鸳鸯鸭MHC-Ⅰ α链基因的克隆与分子进化分析

›› 2009, Vol. 36 ›› Issue (12): 60-62.

鸳鸯鸭MHC-Ⅰ α链基因的克隆与分子进化分析

孙凯^1,2，李新生^1,2，崔保安^1,2，陈红英^1,2，魏战勇^1,2，张蕾^1,2，宋亚鹏^1,2，阮武营^1,2

（1.河南农业大学牧医工程学院，郑州 450002； 2.河南省动物性食品安全重点实验室，郑州 450002）

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2009-12-20 发布日期:2009-12-20
通讯作者: 崔保安

Cloning and Sequence Analysis of Yuanyang Duck MHC-I αChain Mature Peptide Gene of the Extracellular Domain

SUN Kai^1,2, LI Xin-sheng^1,2, CUI Bao-an^1,2, CHEN Hong-ying^1,2, WEI Zhan-yong^1，2, ZHANG Lei^1,2, SONG Ya-peng^1,2, RUAN Wu-ying^1,2

(1.The College of Animal Husbandry and Veterinary, Henan Agricultural University, Zhengzhou 450002, China;2.Henan Animal Food Safety Key Laboratory, Zhengzhou 450002, China)

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2009-12-20 Published:2009-12-20
Contact: CUI Bao-an

摘要/Abstract

摘要： 根据GenBank中登录（登录号：AB115244）的鸭MHC-Iα链序列设计并合成1对引物，采用RT-PCR技术从鸳鸯鸭脾脏组织中克隆出鸳鸯鸭MHC-Iα链基因，并进行T-A克隆和序列测定。结果表明，所获得的鸳鸯鸭MHC-Iα链基因长909 bp，编码303个氨基酸的多肽，含一个完整的鸳鸯鸭MHC-Iα链胞外区成熟肽基因。序列比较发现，鸳鸯鸭MHC-Iα链基因与GenBank登录的其它品种的鸭MHC-Iα链核苷酸同源性为89.4%～91.0%，与人和其他动物的MHC-Iα链胞外区成熟肽基因的氨基酸同源性为11.1%～79.3%，表明MHC-Iα链胞外区成熟肽基因存在着种的多样性，且亲缘关系越近，同源性越高。鸳鸯鸭MHC-Iα链胞外区成熟肽基因的成功克隆为进一步研究鸭MHC-I基因表达、生物学活性和应用奠定基础。

关键词: 鸳鸯鸭; MHC-Iα链胞外区成熟肽基因; 克隆; 序列分析

Abstract: Yuanyang duck MHC class Iα chain cDNA was completely amplified from a duck spleen by RT-PCR, then cloned and sequenced. The result showed cloned duck MHC class Iα chain gene span is 909 bp, which encodes 303 amino acid residues, including a complete Yuanyang duck MHC-Iα chain mature peptide (813 bp) of the extracellular domain. The results of homology analysis with other duck MHC-Iα chain mature peptide gene of the extracellular domain revealed that there was identity of 89.4% to 91.0% at nucleotide homology. This study paved the way for future study of expression, biological function and application of duck MHC-Iα chain mature peptide of the extracellular domain.

Key words: Yuanyang duck; MHC-1α chain mature peptide gene; cloning; sequencing

中图分类号:

孙凯;李新生;崔保安;陈红英;魏战勇;张蕾;宋亚鹏;阮武营;. 鸳鸯鸭MHC-Ⅰ α链基因的克隆与分子进化分析[J]. , 2009, 36(12): 60-62.

SUN Kai;LI Xin-sheng;CUI Bao-an;CHEN Hong-ying;WEI Zhan-yong;ZHANG Lei;SONG Ya-peng;RUAN Wu-ying;. Cloning and Sequence Analysis of Yuanyang Duck MHC-I αChain Mature Peptide Gene of the Extracellular Domain[J]. , 2009, 36(12): 60-62.

[1]	焦琳琳, 成玉婷, 吴庆国, 吴双, 吴植, 朱善元, 钱莺娟. 鸭坦布苏病毒Capsid蛋白原核表达及多克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(6): 2395-2402.
[2]	欧云文, 潘琴, 汪洋, 代军飞, 任绍科, 张洋, 张杰. 猪细小病毒6型ORF2基因的截短表达及多克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(6): 2487-2495.
[3]	刘佳隆, 张译文, 张悦然, 孙奇娟, 陈建, 何雷, 贾艳艳, 丁轲, 余祖华. 鸡ELAVL1基因克隆、原核表达及生物信息学分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(5): 1807-1817.
[4]	王雪平, 张孝俊, 李晓月, 王国栋, 张福良, 宋玉伟, 张明亮, 马磊. 高致病性禽腺病毒血清4型Hexon蛋白的原核表达及多克隆抗体的制备[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(5): 2053-2060.
[5]	范冰峰, 李文, 刘理想, 赵向远, 邵静, 林乐丰, 孙慧敏, 张旭林, 许保增. 水貂AANAT基因克隆及生物信息学分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1307-1318.
[6]	刘红润, 朱思燃, 奉玲丽, 张坤, 颜港, 王钰滨, 张帅, 江山, 许迪, 兰干球, 梁晶. 大白猪CDO1基因克隆、生物信息学分析及组织表达定位[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1352-1363.
[7]	胡乐玉, 胡欣瑶, 李颖, 赵盛淼, 沈凤臻, 王长法, 李亮亮, 王彤彤, 任慧英. 德州驴HO-1基因生物信息学分析及多克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1499-1510.
[8]	王文婕, 茹鹏辉, 郁川, 杜付熙, 陈松彪, 尚珂, 张春杰, 程相朝. 猫细小病毒洛阳分离株VP2蛋白原核表达及多克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1511-1521.
[9]	张永杰, 隋志远, 张志帅, 王晨光, 李孝君, 邢凤. 多浪羊NPTX1基因克隆、生物信息学分析及在初情期的表达研究[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(3): 1048-1058.
[10]	牛小杰, 徐明国, 肖莉, 刘文豪, 陈创夫, 王勇. 鸡白痢沙门氏菌IPAJ蛋白的表达纯化、多克隆抗体制备及ELISA方法的建立[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(3): 1218-1228.
[11]	侯浩宇, 郑南南, 吴宏举, 陈寅龙, 李潮, 张昂克, 姬鹏超, 万博, 杜永坤, 张改平. 非洲猪瘟病毒p30蛋白单克隆抗体制备和鉴定[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(3): 1241-1249.
[12]	韦义荣, 郑自华, 张叁保, 宋颖, 蒋海玉, 孙雯玥, 程鹏飞, 刘雨帆, 邹剑伟, 黄艳娜, 潘艳, 蒋钦杨. 努比亚山羊UCP1基因克隆、生物信息学分析及组织表达研究[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(2): 440-450.
[13]	吕双飞, 马勋, 王静, 孔翠莲, 寇丽君, 刘彩霞, 史唯地, 康立超, 任慧杰. 炭疽芽孢杆菌PA-LF1融合蛋白的原核表达及其反应原性研究[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(2): 674-683.
[14]	张梦杨, 何健, 刘阳坤, 姚伦广. 非洲猪瘟病毒p37蛋白生物信息学分析及其多克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(1): 300-309.
[15]	朱丽霖, 王后坤, 陈雪阳, 刘晶, 梁雄燕, 方春, 杨玉莹. 鸡IFIT5对J亚群禽白血病病毒在DF-1细胞内复制的影响[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(1): 310-316.