广东新型鸭呼肠孤病毒σB蛋白基因克隆及序列分析

doi:10.16431/j.cnki.1671-7236.2017.02.004

《中国畜牧兽医》 ›› 2017, Vol. 44 ›› Issue (2): 327-335.doi: 10.16431/j.cnki.1671-7236.2017.02.004

广东新型鸭呼肠孤病毒σB蛋白基因克隆及序列分析

黄雯晶, 梁国智, 梅敏敏, 李晓文, 黄淑坚

佛山科学技术学院生命科学与工程学院, 佛山 528200

收稿日期:2016-06-23 出版日期:2017-02-20 发布日期:2017-02-25
通讯作者: 黄淑坚 E-mail:sjhuang.foshan@163.com
作者简介:黄雯晶(1992-), 女, 广东韶关人, 学士, 研究方向:家禽传染病诊断与防控, E-mail:757586187@qq.com
基金资助:
广东省家禽重大传染病控制技术研究（2012A020100001）

Cloning and Sequence Analysis of σB Protein Genes of New-type Duck Reovirus Isolated from Guangdong

HUANG Wen-jing, LIANG Guo-zhi, MEI Min-min, LI Xiao-wen, HUANG Shu-jian

School of Life Science and Engineering, Foshan University, Foshan 528200, China

Received:2016-06-23 Online:2017-02-20 Published:2017-02-25

摘要/Abstract

摘要：

为研究广东新型呼肠孤病毒（NDRV）的基因变异及遗传演化情况，本试验从广东不同鸭场病死鸭肝脏、脾脏等组织脏器中分离到8株流行毒株，用RT-PCR方法进行σB蛋白基因扩增、克隆与序列分析，并与其他毒株σB蛋白的氨基酸特性、蛋白抗原和蛋白基因进行系统进化比对分析。结果表明，广东省鸭群中感染的NDRV与国内其他地区报道的DRV核苷酸序列同源性很高，达96.6%~99.5%，而与禽呼肠孤病毒（ARV）和番鸭呼肠孤病毒（MDRV）的同源性则较低，分别为64.6%~66.5%和66.2%~67.1%；8株NDRV之间的核苷酸序列同源性高达97.7%~99.7%。与其他毒株比较结果显示，本试验分离的NDRV毒株磷酸化位点均比参考毒株ARV和MDRV少，且大多数区域的抗原指数都较高，抗原性与MDRV较为接近，遗传进化分析结果表明，NDRV和国内其他DRV处于独立的进化分支，ARV和MDRV则处于不同分支。结果表明，广东省流行的NDRV毒株σB蛋白基因序列高度保守，且广东地区分离的NDRV与国内其他地区分离的DRV没有明显的地域差异。

关键词: 新型呼肠孤病毒; σB蛋白; 克隆; 序列分析

Abstract:

In order to study the genetic variation and evolution of new-type duck reovirus (NDRV) in Guangdong province, some samples (liver and spleen) were collected from different sick ducks in Guangdong province. Eight strains were initially isolated and identified. σB protein genes were amplified, cloned and sequenced by RT-PCR method,and σB protein characteristics of amino acid, antigen and genetic analysis of system evolution were compared with other strains. The results showed that the isolated viruses were the NDRV. Comparison of nucleotide sequences showed the NDRV isolated from duck in Guangdong province were more closely related to DRV reported in other parts of the country, the homology reached 96.6% to 99.5%, the NDRV isolated from duck in Guangdong province were not closely related with ARV and MDRV, the homology was 64.6% to 66.5% and 66.2% to 67.1%, respectively. Homology comparison of nucleotide between 8 strains NDRV were 97.7% to 99.7%.Compared with other strains, NDRV phosphorylation sites were less than ARV and MDRV reference strains, and the most area of the antigen index were high, similar to MDRV. Genetic evolution analysis results showed that NDRV and other domestic DRV were in the evolution of the same branch, but ARV and MDRV were in different branches. The result showed σB protein gene sequences of the NDRV were highly conserved,and NDRV isolated from Guangdong province had no significant regional differences with other regions.

Key words: new-type duck reovirus; σB protein; cloning; sequence analysis

中图分类号:

S852.65⁺9.4

黄雯晶, 梁国智, 梅敏敏, 李晓文, 黄淑坚. 广东新型鸭呼肠孤病毒σB蛋白基因克隆及序列分析[J]. 《中国畜牧兽医》, 2017, 44(2): 327-335.

HUANG Wen-jing, LIANG Guo-zhi, MEI Min-min, LI Xiao-wen, HUANG Shu-jian. Cloning and Sequence Analysis of σB Protein Genes of New-type Duck Reovirus Isolated from Guangdong[J]. , 2017, 44(2): 327-335.

参考文献

[1] 陈少莺,陈仕龙,林锋强,等. 新型鸭呼肠孤病毒的分离与鉴定[J]. 病毒学报,2012,28(3):224-230.
[2] Wang D, Xu F, Ma G M, et al. Complete genomic sequence of a new -origin reovirus from China[J]. J Virol, 2012, 86(22): 12445.
[3] 陆新浩,陈秋英,刘鸿,等. 宁波地区新型鸭呼肠孤病毒病的流行情况[J]. 中国家禽,2015,37(4):58-59.
[4] 黄瑜, 傅光华, 施少华, 等. 新致病型鸭呼肠孤病毒的分离鉴定[J]. 中国兽医杂志, 2009,45(12):29-31.
[5] 陈宗艳, 朱英奇, 王世传, 等. 一株新型鸭源呼肠孤病毒(TH11株)的分离与鉴定[J]. 中国动物传染病学报, 2012,20(1):10-15.
[6] 袁远华, 王俊峰, 吴志新, 等. 1株番鸭源新型鸭呼肠孤病毒(QY株)生物学鉴定[J]. 中国兽医学报, 2013,33(8):1174-1178.
[7] Le Gall-Recule G, Cherbonnel M, Arnauld C, et al. Molecular characterization and expression of the S3 gene of reovirus 89026[J]. J Gen Virol, 1999,80(Pt 1):195-203.
[8] Kuntz-simon G,Le Gall-Recule G,De Boisseson C,et al.Muscovy duck reovirus σC protein is a typically encoded by the smallest genome segment[J]. J Gen Virol,2002,83(5):1189-1200.
[9] Zhang Y,Guo D,Liu M,et al.Characterization of the σB-encoding genes of reovirus:σC-σB-ELISA forantibodies against duck reovirus in ducks[J]. Vet Microbiol,2007,9(3):231-241.
[10] 刘美荣. 一例雏半番鸭疑似新型鸭呼肠孤病毒病的诊治[J]. 畜禽业, 2012,278(6):76-77.
[11] 朱英奇.新型鸭呼肠孤病毒的鉴定及其全基因组序列解析[D].合肥:安徽农业大学,2013.
[12] Yun T, Yu B, Ni Z, et al. Genomic characteristics of a novel reovirus from ling in China[J]. Vet Microbiol,2014,171(1-2):261-271.
[13] 王丹,张大丙. 水禽源呼肠孤病毒的全序列测定和分型[A]. 中国畜牧兽医学会禽病学分会.第四届全国禽病分子生物技术青年工作者会议论文集[C].2015.
[14] 杨志刚. 共表达禽(番鸭)呼肠孤病毒σB-σC-LTB蛋白亚单位疫苗载体的构建及免疫保护的研究[D].北京:中国农业科学院,2014.
[15] 陈祥,吴海洋,王永强,等. 禽呼肠孤病毒σB蛋白单克隆抗体的制备及鉴定[J]. 中国兽医杂志,2015,51(6):3-6.
[16] 谢志勤,谢芝勋,刘加波,等.禽呼肠孤病毒S1733株单克隆抗体的制备及特性鉴定[J].中国畜牧兽医,2012,39(11):47-51.
[17] 汪军卿. 新城疫病毒P基因RNA编辑及P蛋白磷酸化位点对病毒复制的影响[D].北京:中国农业科学院,2014.
[18] 韩典霖. 禽(番鸭)呼肠孤病毒YB株S3与S4 ORF2基因的表达、纯化及免疫原性研究[D]. 福州:福建农林大学, 2007.
[19] 张云, 陈小丹, 李永峰, 等. 抗番鸭呼肠孤病毒σB蛋白单克隆的制备和鉴定[A].中国畜牧兽医学会兽医公共卫生学分会第二次学术研讨会论文集[C]. 2010

广东新型鸭呼肠孤病毒σB蛋白基因克隆及序列分析

Cloning and Sequence Analysis of σB Protein Genes of New-type Duck Reovirus Isolated from Guangdong

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[1]	焦琳琳, 成玉婷, 吴庆国, 吴双, 吴植, 朱善元, 钱莺娟. 鸭坦布苏病毒Capsid蛋白原核表达及多克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(6): 2395-2402.
[2]	欧云文, 潘琴, 汪洋, 代军飞, 任绍科, 张洋, 张杰. 猪细小病毒6型ORF2基因的截短表达及多克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(6): 2487-2495.
[3]	刘佳隆, 张译文, 张悦然, 孙奇娟, 陈建, 何雷, 贾艳艳, 丁轲, 余祖华. 鸡ELAVL1基因克隆、原核表达及生物信息学分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(5): 1807-1817.
[4]	王雪平, 张孝俊, 李晓月, 王国栋, 张福良, 宋玉伟, 张明亮, 马磊. 高致病性禽腺病毒血清4型Hexon蛋白的原核表达及多克隆抗体的制备[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(5): 2053-2060.
[5]	范冰峰, 李文, 刘理想, 赵向远, 邵静, 林乐丰, 孙慧敏, 张旭林, 许保增. 水貂AANAT基因克隆及生物信息学分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1307-1318.
[6]	刘红润, 朱思燃, 奉玲丽, 张坤, 颜港, 王钰滨, 张帅, 江山, 许迪, 兰干球, 梁晶. 大白猪CDO1基因克隆、生物信息学分析及组织表达定位[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1352-1363.
[7]	胡乐玉, 胡欣瑶, 李颖, 赵盛淼, 沈凤臻, 王长法, 李亮亮, 王彤彤, 任慧英. 德州驴HO-1基因生物信息学分析及多克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1499-1510.
[8]	王文婕, 茹鹏辉, 郁川, 杜付熙, 陈松彪, 尚珂, 张春杰, 程相朝. 猫细小病毒洛阳分离株VP2蛋白原核表达及多克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1511-1521.
[9]	张永杰, 隋志远, 张志帅, 王晨光, 李孝君, 邢凤. 多浪羊NPTX1基因克隆、生物信息学分析及在初情期的表达研究[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(3): 1048-1058.
[10]	牛小杰, 徐明国, 肖莉, 刘文豪, 陈创夫, 王勇. 鸡白痢沙门氏菌IPAJ蛋白的表达纯化、多克隆抗体制备及ELISA方法的建立[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(3): 1218-1228.
[11]	侯浩宇, 郑南南, 吴宏举, 陈寅龙, 李潮, 张昂克, 姬鹏超, 万博, 杜永坤, 张改平. 非洲猪瘟病毒p30蛋白单克隆抗体制备和鉴定[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(3): 1241-1249.
[12]	韦义荣, 郑自华, 张叁保, 宋颖, 蒋海玉, 孙雯玥, 程鹏飞, 刘雨帆, 邹剑伟, 黄艳娜, 潘艳, 蒋钦杨. 努比亚山羊UCP1基因克隆、生物信息学分析及组织表达研究[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(2): 440-450.
[13]	吕双飞, 马勋, 王静, 孔翠莲, 寇丽君, 刘彩霞, 史唯地, 康立超, 任慧杰. 炭疽芽孢杆菌PA-LF1融合蛋白的原核表达及其反应原性研究[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(2): 674-683.
[14]	张梦杨, 何健, 刘阳坤, 姚伦广. 非洲猪瘟病毒p37蛋白生物信息学分析及其多克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(1): 300-309.
[15]	朱丽霖, 王后坤, 陈雪阳, 刘晶, 梁雄燕, 方春, 杨玉莹. 鸡IFIT5对J亚群禽白血病病毒在DF-1细胞内复制的影响[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(1): 310-316.