[J]. 《中国畜牧兽医》, 2018, 45(9): 2531-2536.
[15]	李广栋, 崔炜, 田秀芝, 吕东颖, 姬鹏云, 刘国世. NLRP7基因在母源印记中的研究进展[J]. 《中国畜牧兽医》, 2018, 45(4): 1002-1008.