小鼠隐藏管状线虫线粒体cox1基因的扩增及序列分析

›› 2009, Vol. 36 ›› Issue (12): 57-59.

小鼠隐藏管状线虫线粒体cox1基因的扩增及序列分析

李鑫，陈晓梅，范文颖，邓均有，宋慧群，朱兴全，林瑞庆

（华南农业大学兽医学院，广州 510642）

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2009-12-20 发布日期:2009-12-20
通讯作者: 林瑞庆

PCR Amplification and Sequence Analysis of Mitochondrial Cytochrome c Oxidase Subunit 1 (cox1) of Syphacia obvelata from Mice

LI Xin, CHEN Xiao-mei, FAN Wen-ying, DENG Jun-you,SONG Hui-qun, ZHU Xing-quan, LIN Rui-qing

(College of Veterinary Medicine, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, China)

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2009-12-20 Published:2009-12-20
Contact: LIN Rui-qing

摘要/Abstract

摘要： 对从试验小鼠体内分离的蛲虫样品PMZ1-5的线粒体细胞色素c氧化酶第I亚基（cox1）的部分基因（pcox1）进行PCR扩增、测序及序列分析，并与网上相关序列进行比对分析，研究其线粒体pcox1基因遗传变异情况。结果表明，获得pcox1有效序列373 bp，经序列比对分析，发现5个蛲虫样品之间的变异很小，只有1个碱基的差异，序列相似性为99.73%～100%，BLAST分析结果表明为隐藏管状线虫，与同属的Syphacia montana序列差异性为5.24%～5.68%。结果表明，隐藏管状线虫的pcox1序列种内变异很小，种间差异明显，本结果为进一步研究蛲虫的群体遗传学奠定了基础。

关键词: 蛲虫; 线粒体DNA; 细胞色素c氧化酶第I亚基（cox1）; PCR

Abstract: The partial sequences of mitochondrion cox1 (pcox1) gene of 5 pinworm samples separated from mice were amplified by PCR and the positive products were sequenced. Then sequences were analysed by BLAST and compared with Syphacia obvelata and S. montana available in GenBank. The results revealed that the length of the pcox1 sequence was 373 bp. Sequence alignments showed that genetic variation within 5 pinworm samples was very small, with only one mutation locus, and these samples were identified as S. obvelata by BLAST. The inter-specific sequence difference was 5.24%-5.28% between S. obvelata samples and S. montana available in GenBank. These findings showed that the intra-specific variations of cox1 were low for S. obvelata and the inter-specific sequence differences were comparatively higher between S. obvelata and S. montana. The results provided foundation for further studies of population genetics of pinworms. 

Key words: pinworm; mitochondrial DNA; cytochrome c oxidase subunit 1（cox1）gene; PCR

中图分类号:

李鑫;陈晓梅;范文颖;邓均有;宋慧群;朱兴全;林瑞庆. 小鼠隐藏管状线虫线粒体cox1基因的扩增及序列分析[J]. , 2009, 36(12): 57-59.

LI Xin;CHEN Xiao-mei;FAN Wen-ying;DENG Jun-you;SONG Hui-qun;ZHU Xing-quan;LIN Rui-qing. PCR Amplification and Sequence Analysis of Mitochondrial Cytochrome c Oxidase Subunit 1 (cox1) of Syphacia obvelata from Mice[J]. , 2009, 36(12): 57-59.

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