鸭肠炎病毒基因组末端的克隆及序列分析

›› 2010, Vol. 37 ›› Issue (1): 40-44.

鸭肠炎病毒基因组末端的克隆及序列分析

周丽媛¹，关飞³，于可响²，黄兵²，单虎¹，李玉峰²

（1.青岛农业大学动物科技学院，青岛 266109；2.山东省农业科学院家禽研究所家禽疫病诊断与免疫重点实验室，济南 250023；3.甘肃农业大学动物医学院，兰州 730070）

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2010-01-20 发布日期:2010-01-20
通讯作者: 单虎

Cloning and Sequence Analysis of Genomic Termini of Duck Enteritis Virus

ZHOU Li-yuan¹, GUAN Fei³, YU Ke-xiang², HUANG Bing², SHAN Hu¹, LI Yu-feng²

(1.Faculty of Animal Science and Technology, Qingdao Agricultural University, Qingdao 266109, China;2.Key Laboratory of Poultry Disease Diagnostic and Immunology, Poultry Institute of Shandong Academy of Agricultural Sciences, Jinan 250023, China;3.College of Veterinary Medicine, Gansu Agricultural University, Lanzhou 730070, China)

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2010-01-20 Published:2010-01-20
Contact: SHAN Hu

摘要/Abstract

摘要： 根据已知的鸭肠炎病毒基因组序列设计2对引物RTLT1、RTLT2，取基因组自连产物进行PCR反应，分别得到全长1607、1978 bp的序列。将PCR产物克隆至pMD18-T载体，对重组质粒进行PCR和酶切鉴定，将阳性质粒测序，结果显示2对引物扩增的重叠序列部分完全一致。该段序列G+C含量高达75%，含有大量直接和反向重复序列，并发现4个末端特征序列，分别为具有回文结构的α序列、包含两测末端接合位点的β序列、高度保守序列的γ 序列和AnTn序列。将该序列与马疱疹病毒Ⅰ型（EHV-1）、牛疱疹病毒Ⅰ型（BHV-1）、水痘带状疱疹病毒（VZV）、猪伪狂犬病毒（PRV）末端序列进行比较，证实所得到的序列为鸭肠炎病毒基因组末端序列，这些特征序列的发现对进一步了解DEV复制机制有很大帮助。

关键词: 鸭肠炎病毒; 基因组末端; 克隆; 序列分析

Abstract: Two pairs of primers RTLT1 and RTLT2 were designed according to the published nucleotide sequence of the duck enteritis virus (DEV).The genomic DNA of DEV was extracted and self-lignased. 1607 bp and 1978 bp genomic fragments were amplified using PCR which were both cloned into pMD18-T vector. After identification of recombinants by PCR and Pst I digestion, the positive plasmids were sequenced. The result showed the sequences of the overlap region of two PCR products were identical. The G+C content of the overlap sequence reached 75%. Some direct and inverted repeated sequences and four characteristic sequences, α palindromes, β sequence surrounding the teminal joint, highly conserved γ sequences and AnTn sequence were found. Compared with the report of the DNA termini of equine herpesvirus 1, bovine herpesvirus 1, varicella zoster virus and pseudorabies virus, the sequence was confirmed to be the termini of duck enteritis virus genome. These sequence elements were proposed to be important for further understanding of DEV replication.

Key words: duck enteritis virus; genomic termini; cloning; sequence analysis

中图分类号:

周丽媛;关飞;于可响;黄兵;单虎;李玉峰. 鸭肠炎病毒基因组末端的克隆及序列分析[J]. , 2010, 37(1): 40-44.

ZHOU Li-yuan;GUAN Fei;YU Ke-xiang;HUANG Bing;SHAN Hu;LI Yu-feng. Cloning and Sequence Analysis of Genomic Termini of Duck Enteritis Virus[J]. China Animal Husbandry & Veterinary Medicine, 2010, 37(1): 40-44.

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