鲤鱼γ-2β干扰素基因组DNA克隆及序列分析

›› 2013, Vol. 40 ›› Issue (3): 54-58.

鲤鱼γ-2β干扰素基因组DNA克隆及序列分析

陈义龙¹, 孙真¹, 贾生美¹, 冯祥汝¹, 王文东², 张俊辉¹, 杨振国¹, 卢强¹

1. 吉林大学人兽共患病研究所,吉林长春 130062;
2. 吉林大学畜牧兽医学院,吉林长春 130062

收稿日期:2012-11-28 出版日期:2013-03-20 发布日期:2013-03-19
通讯作者: 卢强(1970-),男,硕士生导师,教授,主要从事人兽共患病毒病与分子免疫学研究。E-mail:qlu@jlu.edu.cn E-mail:qlu@jlu.edu.cn
作者简介:陈义龙(1987-),男,吉林人,硕士生,研究方向:兽医公共卫生。
基金资助:
国家自然科学基金项目(30972277);吉林大学基本科研业务费项目(200903250)。

Cloning and Sequence Analysis of Interferon γ-2β (IFN γ-2β) Genomic DNA in Common Carp (Cyprinus carpio L.)

CHEN Yi-long¹, SUN Zhen¹, JIA Sheng-mei¹, FENG Xiang-ru¹, WANG Wen-dong², ZHANG Jun-hui¹, YANG Zhen-guo¹, LU Qiang¹

1. Institute of Zoonoses, Jilin University, Changchun 130062, China;
2. College of Animal Science and Veterinary Medicine, Jilin University, Changchun 130062, China

Received:2012-11-28 Online:2013-03-20 Published:2013-03-19

摘要/Abstract

摘要： 试验参考鲤鱼γ-2β干扰素(interferon γ-2β,IFNγ-2β)全长cDNA序列,在其两侧非翻译区和外显子设计2对引物,以提取的鲤鱼脾脏基因组DNA为模板进行PCR扩增,获得了IFNγ-2β的全长基因DNA序列。结果表明,获得的基因组DNA全长2084 bp,GenBank登录号为JX181981,序列分析结果显示该基因进化较保守,和其他物种一样都含有4个外显子和3个内含子,各外显子碱基数与哺乳动物中相对应的外显子碱基数基本相同,且外显子、内含子剪接位点均遵守GT-AG规则。

关键词: 鲤鱼; 干扰素γ-2β; 克隆; 序列分析

Abstract: The research aimed to carry out the cloning, identification and sequence analysis of genomic DNA of carp interferon γ-2β (IFNγ-2β). On the basis of the full-length cDNA of carp, we designed two pairs of primers in its bilateral untranslated regions and the exons to perform PCR that used the carp spleen genomic DNA as the template, the IFNγ-2β full-length genomic DNA sequence was obtained. The full-length genomic DNA was 2084 bp, the GenBank accession number was JX181981, the gene sequence analysis showed the evolution of conservative and contained 4 exons and 3 introns were like most of the other species, the number of bases of each exon closed to the mammalian exons correspondingly. The exon and intron splice sites were complied with GT-AG rules.

Key words: common carp; interferon γ-2β; cloning; sequence analysis

中图分类号:

Q785

陈义龙, 孙真, 贾生美, 冯祥汝, 王文东, 张俊辉, 杨振国, 卢强. 鲤鱼γ-2β干扰素基因组DNA克隆及序列分析[J]. , 2013, 40(3): 54-58.

CHEN Yi-long, SUN Zhen, JIA Sheng-mei, FENG Xiang-ru, WANG Wen-dong, ZHANG Jun-hui, YANG Zhen-guo, LU Qiang. Cloning and Sequence Analysis of Interferon γ-2β (IFN γ-2β) Genomic DNA in Common Carp (Cyprinus carpio L.)[J]. , 2013, 40(3): 54-58.

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