贵州地方鸡种的遗传变异研究

中国畜牧兽医

贵州地方鸡种的遗传变异研究

王文涛¹，林家栋²，陈眷华²，张福平²

（1.贵州省清镇市农业局, 贵州清镇 551400;2.贵州大学动物科学学院, 贵州贵阳 550025)

收稿日期:2013-10-18 出版日期:2014-04-20 发布日期:2014-05-27
通讯作者: 张福平（1978—），男，内蒙古人，副教授，研究方向：家禽育种。E-mail:zfu-1010@126.com
作者简介:王文涛(1985—)，男，山西人，硕士，研究方向：动物育种。
基金资助:
贵州省科技攻关项目(黔科合NZ字［2012］3007号)。

Study on Genetic Diversity of Domestic Chicken in Guizhou

WANG Wen-tao¹，LIN Jia-dong²，CHEN Juan-hua²，ZHANG Fu-ping²

(1. Qingzhen Agricultural Bureau, Guizhou Province, Qingzhen 551400, China;2. College of Animal Science, Guizhou University, Guiyang 550025,China)

Received:2013-10-18 Online:2014-04-20 Published:2014-05-27

摘要/Abstract

摘要： 为了研究贵州地方鸡种的遗传多样性与系统进化，试验通过PCR直接测序的方法，测定了6个贵州地方鸡种的90个个体线粒体DNA控制区部分序列，并进行了序列分析。结果表明，DNA控制区序列长度为780 bp，A、G、C、T 4种核苷酸的平均比例分别为26.14%、13.38%、25.98%、34.50%；共发现40个变异位点(不包含种内变异位点)，占分析位点总数的5.13%；共确定30个单倍型，6个群体内单倍型变异度总体为0.914，变化范围为0.506～0.976。6个群体间表现出显著的遗传分化和较高水平的群体遗传多态性。

关键词: 贵州地方鸡种; 线粒体DNA控制区; 遗传多样性

Abstract: PCR and direct sequencing methods were used to analyze the genetic diversity and systematic evolution in Guizhou domestic fowls by determining a 780 bp DNA fragment of control region of mtDNA from 90 individuals of 6 Guizhou domestic chicken breeds. The percentage of nucleotide A, G, C and T were 26.14%，13.38%，25.98% and 34.50%, respectively. There were 40 polymorphic sites accounting for 5.13% of total analyzed sites. The diversity of haplotypes in 6 Guizhou domestic chicken breeds was ranged from 0.506 to 0.976, which showed significant genetic differentiation and higher levels of population genetic polymorphism.

Key words: Guizhou domestic chicken breeds; mtDNA D-loop; genetic diversity

王文涛，林家栋，陈眷华，张福平. 贵州地方鸡种的遗传变异研究[J]. 中国畜牧兽医.

WANG Wen-tao，LIN Jia-dong，CHEN Juan-hua，ZHANG Fu-ping. Study on Genetic Diversity of Domestic Chicken in Guizhou[J]. .

参考文献

1 王文涛，陈彬，傅筑荫，等.贵州地方鸡种资源的现状、存在问题及对策［J］.贵州农业科学，2010,38(8):155～157.
2 王文涛,陈彬,阳光远，等. 百宜黑鸡与兴义矮脚鸡线粒体DNA控制区遗传多样性分析［J］. 中国畜牧兽医, 2011, 38(6): 126～128.
3 包文斌,陈国宏,张红霞,等.中国家鸡和红色原鸡mtDNA控制区遗传多态性及系统进化分析［J］.畜牧兽医学报,2008,39(11):1449～1459.
4 李吉均,文世宣,张青松,等.青藏高原隆起的时代、幅度和形式的探讨［J］.中国科学，1979(6):608～616.
5 刘益平,曾凡同,张思婉,等.几种山地乌骨鸡线粒体DNA序列多态性分析［A］.第十一次全国家禽学术讨论会论文集［C］.2003.
6 刘益平,朱庆,曾凡同,等.原鸡线粒体DNA部分序列多态性分析［J］.畜牧兽医学报,2004,35(2):134～140.
7 阳光远,杨忠诚,张小林,等.百宜黑鸡蛋壳质量性状分析［J］.贵州农业科学,2009,37(10):130～131.
8 黄族豪,刘迺发,龙进,等.从线粒体DNA控制区基因比较石鸡和大石鸡的遗传变异［J］.江西农业大学学报,2006,28(3):420～424.
9 黄族豪,张姣,刘迺发,等.两种竹鸡线粒体DNA的遗传变异［J］.动物学杂志,2008,43(1):21～25.
10 傅筑荫.贵州兴义矮脚鸡及应用前景［J］.中国家禽，2000,22(9):35～36.
11 潘周雄,张福平,曹娟,等.贵州长顺绿壳蛋鸡简介［J］.中国家禽,2008,30(4):53～54.
12 David O F, Sklbins K L, Zouros S E, et al. Mitochondrial DNA inheritance［J］.Nature, 1994,368(6474):817～818.
13 Randi E, Lucchini V.Organization and evolution of the mitochondrial DNA control region in the avian genus Alectoris［J］. J Mol Evol,1998，47(4)：449～462.
14 Rozas J, Rozas R. DnaSP version 3：An integrated program for molecular population genetics and molecular evolution analysis［J］. Bioinformatics,1999,15:174～175.
15 Tamura K, Dudley J, Nei M, et al.MEGA4：Molecular evolutionary genetics analysis (MEGA) software version 4.0 ［J］.Mol Boil Evol,2007,24（8）:1596～1599.