弓形虫细胞核因子3基因的克隆及序列分析

doi:10.16431/j.cnki.1671-7236.2015.02.005

›› 2015, Vol. 42 ›› Issue (2): 270-274.doi: 10.16431/j.cnki.1671-7236.2015.02.005

弓形虫细胞核因子3基因的克隆及序列分析

胡玲英^1,2, 张念章², 高琦^2,3, 朱兴全², 王寿昆¹

1. 福建农林大学动物科学学院, 福建省动物药物工程实验室, 福州 350002;
2. 中国农业科学院兰州兽医研究所, 家畜疫病病原生物学国家重点实验室, 甘肃省动物寄生虫病重点实验室, 兰州 730046;
3. 华南农业大学兽医学院, 广州 510642

收稿日期:2014-09-09 出版日期:2015-02-20 发布日期:2015-02-13
通讯作者: 王寿昆 E-mail:wsk138@163.com
作者简介:胡玲英(1987-),女,江西鄱阳人,硕士生,研究方向:动物病原与分子生物学研究,E-mail:294341219@qq.com
基金资助:
国家自然科学基金项目(31172316);甘肃省创新研究群体计划项目(1210RJIA006);福建省教育厅科技项目(JK2011052);龙岩市科技计划项目(2012LY45)

Cloning and Sequence Analysis of Toxoplasma gondii NF3 Gene

HU Ling-ying^1,2, ZHANG Nian-zhang², GAO Qi^2,3, ZHU Xing-quan², WANG Shou-kun¹

1. Engineering Laboratory of Animal Pharmaceuticals, College of Animal Science, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, China;
2. Key Laboratory of Veterinary Parasitology of Gansu Province, State Key Laboratory of Veterinary Etiological Biology, Lanzhou Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Lanzhou 730046, China;
3. College of Veterinary Medicine, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, China

Received:2014-09-09 Online:2015-02-20 Published:2015-02-13

摘要/Abstract

摘要： 为研究中国特色品系荷包猪SLA-DRa基因(又称SLA-DRa-HB),本试验设计引物,RT-PCR扩增3个个体荷包猪SLA-DRa全基因编码区,并克隆至pMD18-T载体,转化大肠杆菌JM109感受态细胞,经酶切鉴定后筛选阳性克隆测序,比较分析与其他SLA-DRa等位基因的差异,并绘制分子进化树。结果显示,RT-PCR成功扩增出目的基因条带,大小约800 bp。经克隆测序后分析,SLA-DRa-HB基因全长为779 bp,编码区为1-759,共编码252个氨基酸。序列对比分析结果显示,SLA-DRa-HB的特征性变异集中在135、159、202位点。而穿膜区和胞浆功能区(203-252)变异位点为206、248。分子进化树分析显示,SLA-DRa-HB自成一系,且与其他等位基因的进化关系较近。本研究成功克隆荷包猪SLA-DRa基因,为进一步研究其功能奠定基础。

关键词: 弓形虫; 弓形虫细胞核因子3基因; 克隆; 生物信息学分析

Abstract: In order to predict the possibility of Toxoplasma gondii nuclear factor 3 (TgNF3) as anti-Toxoplasma gondii vaccine candidate,TgNF3 gene was amplified by one step RT-PCR using a pair of specific primers.Then the fragments were cloned into the pMD18-T vector.The sequence of TgNF3 gene was then translated into amino acids and analyzed by bioinformatics software.The physical and chemical characteristics,hydrophilic domain,transmembrane domain,epitopes,and advanced structure of TgNF3 were predicted by multiple bioinformatics approaches.The results revealed that TgNF3 gene was approximate 950 bp in length.TgNF3 protein was predicted to contain only one transmembrane domain,9 α-helix regions,4 β-fold regions,8 hydrophilic regions and 10 flexible regions,and predicted to contain 9 linear B cell epitopes.The results indicated that TgNF3 could be a vaccine candidate antigen against Toxoplasma gondii,which provided the basic data for development of novel Toxoplasma gondii vaccines.

Key words: Toxoplasma gondii; Toxoplasma gondii nuclear factor 3 (TgNF3) gene; clone; bioinformatics analysis

中图分类号:

S852.7

胡玲英, 张念章, 高琦, 朱兴全, 王寿昆. 弓形虫细胞核因子3基因的克隆及序列分析[J]. , 2015, 42(2): 270-274.

HU Ling-ying, ZHANG Nian-zhang, GAO Qi, ZHU Xing-quan, WANG Shou-kun. Cloning and Sequence Analysis of Toxoplasma gondii NF3 Gene[J]. China Animal Husbandry & Veterinary Medicine, 2015, 42(2): 270-274.

参考文献

[1] Hill D E,Chirukandoth S,Dubey J P.Biology and epidemiology of Toxoplasma gondii in man and animals[J].Anim Health Res Rev,2005,6(1):41-61.
[2] Dubey J P.Toxoplasmosis of animals and humans[M].Boca Raton:CRC Press,2010.
[3] Gao X J,Zhao Z J,He Z H,et al.Toxoplasma gondii infection in pregnant women in China[J].Parasitology,2012,139(2):139-147.
[4] Sumi M,Aosai F,Norose K,et al.Acute exacerbation of Toxoplasma gondii infection after hematopoietic stem cell transplantation:Five case reports among 279 recipients[J].Int J Hematol,2013,98(2):214-222.
[5] Zhou P,Chen Z,Li H L,et al.Toxoplasma gondii infection in humans in China[J].Parasit Vectors,2011,4(1):165.
[6] Dubey J P.The history of Toxoplasma gondii-The first 100 year[J].Int J Parasitol,2008,55(6):467-475.
[7] Dubey J P.Toxoplasmosis in pigs-The last 20 years[J].Vet Parasitol,2009,164(2-4):89-103.
[8] Zhang N Z,Chen J,Wang M,et al.Vaccines against Toxoplasma gondii:New developments and perspectives[J].Expert Rev Vaccines,2013,12(11):1287-1299.
[9] Olguin-Lamas A,Madec E,Hovasse A,et al.A novel Toxoplasma gondii nuclear factor TgNF3 is a dynamic chromatin-associated component,modulator of nucleolar architecture and parasite virulence[J].PLoS Pathog,2011,7(3):e1001328.
[10] Zhang Y.I-TASSER server for protein 3D structure prediction[J].BMC Bioinformatics,2008,9:40.
[11] Zhang Y.I-TASSER:Fully automated protein structure prediction in CASP8[J].Proteins,2009,77(S9):100-113.
[12] Zhang N Z,Huang S Y,Zhou D H,et al.Identification and bioinformatics analysis of a putative calcium-dependent protein kinase (CDPK6) from Toxoplasma gondii[J].Genet Mol Res,13(4):10669-10677.
[13] Bai Y,He S,Zhao G,et al.Toxoplasma gondii:Bioinformatics analysis,cloning and expression of a novel protein TgIMP1[J].Exp Parasitol,2012,132(4):458-464.
[14] 高琦,张念章,胡玲英,等.弓形虫DOC2基因C-端的克隆及序列分析[J].中国畜牧兽医,2014,41(8):56-60.
[15] 徐颖,张念章,谭启东,等.弓形虫RH株ROP38基因的原核表达及其反应原性研究[J].中国兽医科学,2014,44(1):83-87.
[16] 陈锐钊,张念章,聂子雄,等.弓形虫致密颗粒蛋白14基因的克隆及序列分析[J].中国兽医科学,2013,43(3):238-242.

弓形虫细胞核因子3基因的克隆及序列分析

Cloning and Sequence Analysis of Toxoplasma gondii NF3 Gene

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价

[1]	刘敏, 程淮, 郑珍珍, 张梦思, 张贺伟, 任静强. 犬副流感病毒N蛋白的真核表达及多克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(5): 2287-2294.
[2]	张莹, 陈广振, 刘梅, 李红霞, 俞燕, 贾雪波, 李雯倩, 范建华, 马志禹. 半番鸭NMB基因克隆、生物信息学和组织表达分析[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(4): 1705-1715.
[3]	司维, 谭茜宇, 徐玲芸, 罗廷荣, 李晓宁, 顾金燕. H3N2亚型猪流感病毒HA1蛋白的原核表达及多克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(4): 1739-1749.
[4]	洪嘉俊, 肖金华, 张政, 杨雨婷, 方春, 韩旭. sod基因缺失对单增李斯特菌10403S抗氧化应激作用的影响[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(4): 1776-1783.
[5]	苗书魁, 米晓云, 魏婕, 魏玉荣, 海力且木·买买提依明. G8型牛轮状病毒VP7基因克隆及生物信息学分析[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(4): 1784-1795.
[6]	黄念旎, 黄子珂, 李聪聪, 刘晗, 马诗语, 宋果, 蒋亮, 彭为波, 杨联熙, 黄生强. 九疑山兔FGF10基因克隆、生物信息学及组织表达分析[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(3): 1001-1010.
[7]	艾小楠, 程俐芬, 白璞, 陈正灏, 薛丽娜, 周胜花. 灵丘青背山羊ACSL1基因克隆、生物信息学分析及其在脂肪细胞分化过程中的表达研究[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(2): 499-511.
[8]	王晴, 马瑜锴, 韩若冰, 邢海华, 孙子惠, 李和平. 梅花鹿CSRP3基因克隆、生物信息学分析及其在肌肉组织中的表达分析[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(2): 740-748.
[9]	王小格, 司煊瑛, 闫志伟, 王飞, 尤龙琪, 刘梗, 蔡茂, 梁珺珹, 梁玉秀, 杜永坤, 张改平. 非洲猪瘟病毒p22蛋白单克隆抗体制备及其抗原表位鉴定[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(2): 781-791.
[10]	赵文卿, 薄新文, 普娜, 张玉霞, 陈旭珂, 张艳艳, 孙艳, 齐萌, 王正荣. 细粒棘球绦虫EgBAL蛋白的生物信息学分析及原核表达[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(2): 801-810.
[11]	谢蓓伊庭, 王悦, 孟春花, 钱勇, 张俊, 张建丽, 王慧利, 曹少先, 李隐侠. 湖羊PSMB9基因克隆、序列分析及对成肌细胞增殖的影响[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(1): 1-12.
[12]	韩凤烨, 刘莹, 潘晨帆, 张乾义, 陈小云, 朱真, 印春生, 温永俊, 王凤雪, 杜吉革. 产气荚膜梭菌Alpha毒素突变体的表达及单克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(1): 442-450.
[13]	郭晨云, 宋金星, 王梦翔, 孙俊如, 闫若潜, 谢彩华, 吴亚楠, 张改平. 非洲猪瘟病毒B602L蛋白的原核表达、纯化及多克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(9): 3980-3989.
[14]	程晶, 陈沛霖, 郭禹, 崔锦蔷, 江波, 周林宜, 刘文晓, 李焕荣, 李永清. 牛早幼粒细胞白血病蛋白的原核表达及单克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(9): 4014-4024.
[15]	崔艳艳, 王冠, 郝俊芳, 李志强, 余复昌, 史柯, 席丽, 齐萌. 嗜吞噬细胞无浆体MSP4蛋白的原核表达及其多克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(9): 4036-4042.