蒙古家马和蒙古野马线粒体细胞色素b基因遗传多样性及系统进化分析

中国畜牧兽医

蒙古家马和蒙古野马线粒体细胞色素b基因遗传多样性及系统进化分析

海棠，黄金龙，赵一萍，韩海格，萨如拉，芒来

（内蒙古农业大学动物科学学院，内蒙古呼和浩特 010018）

收稿日期:2013-11-22 出版日期:2014-06-20 发布日期:2014-07-24
通讯作者: 芒来，男，教授，博士生导师，研究方向：分子遗传学与马科学。
作者简介:海棠（1988—），女，内蒙古人，硕士生，研究方向：分子遗传学与马科学。
基金资助:
国家科技部国际科技合作与交流专项（2012DFB30070）；农业部公益性行业科研专项（201003075）；内蒙古自治区科技厅重大项目（20091404）；内蒙古农业大学2009年度科技创新团队支持计划（NDTD2010-12）。

Analysis of Genetic Diversity and Phylogeny of the Mitochondrial Cytochrome b Gene of Mongolian Horses and Mongolian Wild Horse

HAI Tang, HUANG Jin-long, ZHAO Yi-ping, HAN Hai-ge, SA Ru-la, MANG Lai

(College of Animal Science,Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot 010018, China)

Received:2013-11-22 Online:2014-06-20 Published:2014-07-24

摘要/Abstract

摘要： 通过对马的线粒体细胞色素b（Cytb）基因序列的遗传变异分析，来探讨蒙古家马、蒙古野马和驴之间的亲缘关系和遗传多样性。对各类马和驴样本 mtDNA Cytb 基因进行PCR扩增和测序，运用现代分子生物学软件进行数据处理。结果共检测到15个单倍型，90个突变位点，单倍型多样性（Hd）为0.9356,核苷酸多样性（Pi）为0.01022,平均核苷酸差异数（K）为8.966，各群体间的遗传多样性相差不大。系统发育树和NETwork图中每一分支都至少包含2个群体的信息。4个类型蒙古家马总体上具有较高的遗传多态性，蒙古家马与蒙古野马之间的亲缘关系较近, 且出现数个分支，蒙古家马分布在各独立的进化支中，说明蒙古家马母系来源非常广泛或经过多次驯化。

关键词:

蒙古家马；蒙古野马；细胞色素bmso-bidi-font-family: 宋体">基因；遗传多样性；系统进化

Abstract: Genetic relationship and genetic diversity among Mongolian horses, Mongolian wild horse and donkeys were investigated by genetic variation analysis of the mitochondrial cytochrome b (Cytb) gene sequence. mtDNA Cytb gene of all samples were detected by PCR amplification and then sequenced. The date was analyzed by modern molecular biology software and the analysis showed that 90 polymorphic loci formed 15 haplotypes and the haplotype diversity (Hd), nucleotide diversity (Pi) and average number of nucleotide differences(K) were 0.9356, 0.01022 and 8.966, respectively. Genetic differences between the groups were not obvious. By construction of phylogenetic tree and NETwork, the results indicated that genetic diversity of 4 kinds of Mongolia horse were higher, Mongolian horse and Mongolian wild horse had close relationship and appeared several branches, which explained that Mongolian horses originated multiply or had been domesticated many times.

Key words:

Mongolian horses; Mongolian wild horse; Cytb gene; genetic diversity; phylogenetic relationship

海棠，黄金龙，赵一萍，韩海格，萨如拉，芒来. 蒙古家马和蒙古野马线粒体细胞色素b基因遗传多样性及系统进化分析[J]. 中国畜牧兽医.

HAI Tang, HUANG Jin-long, ZHAO Yi-ping, HAN Hai-ge, SA Ru-la, MANG Lai. Analysis of Genetic Diversity and Phylogeny of the Mitochondrial Cytochrome b Gene of Mongolian Horses and Mongolian Wild Horse[J]. .

参考文献

1 安丽萍. 东亚部分马群体线粒体Cytb基因序列及分子系统学研究［D］.兰州：甘肃农业大学，2006a.
2 安丽萍，李正先，于景文，等. 从细胞色素b基因序列探讨普氏野马与蒙古马的遗传多样性［J］.甘肃农业大学学报，2006b，5：10～13.
3 李金莲，石有斐，布仁其其格，等．三大不同品种马 mtDNA Cytb 基因的 PCR-RFLP分析［J］.遗传，2006a，28（8）：933～938.
4 李金莲．中国蒙古马遗传多样性和分子系统进化研究［D］．呼和浩特：内蒙古农业大学，2006b.
5 陈建兴，乌尼尔夫，杨丽华，等．以cym基因探讨家马的母系起源［J］．内蒙古农业大学学报，2011，32(4)：1～5.
6 陈建兴.中国蒙古马的遗传多样性与系统发育及起源研究［D］.呼和浩特：内蒙古农业大学，2012.
7 胡德夫，陈金良，曹青．马的进化及普氏野马的重发现（普氏野马及其家族之一）［J］．大自然，2005，2：24～26.
8 徐龙鑫. 中国矮马群体mtDNA Cytb基因遗传多样性与系统进化研究［J］.中国农业科学，2013,46(3)：623～629.
9 徐公瑾，李相烈，李宁，等. 牛线粒体基因的序列分析及进化关系［J］.延边大学农学报，2004,26（3）：153～157.
10 宿兵，王应祥，王岐山．安徽麝线粒体DNA细胞色素b基因全长序列分析［J］．动物学研究，2001，2(3):169～173.
11 常洪. 动物遗传资源学［M］.北京：科学出版社，2009.
12 黄勤华,刘若余. 利用mtDNA细胞色素b分析贵州山羊的系统发育［J］. 中国畜牧兽医, 2010, 37(5): 129～132.
13 彭作刚，何舜平，张耀光. 细胞色素b基因序列变异与东亚錯科鱼类系统发育［J］．自然科学进展，2002,12（6）：596～600.
14 蒙世杰．羚牛细胞色素b基因序列分析和系统进化研究［J］.西北大学学报(自然科学版)，2001，3(4):347～350.
15 Bandelt H J, Forster P, Rohl A. Median joining networks for inferring intraspecific phylogenies［J］. Molecular Biology and Evolution, 1999, 16: 37～38.
16 Cieslak M, Pruvost M, Benecke N, et al. Origin and history of mtDNA lineages in domestic horses[J］.PLoS One,2010, 5(12): e15311.
17 Goto H, Ryder O A, Fisher A R, et al. A massively parallel sequencing approach uncovers ancient origins and high genetic variability of endangered Przewalski’s horses[J］.Genome Biol Evol,2011,3:1096～1106.
18 Lau A N, Peng L, Goto H, et al. Horse domestication and conservation in the endangered Przewalski’s horse inferred from sex chromosomal and autosomal sequences[J］.Mol Biol Evol,2009,26(1):199～208.