犬瘟热病毒贵州株(CDV-GZ1)F基因的克隆及序列分析

›› 2012, Vol. 39 ›› Issue (6): 53-56.

犬瘟热病毒贵州株(CDV-GZ1)F基因的克隆及序列分析

曾智勇^1,2, 周莉¹, 刘志杰¹

1. 贵州大学动物科学学院,贵州贵阳 550025;
2. 贵州省动物疫病研究室,贵州贵阳 550025

收稿日期:2011-12-20 出版日期:2012-06-20 发布日期:2012-07-02
作者简介:曾智勇(1978－),男,四川人,副教授,博士,硕士生导师,从事动物传染病及病原分子生物学研究。
基金资助:
贵州大学博士基金"犬瘟热病毒贵州株的分离鉴定及主要抗原蛋白编码基因的研究"(X060054)。

Cloning and Sequence Analysis of Fusion Protein Gene of Canine Distemper Virus Isolated from Guizhou

ZENG Zhi-yong^1,2, ZHOU Li¹, LIU Zhi-jie¹

1. College of Animal Science,Guizhou University,Guiyang 550025,China;
2. Laboratory for Animal Epidemic Disease of Guizhou,Guiyang 550025,China

Received:2011-12-20 Online:2012-06-20 Published:2012-07-02

摘要/Abstract

摘要： 根据GenBank中发表的犬瘟热病毒Onderstepoort株融合蛋白基因(F)序列设计两对特异性引物,采用RT-PCR扩增犬瘟热病毒贵州分离株(CDV-GZ1)的F基因,并进行克隆与序列分析。结果显示,CDV-GZ1株F基因的ORF全长1989 bp,氨基酸序列中具有5个潜在N-糖基化位点,氨基酸同源性与美国00-2601株和国内HL株较高,分别为91.6%和91.1%,表明该分离株与00-2601株和HL株具有较近的亲缘关系。

关键词: 犬瘟热病毒; CDV-GZ1; F蛋白; 克隆; 序列分析

Abstract: Two pairs of primers were designed and synthesized based on the sequence of the Onderstepoort strain of canine distemper virus reported in GenBank, and the F gene was amplified by reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) from CDV-GZ1 strain. The amplified fragment was cloned and analyzed. The results showed that the length of CDV-GZ1 F gene was 1989 bp. It contained five potential N-glycosylation locations based on the derived amino acid sequences. The homology of coding amino acid between this strain and American 00-2601 and domestic HL strain was 91.6% and 91.1% respectively, it showed that they had common ancestor.

Key words: canine distemper virus; CDV-GZ1; fusion protein; cloning; sequence analysis

中图分类号:

曾智勇, 周莉, 刘志杰. 犬瘟热病毒贵州株(CDV-GZ1)F基因的克隆及序列分析[J]. , 2012, 39(6): 53-56.

ZENG Zhi-yong, ZHOU Li, LIU Zhi-jie. Cloning and Sequence Analysis of Fusion Protein Gene of Canine Distemper Virus Isolated from Guizhou[J]. , 2012, 39(6): 53-56.

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