牛Myf5基因克隆及蛋白质生物学特性分析

›› 2013, Vol. 40 ›› Issue (3): 50-53.

牛Myf5基因克隆及蛋白质生物学特性分析

杜连群¹, 张燕欣², 聂永伟², 任汉林¹

1. 军事医学科学院卫生学环境医学研究所,天津 300050;
2. 天津农学院动物科学系,天津 300384

收稿日期:2012-08-14 出版日期:2013-03-20 发布日期:2013-03-19
通讯作者: 任汉林(1972-),男,江苏人,学士,研究方向:动物学。E-mail:rhlkjc@sina.com E-mail:rhlkjc@sina.com
作者简介:杜连群(1984-),男,天津人,学士,研究方向:实验动物学。

Molecular Cloning of Myf5 Gene and Biological Properties Analysis of Protein

DU Lian-qun¹, ZHANG Yan-xin², NIE Yong-wei², REN Han-lin¹

1. Institute of Hygiene and Environmental Medicine Academy of Military Medical Science, Tianjin 300050, China;
2. Department of Animal Science, Tianjin Agricultural University, Tianjin 300384, China

Received:2012-08-14 Online:2013-03-20 Published:2013-03-19

摘要/Abstract

摘要： 本试验旨在扩增牛Myf5基因,并对其蛋白质生物学特性进行分析。根据GenBank中已公布的牛Myf5基因序列设计1对引物,利用RT-PCR方法从牛背腰最长肌组织扩增牛Myf5基因,连接PUCm-T载体,进行酶切和测序鉴定,同时利用在线工具对牛Myf5蛋白的基本性质、二级结构和磷酸化位点进行预测。获得的牛Myf5基因编码区序列长度为768 bp,编码255个氨基酸。蛋白质生物学特性分析结果表明,Myf5具有该家族基因典型的碱性螺旋—环—螺旋结构域,氨基酸组成上丝氨酸(Ser)含量最高,其磷酸化位点分别位于丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)和酪氨酸(Tyr)残基上。

关键词: Myf5基因; 克隆; 蛋白质结构; 磷酸化位点

Abstract: The aim of this paper was to amplify bovine Myf5 gene, and analyzed the protein biological characteristics. A pair of primers were designed according to bovine Myf5 gene sequences published in GenBank.Myf5 gene was amplified by RT-PCR from bovine back waist longest muscle, then linked to PUCm-T vector, restriction digested and sequenced. At the same time, we predicted the basic properties, the secondary structure and phosphorylated sites of Myf5 protein by the online tools. Having amplified coding areas sequence was 768 bp in length, encoded 255 amino acids. Protein biological characteristics analysis showed that Myf5 had the family genes typical basic helix-loop-helix domain. Serine(Ser) content was the highest in amino acid composition, and the phosphorylation site located in serine(Ser),threonine(Thr) and tyrosine(Tyr) residue.

Key words: Myf5 gene; clone; protein structure; phosphorylation site

中图分类号:

杜连群, 张燕欣, 聂永伟, 任汉林. 牛Myf5基因克隆及蛋白质生物学特性分析[J]. , 2013, 40(3): 50-53.

DU Lian-qun, ZHANG Yan-xin, NIE Yong-wei, REN Han-lin. Molecular Cloning of Myf5 Gene and Biological Properties Analysis of Protein[J]. , 2013, 40(3): 50-53.

参考文献

1 韦宏伟,徐刚毅,汪代华,等. Myf5基因多态性与山羊生长性状相关分析[J].中国畜牧杂志,2011,47(7):15～17.
2 孙文浩,朱庆. 生肌决定因子Myf5基因的研究进展[J].黑龙江畜牧兽医,2008(7):28～31.
3 朱砺,李学伟. MyoD基因在不同猪种中的PCR-RFLP遗传多态性及其遗传效应研究[J].畜牧兽医学报,2005,36(8):761～766.
4 严婷婷,邵芳,王野,等. 赤眼鳟Myf5基因的克隆、序列和表达分析[J].常熟理工学院学报,2011,8,25(8):71～74.
5 杨明娟,陈宏. 牛MRFs基因家族研究进展[J].中国牛业科学,2010,36(6):51～55.
6 苏艳红,王瑞元,周越. 运动与生肌调节因子研究进展[J].中国运动医学杂志,2007,26(6):770～773.
7 陈玉红,钟金城,马志杰,等. 大额牛Myf5基因克隆、序列分析及其分子系统进化研究[J].畜牧兽医学报,2007,38(12):1279～1289.
8 钟茂春,郑光明,赵建,等. 鲮Myf5基因克隆及其SNPs分析[J].中国水产科学,2010, 17(4):681～687.
9 焦传珍. 家犬IGF2BP2基因生物信息学分析[J].广东农业科学,2009,10:151～153.
10 褚敏,阎萍,梁春年,等. 大通牦牛MyoD1基因3'UTR SNPs多态性及其与生长性状相关性的研究[J].中国畜牧兽医, 2012, 39(2): 111～113.
11 Braun T,Rudnicki M A,Arnold H H,et al. Targeted inactivation of the mouse regulatory gene Myf5 results in abnormal distal rib development and early postnatal death in homozygous mouse mutants[J].Cell,1992,71(3):369～382.
12 Brown T, Bober E, Rudnicki M A, et al. MyoD expression marks the onset of skeletal myogenesis in homozygous Myf5 mutant mice[J].Development,1994,120:3083～3092.
13 Harada A, Okada S, Odawara J, et al. Production of a rat monoclonal antibody specific for Myf5[J]. Hybridoma,2010,29(1):59～62.
14 Hasty P, Bradley A, Morris J H, et al. Muscle deficiency and neonatal death in mice with a targeted mutation in them Myogenin gene[J]. Nature,1993,364:501～506.
15 Kassar-Duchossoy L, Gayraud-Morel B, et al. Mrf4 determines skeletal muscle identity in Myf5: MyoD double mutant mice[J].Nature,2004,431:466～471.
16 Weinberg E S, Allende M L, et al. Developmental regulation of zebrafish MyoD in wild-type, no tail and spadetail embryos[J].Development, 1996,122(1):271～280.

[1]	焦琳琳, 成玉婷, 吴庆国, 吴双, 吴植, 朱善元, 钱莺娟. 鸭坦布苏病毒Capsid蛋白原核表达及多克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(6): 2395-2402.
[2]	欧云文, 潘琴, 汪洋, 代军飞, 任绍科, 张洋, 张杰. 猪细小病毒6型ORF2基因的截短表达及多克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(6): 2487-2495.
[3]	刘佳隆, 张译文, 张悦然, 孙奇娟, 陈建, 何雷, 贾艳艳, 丁轲, 余祖华. 鸡ELAVL1基因克隆、原核表达及生物信息学分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(5): 1807-1817.
[4]	王雪平, 张孝俊, 李晓月, 王国栋, 张福良, 宋玉伟, 张明亮, 马磊. 高致病性禽腺病毒血清4型Hexon蛋白的原核表达及多克隆抗体的制备[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(5): 2053-2060.
[5]	范冰峰, 李文, 刘理想, 赵向远, 邵静, 林乐丰, 孙慧敏, 张旭林, 许保增. 水貂AANAT基因克隆及生物信息学分析[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1307-1318.
[6]	刘红润, 朱思燃, 奉玲丽, 张坤, 颜港, 王钰滨, 张帅, 江山, 许迪, 兰干球, 梁晶. 大白猪CDO1基因克隆、生物信息学分析及组织表达定位[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1352-1363.
[7]	胡乐玉, 胡欣瑶, 李颖, 赵盛淼, 沈凤臻, 王长法, 李亮亮, 王彤彤, 任慧英. 德州驴HO-1基因生物信息学分析及多克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1499-1510.
[8]	王文婕, 茹鹏辉, 郁川, 杜付熙, 陈松彪, 尚珂, 张春杰, 程相朝. 猫细小病毒洛阳分离株VP2蛋白原核表达及多克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(4): 1511-1521.
[9]	张永杰, 隋志远, 张志帅, 王晨光, 李孝君, 邢凤. 多浪羊NPTX1基因克隆、生物信息学分析及在初情期的表达研究[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(3): 1048-1058.
[10]	牛小杰, 徐明国, 肖莉, 刘文豪, 陈创夫, 王勇. 鸡白痢沙门氏菌IPAJ蛋白的表达纯化、多克隆抗体制备及ELISA方法的建立[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(3): 1218-1228.
[11]	侯浩宇, 郑南南, 吴宏举, 陈寅龙, 李潮, 张昂克, 姬鹏超, 万博, 杜永坤, 张改平. 非洲猪瘟病毒p30蛋白单克隆抗体制备和鉴定[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(3): 1241-1249.
[12]	韦义荣, 郑自华, 张叁保, 宋颖, 蒋海玉, 孙雯玥, 程鹏飞, 刘雨帆, 邹剑伟, 黄艳娜, 潘艳, 蒋钦杨. 努比亚山羊UCP1基因克隆、生物信息学分析及组织表达研究[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(2): 440-450.
[13]	吕双飞, 马勋, 王静, 孔翠莲, 寇丽君, 刘彩霞, 史唯地, 康立超, 任慧杰. 炭疽芽孢杆菌PA-LF1融合蛋白的原核表达及其反应原性研究[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(2): 674-683.
[14]	张梦杨, 何健, 刘阳坤, 姚伦广. 非洲猪瘟病毒p37蛋白生物信息学分析及其多克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(1): 300-309.
[15]	朱丽霖, 王后坤, 陈雪阳, 刘晶, 梁雄燕, 方春, 杨玉莹. 鸡IFIT5对J亚群禽白血病病毒在DF-1细胞内复制的影响[J]. 中国畜牧兽医, 2023, 50(1): 310-316.