宏基因组学及其应用前景

中国畜牧兽医

宏基因组学及其应用前景

斯日古楞¹^，2^，3，特木仑^{2，明亮²，伊丽²，吉日木图²^，3}

1.内蒙古农业大学兽医学院,农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室，内蒙古呼和浩特 010018；2.内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室，内蒙古呼和浩特 010018；3.内蒙古骆驼保护学会，内蒙古呼和浩特 010018

收稿日期:2013-08-15 出版日期:2014-03-20 发布日期:2014-05-15
通讯作者: 吉日木图，男，内蒙古人，博士生导师，教授，从事驼乳及骆驼生物特性研究。E-mail: yeluotuo@imau.edu.cn；Tel：0471-4308200
作者简介:斯日古楞（1979—），女，内蒙古人，博士，讲师，研究方向：动物分子病理学与免疫学。
基金资助:
内蒙古自然科学基金面上项目（2013MS0412）。

Metagenomics and its Application Prospect

Siriguleng Yu¹^{, 2, 3}, Temulun², MING Liang², YI Li², Jirimutu²^{, 3}

(1.Key Laboratory of Clinical Diagnosis and Treatment Technology in Animal Disease, Ministry of Agriculture, College of Veterinary Science, Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot 010018, China; 2. Key Laboratory of Dairy Biotechnology and Engineering, Ministry of Education, Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot 010018, China; 3. Inner Mongolia Camel Protection Association, Hohhot 010018, China)

Received:2013-08-15 Online:2014-03-20 Published:2014-05-15

摘要/Abstract

摘要： 宏基因组学是不依赖人为培养技术，研究环境中全部微小生物遗传物质的总和，在研究胃肠道微生物代谢和开发瘤胃微生物资源中具有广泛的应用。动物胃肠道中存在大量共生微生物群，对宿主的生理功能、物质代谢、健康和疾病状况有重要影响。因此该技术有望解决骆驼等反刍动物代谢研究中诸多热点或难点问题。作者介绍了宏基因组文库构建和筛选流程及Roche454和Illumina高通量测序方法，并展望了宏基因组学的应用前景。

关键词: 宏基因组学; 胃肠道微生物; 应用前景

Abstract: Metagenomics is the study of communities of microbial organisms directly in their natural environments, bypassing the need for isolation and laboratory cultivation of individual species and showing strong vitality in research of the metabolic pathway and exploring the resource of rumen microbiota. There are abundance of symbiotic microbiota in the gastrointestinal tract of animals, and they are deeply associated with the well-being of the host because of affecting normal physiology, metabolism and health, as well as the development of diseases. The application of metagenomics may solve many hot and difficult issues in the research of ruminant metabolism, especially camel metabolism. Therefore, this paper reviews the construction and selection procedures, especially introduced the Roche454 and Illumina high-throughput sequencing methods. Meanwhile, the application prospects of metagenomic in communities of microbial organisms are explored.

斯日古楞，特木仑，明亮，伊丽，吉日木图. 宏基因组学及其应用前景[J]. 中国畜牧兽医.

Siriguleng Yu, Temulun, MING Liang, YI Li, Jirimutu. Metagenomics and its Application Prospect[J]. .

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