鹧鸪线粒体COII、ATPase8和3个tRNA基因序列分析及物种鉴别研究

›› 2008, Vol. 1 ›› Issue (4): 52-56.

鹧鸪线粒体COII、ATPase8和3个tRNA基因序列分析及物种鉴别研究

王静1，宗卉2，刘丑生3，张利平1，范万红2，吴建平1
，杨联1

1.甘肃农业大学动物科学技术学院，兰州 730070；2.深圳检验检疫局，深圳 518000；3.农业部全国畜牧总站畜禽牧草种质资源保存利用中心，北京 100094

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2008-04-20 发布日期:2008-04-20

Speices Ideafication and Sequence Analysis of COⅡ,ATPase8 and There tRNA Genes in Grey Francolin

WANG Jing1,ZONG Hui2,LIU Chou-sheng3.ZHANG Li-ping1,
FAN Wan-hong2,WU Jian-ping1,YANG Lian1

1.Gansu Agricultural University Faculty of Animal Science and Technology,Lanzhou 730070， China;2.Shenzhen Inspection and Quarantine,Shenzhen 518000, China; 3.National Center of Preservation and Utilization of Genetic Resources of Domestic Animals and Forage,National Animal Husbandry and Veterinary Service, Beijing 100094, China

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2008-04-20 Published:2008-04-20

摘要/Abstract

摘要： 线粒体DNA是真核生物核外遗传物质，其结构简单，发生变异的机率相对稳定，被广泛用于系统起源、进化、亲缘关系及物种鉴别的研究中。为了挖掘禽类（源性成分）鉴别的分子生物学数据，探讨线粒体不同基因发育信息及鉴别的可信度和灵敏度。本研究扩增鹧鸪线粒体基因组中COⅡ、ATPase8区域，克隆出1138 bp片段，测序结果分析表明，在所克隆的片
段中，含有COⅠ基因部分序列、tRNA^Ser基因、tRNA^Asp基因、COⅡ基因、tRNA ^Leu基因、ATPase8基因全序列和ATPase6基因部分序列。分析COⅡ、ATPase8和tRNA基因显示其与鹌鹑、鸡、火鸡、鹅、鸵鸟5种禽类的序列均具有较高的同源性，基于它们MEGA3.1构建系统进化树，探讨了它们所含的信息量及在鹧鸪和其它禽类鉴别方面的应用潜力，发现COⅡ比ATPase8和tRNA基因含有更多的鉴别信息。

关键词: 鹧鸪; 线粒体DNA; 克隆; 序列分析; 物种鉴别

Abstract: Mitochondrial DNA is the extra nuclear germ plasm in eukaryotic cell. It is characterized as simple construction, the evolutionary rate kept relatively
constant, which has been widely applied to the study of systematic evolution, relative relationship and species identification. To acquire the molecular data of species and derived material identification, the phylogenetic information ,validity and sensitivity of the genes were analyzed. Usually, Francolin mitochondrial COⅡATPase8 gene sequences were amplified by PCR, 1138 bp fragment were cloned and sequenced including cytochrome oxidase subunitⅠpartial sequence, tRNASer,tRNAAsp, cytochrome oxidase subunitⅡ, tRNALeu, ATPase subunit 8 complete sequence and ATPase subunit 6 partial sequence.We found that these sequences were proved to have good homology with other 5 species of poultry recorded in The NCBI. The molecular phylogenetic trees based on the sequence of COⅡ,ATPase8 and tRNA from Francolin and other poultry were constructed by NJ method using sofeware MEGA3.1 showing that the relationships are consistent with the morphological and taxonomic results. And COⅡhad more phylogenetic information than the others’ .

中图分类号:

Q523+.8

王静;宗卉;刘丑生;张利平;范万红;吴建平;杨联. 鹧鸪线粒体COII、ATPase8和3个tRNA基因序列分析及物种鉴别研究[J]. , 2008, 1(4): 52-56.

WANG Jing;ZONG Hui;LIU Chou-sheng.ZHANG Li-ping;FAN Wan-hong;WU Jian-ping;YANG Lian. Speices Ideafication and Sequence Analysis of COⅡ,ATPase8 and There tRNA Genes in Grey Francolin[J]. China Animal Husbandry & Veterinary Medicine, 2008, 1(4): 52-56.

[1]	李天秀, 李昕鹏, 董新星, 兰国湘, 严达伟, 朱家位. 丽江猪HMOX2基因扩增、序列分析及组织表达研究[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(5): 2219-2231.
[2]	刘敏, 程淮, 郑珍珍, 张梦思, 张贺伟, 任静强. 犬副流感病毒N蛋白的真核表达及多克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(5): 2287-2294.
[3]	周鑫, 杨铖, 朱桂名, 何黔蓉, 李岩, 樊新忠, 宁超, 王丹. 基于最新参考序列UM_NZW_1.0绘制家兔基因组NUMTs图谱[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(4): 1660-1670.
[4]	张莹, 陈广振, 刘梅, 李红霞, 俞燕, 贾雪波, 李雯倩, 范建华, 马志禹. 半番鸭NMB基因克隆、生物信息学和组织表达分析[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(4): 1705-1715.
[5]	司维, 谭茜宇, 徐玲芸, 罗廷荣, 李晓宁, 顾金燕. H3N2亚型猪流感病毒HA1蛋白的原核表达及多克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(4): 1739-1749.
[6]	洪嘉俊, 肖金华, 张政, 杨雨婷, 方春, 韩旭. sod基因缺失对单增李斯特菌10403S抗氧化应激作用的影响[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(4): 1776-1783.
[7]	苗书魁, 米晓云, 魏婕, 魏玉荣, 海力且木·买买提依明. G8型牛轮状病毒VP7基因克隆及生物信息学分析[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(4): 1784-1795.
[8]	黄念旎, 黄子珂, 李聪聪, 刘晗, 马诗语, 宋果, 蒋亮, 彭为波, 杨联熙, 黄生强. 九疑山兔FGF10基因克隆、生物信息学及组织表达分析[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(3): 1001-1010.
[9]	王盼盼, 沙拉玛提·波代, 巴合提·博代, 李振伟, 吾热力哈孜·哈孜汗. 基于D-loop区多态性分析新疆地区7个哈萨克牛群体遗传结构和母系起源[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(3): 1166-1179.
[10]	艾小楠, 程俐芬, 白璞, 陈正灏, 薛丽娜, 周胜花. 灵丘青背山羊ACSL1基因克隆、生物信息学分析及其在脂肪细胞分化过程中的表达研究[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(2): 499-511.
[11]	王晴, 马瑜锴, 韩若冰, 邢海华, 孙子惠, 李和平. 梅花鹿CSRP3基因克隆、生物信息学分析及其在肌肉组织中的表达分析[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(2): 740-748.
[12]	王小格, 司煊瑛, 闫志伟, 王飞, 尤龙琪, 刘梗, 蔡茂, 梁珺珹, 梁玉秀, 杜永坤, 张改平. 非洲猪瘟病毒p22蛋白单克隆抗体制备及其抗原表位鉴定[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(2): 781-791.
[13]	谢蓓伊庭, 王悦, 孟春花, 钱勇, 张俊, 张建丽, 王慧利, 曹少先, 李隐侠. 湖羊PSMB9基因克隆、序列分析及对成肌细胞增殖的影响[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(1): 1-12.
[14]	韩凤烨, 刘莹, 潘晨帆, 张乾义, 陈小云, 朱真, 印春生, 温永俊, 王凤雪, 杜吉革. 产气荚膜梭菌Alpha毒素突变体的表达及单克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2025, 52(1): 442-450.
[15]	郭晨云, 宋金星, 王梦翔, 孙俊如, 闫若潜, 谢彩华, 吴亚楠, 张改平. 非洲猪瘟病毒B602L蛋白的原核表达、纯化及多克隆抗体制备[J]. 中国畜牧兽医, 2024, 51(9): 3980-3989.