猫细小病毒CC1株VP1基因克隆与序列分析

›› 2008, Vol. 1 ›› Issue (8): 40-43.

猫细小病毒CC1株VP1基因克隆与序列分析

李爽1,2，袁宝1，肖书奇3，任文陟1，张嘉保1 ，赵志辉2，雍海平1,2

1.吉林大学实验动物中心，长春 130062； 2.吉林大学畜牧兽医学院，长春 130062；3. 中山大学生命科学学院，广州 510275

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2008-08-20 发布日期:2008-08-20

Cloning and Sequencing of VP1 Gene of Feline Parvovirus CC1 Strain

LI Shuang1,2,YUAN Bao1，XIAO Shu-qi3, REN Wen-zhi1，ZHANG Jia-bao1，
ZHAO Zhi-hui2，YONG Hai-ping1,2

1.Laboratory Animal Center of Jilin University, Changchun 130062, China; 2.College of Animal Science and Veterinary Medicine, Jilin University, Changchun 130062, China; 3.College of Life Science,Zhongshan University, Guangzhou 510275,China

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2008-08-20 Published:2008-08-20

摘要/Abstract

摘要： 根据GenBank登录的猫细小病毒(CU-4)VP1基因序列，设计了1对引物，用PCR技术对VP1基因进行整体扩增，将扩增产物纯化后克隆入PGM-T载体，通过酶切、PCR和测序进行验证。结果表明，测序拼接得出VP1基因的序列长度约为2306 bp，该基因的ORF总长为2184 bp，编码727个氨基酸，应用DNAStar软件把所测得的序列与国内外代表性毒株的VP1基因编码区全长核苷酸序列和氨基酸序列进行比对分析，发现CC-1株与国内XJ-1株的核苷酸和氨基酸同源性均为99.3%。

关键词: 猫细小病毒; VP1基因; 序列分析

Abstract: To analyze the sequence of VP1 gene of Feline parvovirus CC1 strain and compare with that of representative virus strain. According to the reported complete nucleotide sequence of FPV(CU-4) in GenBank ,a pair of primers were designed and synthesized.VP1 gene of isolate was amplified.The products of PCR were cloned into PGM-T vector.the positive clone was identified bu enzyme cutting,PCR and sequencing.The whole sequence of VP1gene was analyzed using DNAStar software.The results indicated that the VP1 gene with 2306 bp long had a single opening read frame 2184 bp in length and coded a polypeptide of 727 amino acids.The sequence analysis demonstrated that represent reference strains loaded down from GenBank,the result of ORF sequence analysis indicated that CC-1 strain exhibited 99.3% homology of the nucleotides and amino acid with that of the XJ-1 strain in our county. To analyze the sequence of VP1 full gene,have a significance in clinic and epidemiological study.

Key words: feline parvovirus; VP1 gene; sequencing analysis

中图分类号:

Q785

李爽;袁宝;肖书奇;任文陟;张嘉保;赵志辉;雍海平;. 猫细小病毒CC1株VP1基因克隆与序列分析[J]. , 2008, 1(8): 40-43.

LI Shuang;;YUAN Bao;XIAO Shu-qi;REN Wen-zhi;ZHANG Jia-bao;ZHAO Zhi-hui;YONG Hai-ping;. Cloning and Sequencing of VP1 Gene of Feline Parvovirus CC1 Strain[J]. , 2008, 1(8): 40-43.

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