弓形虫DOC2基因C-端的克隆及序列分析

中国畜牧兽医

弓形虫DOC2基因C-端的克隆及序列分析

高琦¹^，2，张念章^{2，胡玲英²^，3，周东辉^{2，朱兴全²，翁亚彪¹}}

1.华南农业大学兽医学院，广东广州 510642；2.中国农业科学院兰州兽医研究所，家畜疫病病原生物学国家重点实验室，甘肃省动物寄生虫病重点实验室，甘肃兰州 730046；3.福建农林大学动物科学学院，福建福州 350002

收稿日期:2014-04-14 出版日期:2014-08-20 发布日期:2014-08-22
通讯作者: 翁亚彪（1963—），男，副教授，硕士生导师，研究方向：动物寄生虫病的防控技术。E-mail: ybweng@qq.com
作者简介:高琦（1990—），女，湖南人，硕士生，研究方向：动物寄生虫分子生物学。
基金资助:
国家自然科学基金项目（31230073、31172316）；甘肃省创新研究群体计划项目（1210RJIA006）。

Cloning and Sequence Analysis of C-terminal of Toxoplasma gondii DOC2 Gene

GAO Qi¹^，2, ZHANG Nian-zhang², HU Ling-ying²^，3, ZHOU Dong-hui²,ZHU Xing-quan²,WENG Ya-biao¹

1.College of Veterinary Medicine, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, China;2. Key Laboratory of Veterinary Parasitology of Gansu Province，State Key Laboratory of Veterinary Etiological Biology, Lanzhou Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Lanzhou 730046, China; 3. College of Animal Science,Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, China

Received:2014-04-14 Online:2014-08-20 Published:2014-08-22

摘要/Abstract

摘要： 为研究弓形虫DOC2基因作为弓形虫疫苗候选抗原分子的可行性，本试验用RT-PCR技术扩增DOC2基因编码区的C-端并测序。将该基因片段用生物信息学软件翻译为氨基酸序列后，预测弓形虫DOC2蛋白C-端的生物学特性、高级结构和B细胞抗原表位。结果表明，DOC2基因C-端片段长度为1887 bp。将其翻译成氨基酸序列后预测含有11个亲水区域和7个跨膜区。二级结构中含有19个α-螺旋、1个β-转角和17个无规则卷曲。结合柔性区域等分析，DOC2蛋白C-端共含有12个线性B细胞抗原表位。结果表明DOC2蛋白C-端可作为弓形虫疫苗候选分子，为研制新型弓形虫DNA疫苗或表位肽疫苗提供理论基础。

关键词: 弓形虫; DOC2基因; 克隆; 生物信息学分析

Abstract: In order to evaluate whether Toxoplasma gondii DOC2 gene could be used as a vaccine candidate antigen, the C-terminal of DOC2 gene was amplified by RT-PCR and then sent for sequencing. After translated the gene sequence into amino acid sequence, the basically biological characters, advanced structures and linear B cell epitopes of the C-terminal of DOC2 gene were predicted using multiple bioinformatics analysis. The results showed that the length of C-terminal of DOC2 gene was 1887 bp. The C-terminal of DOC2 protein was predicted contain 11 hydrophilic regions, 7 transmembrane domains,19 alpha regions, 1 beta turn, 17 random coils and 12 B cell epitopes, which suggested this protein was a probable vaccine candidate against Toxoplasma gondii infection.

Key words: Toxoplasma gondii; DOC2 gene; clone; bioinformatics analysis

高琦，张念章，胡玲英，周东辉，朱兴全，翁亚彪. 弓形虫DOC2基因C-端的克隆及序列分析[J]. 中国畜牧兽医.

GAO Qi, ZHANG Nian-zhang, HU Ling-ying, ZHOU Dong-hui,ZHU Xing-quan,WENG Ya-biao. Cloning and Sequence Analysis of C-terminal of Toxoplasma gondii DOC2 Gene[J]. .

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